将 tfidf 附加到熊猫数据框

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【中文标题】将 tfidf 附加到熊猫数据框【英文标题】:Append tfidf to pandas dataframe 【发布时间】:2018-02-08 05:55:18 【问题描述】:

我有以下熊猫结构:

col1 col2 col3 text
1    1    0    meaningful text
5    9    7    trees
7    8    2    text

我想使用 tfidf 矢量化器对其进行矢量化。然而,这会返回一个解析矩阵,我实际上可以通过mysparsematrix).toarray() 将其变成一个密集矩阵。但是,如何将这些带有标签的信息添加到我的原始 df 中?所以目标看起来像:

col1 col2 col3 meaningful text trees
1    1    0    1          1    0
5    9    7    0          0    1
7    8    2    0          1    0

更新:

即使重命名原始列,解决方案也会导致连接错误: 即使我在开始使用它之前使用fillna(0),删除具有至少一个 NaN 的列也会导致只剩下 7 行。

【问题讨论】:

【参考方案1】:

您可以按照以下方式进行:

将数据加载到数据框中:

import pandas as pd

df = pd.read_table("/tmp/test.csv", sep="\s+")
print(df)

输出:

   col1  col2  col3             text
0     1     1     0  meaningful text
1     5     9     7            trees
2     7     8     2             text

标记text 列使用: sklearn.feature_extraction.text.TfidfVectorizer

from sklearn.feature_extraction.text import TfidfVectorizer

v = TfidfVectorizer()
x = v.fit_transform(df['text'])

将标记化的数据转换为数据框:

df1 = pd.DataFrame(x.toarray(), columns=v.get_feature_names())
print(df1)

输出:

   meaningful      text  trees
0    0.795961  0.605349    0.0
1    0.000000  0.000000    1.0
2    0.000000  1.000000    0.0

将标记化数据帧连接到原始数据帧:

res = pd.concat([df, df1], axis=1)
print(res)

输出:

   col1  col2  col3             text  meaningful      text  trees
0     1     1     0  meaningful text    0.795961  0.605349    0.0
1     5     9     7            trees    0.000000  0.000000    1.0
2     7     8     2             text    0.000000  1.000000    0.0

如果你想删除列text,你需要在连接之前这样做:

df.drop('text', axis=1, inplace=True)
res = pd.concat([df, df1], axis=1)
print(res)

输出:

   col1  col2  col3  meaningful      text  trees
0     1     1     0    0.795961  0.605349    0.0
1     5     9     7    0.000000  0.000000    1.0
2     7     8     2    0.000000  1.000000    0.0

这是完整的代码:

import pandas as pd
from sklearn.feature_extraction.text import TfidfVectorizer

df = pd.read_table("/tmp/test.csv", sep="\s+")
v = TfidfVectorizer()
x = v.fit_transform(df['text'])

df1 = pd.DataFrame(x.toarray(), columns=v.get_feature_names())
df.drop('text', axis=1, inplace=True)
res = pd.concat([df, df1], axis=1)

【讨论】:

这几乎可以工作,但是出了点问题...默认情况下,这会执行外连接,我最终得到 699 行而不是原来的 353 行,有很多 NaN 行...可能出了什么问题? @lte__ 你能分享一个我可以用来重现问题的数据集吗? 不,这是机密数据...我认为文本中的某些单词与标签相同,这会导致外连接行为(就像这里的第一个示例pandas.pydata.org/pandas-docs/stable/… ) @lte__ 我建议您为原始数据中的所有列名称添加前缀,然后进行转换。 (something_col1, something_col2, ..) 我不知道,我们通过另一个问题的解决方法解决了这个问题。但为此,您的解决方案实际上是正确的答案。【参考方案2】:

您可以尝试以下方法 -

import numpy as np 
import pandas as pd 
from sklearn.feature_extraction.text import TfidfVectorizer

# create some data
col1 = np.asarray(np.random.choice(10,size=(10)))
col2 = np.asarray(np.random.choice(10,size=(10)))
col3 = np.asarray(np.random.choice(10,size=(10)))
text = ['Some models allow for specialized',
         'efficient parameter search strategies,',
         'outlined below. Two generic approaches',
         'to sampling search candidates are ',
         'provided in scikit-learn: for given values,',
         'GridSearchCV exhaustively considers all',
         'parameter combinations, while RandomizedSearchCV',
         'can sample a given number of candidates',
         ' from a parameter space with a specified distribution.',
         ' After describing these tools we detail best practice applicable to both approaches.']

# create a dataframe from the the created data
df = pd.DataFrame([col1,col2,col3,text]).T
# set column names
df.columns=['col1','col2','col3','text']

tfidf_vec = TfidfVectorizer()
tfidf_dense = tfidf_vec.fit_transform(df['text']).todense()
new_cols = tfidf_vec.get_feature_names()

# remove the text column as the word 'text' may exist in the words and you'll get an error
df = df.drop('text',axis=1)
# join the tfidf values to the existing dataframe
df = df.join(pd.DataFrame(tfidf_dense, columns=new_cols))

【讨论】:

ValueError: 列重叠但未指定后缀 dftfidf_dense 中是否有同名的列? 我不能确定,因为我在df 中的功能之一是'count',并且'count' 字可能也在tfidf_dense 中。但我能够通过从我的df 中删除索引来解决此错误。感谢您的帮助。【参考方案3】:

我想在接受的答案中添加一些信息。

在连接两个 DataFrame(即 main DataFrame 和 TF-IDF DataFrame)之前,请确保两个 DataFrame 之间的索引相似。例如,您可以使用 df.reset_index(drop=True, inplace=True) 来重置 DataFrame 索引。

否则,您的连接 DataFrame 将包含很多 NaN 行。看了cmets,这大概就是OP经历的吧。

【讨论】:

我遇到了与 lte_ 相同的问题,即行数比预期的多,有很多 NA 值。问题出在索引中。感谢 Glorian 和所有其他人。

以上是关于将 tfidf 附加到熊猫数据框的主要内容,如果未能解决你的问题,请参考以下文章

如何将字典附加到熊猫数据框?

Python:将字典附加到熊猫数据框行

如何将新行附加到熊猫中的数据框?

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将数组列表作为列附加到具有相同列索引的熊猫数据框中

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