Mac 上的 h5py setup.py：找不到 hdf5.h 文件

Posted 2023-03-11

【中文标题】Mac 上的 h5py setup.py：找不到 hdf5.h 文件

【英文标题】：h5py setup.py on Mac: hdf5.h file not found

【发布时间】：2015-08-30 12:23:32

【问题描述】：

我正在 Mac 上构建 h5py，遵循此链接中的“针对并行 HDF5 构建”的说明：http://docs.h5py.org/en/latest/build.html

$ export CC=mpicc
$ python setup.py configure --mpi
$ sudo python setup.py build

我收到此错误：

h5py-2.5.0/h5py/api_compat.h:27:10: fatal error: 'hdf5.h' file not found

我该怎么办？如果我需要安装一些开发版的 HDF5，我该如何在 Mac 上安装？

【参考方案1】：

我昨天收到了同样的错误消息，进行了 HDF5 的常规安装（不是针对并行构建）。我可以通过使用Homebrew（可以在此处找到的 OS X 包管理器：http://brew.sh/）来解决它。

一旦你安装了Homebrew（如果你还没有），命令就是brew install hdf5。

【讨论】：

我必须执行的命令最终变成了brew install homebrew/science/hdf5

有些事情在 6 年内发生了变化。刚刚收到以下错误消息：Error: homebrew/science was deprecated. This tap is now empty and all its contents were either deleted or migrated.

【参考方案2】：

你可以在你的 Unix 中找到 hdf5.h lib 并在 CPATH 变量中设置

freebsd 11 示例：

>> find /usr -iname "*hdf5.h*"  
<< /usr/local/include/hdf5.h
>> export CPATH="/usr/local/include/"

然后你就可以编译你需要的了

【讨论】：

不鼓励仅使用代码的答案；你介意解释一下你在做什么，以便未来的读者更容易理解吗？