将 tfidf 附加到熊猫数据框
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【中文标题】将 tfidf 附加到熊猫数据框【英文标题】:Append tfidf to pandas dataframe 【发布时间】:2018-02-08 05:55:18 【问题描述】:我有以下熊猫结构:
col1 col2 col3 text
1 1 0 meaningful text
5 9 7 trees
7 8 2 text
我想使用 tfidf 矢量化器对其进行矢量化。然而,这会返回一个解析矩阵,我实际上可以通过mysparsematrix).toarray()
将其变成一个密集矩阵。但是,如何将这些带有标签的信息添加到我的原始 df 中?所以目标看起来像:
col1 col2 col3 meaningful text trees
1 1 0 1 1 0
5 9 7 0 0 1
7 8 2 0 1 0
更新:
即使重命名原始列,解决方案也会导致连接错误:
即使我在开始使用它之前使用fillna(0)
,删除具有至少一个 NaN 的列也会导致只剩下 7 行。
【问题讨论】:
【参考方案1】:您可以按照以下方式进行:
将数据加载到数据框中:
import pandas as pd
df = pd.read_table("/tmp/test.csv", sep="\s+")
print(df)
输出:
col1 col2 col3 text
0 1 1 0 meaningful text
1 5 9 7 trees
2 7 8 2 text
标记text
列使用: sklearn.feature_extraction.text.TfidfVectorizer
from sklearn.feature_extraction.text import TfidfVectorizer
v = TfidfVectorizer()
x = v.fit_transform(df['text'])
将标记化的数据转换为数据框:
df1 = pd.DataFrame(x.toarray(), columns=v.get_feature_names())
print(df1)
输出:
meaningful text trees
0 0.795961 0.605349 0.0
1 0.000000 0.000000 1.0
2 0.000000 1.000000 0.0
将标记化数据帧连接到原始数据帧:
res = pd.concat([df, df1], axis=1)
print(res)
输出:
col1 col2 col3 text meaningful text trees
0 1 1 0 meaningful text 0.795961 0.605349 0.0
1 5 9 7 trees 0.000000 0.000000 1.0
2 7 8 2 text 0.000000 1.000000 0.0
如果你想删除列text
,你需要在连接之前这样做:
df.drop('text', axis=1, inplace=True)
res = pd.concat([df, df1], axis=1)
print(res)
输出:
col1 col2 col3 meaningful text trees
0 1 1 0 0.795961 0.605349 0.0
1 5 9 7 0.000000 0.000000 1.0
2 7 8 2 0.000000 1.000000 0.0
这是完整的代码:
import pandas as pd
from sklearn.feature_extraction.text import TfidfVectorizer
df = pd.read_table("/tmp/test.csv", sep="\s+")
v = TfidfVectorizer()
x = v.fit_transform(df['text'])
df1 = pd.DataFrame(x.toarray(), columns=v.get_feature_names())
df.drop('text', axis=1, inplace=True)
res = pd.concat([df, df1], axis=1)
【讨论】:
这几乎可以工作,但是出了点问题...默认情况下,这会执行外连接,我最终得到 699 行而不是原来的 353 行,有很多 NaN 行...可能出了什么问题? @lte__ 你能分享一个我可以用来重现问题的数据集吗? 不,这是机密数据...我认为文本中的某些单词与标签相同,这会导致外连接行为(就像这里的第一个示例pandas.pydata.org/pandas-docs/stable/… ) @lte__ 我建议您为原始数据中的所有列名称添加前缀,然后进行转换。 (something_col1, something_col2, ..) 我不知道,我们通过另一个问题的解决方法解决了这个问题。但为此,您的解决方案实际上是正确的答案。【参考方案2】:您可以尝试以下方法 -
import numpy as np
import pandas as pd
from sklearn.feature_extraction.text import TfidfVectorizer
# create some data
col1 = np.asarray(np.random.choice(10,size=(10)))
col2 = np.asarray(np.random.choice(10,size=(10)))
col3 = np.asarray(np.random.choice(10,size=(10)))
text = ['Some models allow for specialized',
'efficient parameter search strategies,',
'outlined below. Two generic approaches',
'to sampling search candidates are ',
'provided in scikit-learn: for given values,',
'GridSearchCV exhaustively considers all',
'parameter combinations, while RandomizedSearchCV',
'can sample a given number of candidates',
' from a parameter space with a specified distribution.',
' After describing these tools we detail best practice applicable to both approaches.']
# create a dataframe from the the created data
df = pd.DataFrame([col1,col2,col3,text]).T
# set column names
df.columns=['col1','col2','col3','text']
tfidf_vec = TfidfVectorizer()
tfidf_dense = tfidf_vec.fit_transform(df['text']).todense()
new_cols = tfidf_vec.get_feature_names()
# remove the text column as the word 'text' may exist in the words and you'll get an error
df = df.drop('text',axis=1)
# join the tfidf values to the existing dataframe
df = df.join(pd.DataFrame(tfidf_dense, columns=new_cols))
【讨论】:
ValueError: 列重叠但未指定后缀df
和 tfidf_dense
中是否有同名的列?
我不能确定,因为我在df
中的功能之一是'count'
,并且'count'
字可能也在tfidf_dense
中。但我能够通过从我的df
中删除索引来解决此错误。感谢您的帮助。【参考方案3】:
我想在接受的答案中添加一些信息。
在连接两个 DataFrame(即 main DataFrame 和 TF-IDF DataFrame)之前,请确保两个 DataFrame 之间的索引相似。例如,您可以使用 df.reset_index(drop=True, inplace=True) 来重置 DataFrame 索引。
否则,您的连接 DataFrame 将包含很多 NaN 行。看了cmets,这大概就是OP经历的吧。
【讨论】:
我遇到了与 lte_ 相同的问题,即行数比预期的多,有很多 NA 值。问题出在索引中。感谢 Glorian 和所有其他人。以上是关于将 tfidf 附加到熊猫数据框的主要内容,如果未能解决你的问题,请参考以下文章