将所有数据框列转换为浮动的最快方法 - pandas astype 慢
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【中文标题】将所有数据框列转换为浮动的最快方法 - pandas astype 慢【英文标题】:Fastest way to cast all dataframe columns to float - pandas astype slow 【发布时间】:2017-07-26 11:55:51 【问题描述】:有没有更快的方法将 pandas 数据框的所有列转换为单一类型?这似乎特别慢:
df = df.apply(lambda x: x.astype(np.float64), axis=1)
由于numpy.ndarray.astype
的内存分配开销,我怀疑我无能为力。
我也尝试过pd.to_numeric
,但它任意选择将我的一些列转换为int
类型。
【问题讨论】:
【参考方案1】:不需要apply
,直接使用DataFrame.astype
即可。
df.astype(np.float64)
apply
-ing 也会给你带来非常糟糕的性能打击。
示例
df = pd.DataFrame(np.arange(10**7).reshape(10**4, 10**3))
%timeit df.astype(np.float64)
1 loop, best of 3: 288 ms per loop
%timeit df.apply(lambda x: x.astype(np.float64), axis=0)
1 loop, best of 3: 748 ms per loop
%timeit df.apply(lambda x: x.astype(np.float64), axis=1)
1 loop, best of 3: 2.95 s per loop
【讨论】:
【参考方案2】:一种有效的方法是使用数组数据并将其转换回数据帧,就像这样 -
pd.DataFrame(df.values.astype(np.float64))
运行时测试-
In [144]: df = pd.DataFrame(np.random.randint(11,99,(5000,5000)))
In [145]: %timeit df.astype(np.float64) # @Mitch's soln
10 loops, best of 3: 121 ms per loop
In [146]: %timeit pd.DataFrame(df.values.astype(np.float64))
10 loops, best of 3: 42.5 ms per loop
转换回数据框并没有那么昂贵 -
In [147]: %timeit df.values.astype(np.float64)
10 loops, best of 3: 42.3 ms per loop # Casting to dataframe costed 0.2ms
【讨论】:
速度更快,但会破坏列名。当设置列名时,它需要与df.astype(np.float64)
相似的时间。 +1 对于我的应用程序,我不需要所有列名,所以我部分设置了我需要的列名,这带来了巨大的性能提升!以上是关于将所有数据框列转换为浮动的最快方法 - pandas astype 慢的主要内容,如果未能解决你的问题,请参考以下文章