R ggplot2 - 简单绘图 - 无法指定对数轴限制
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【中文标题】R ggplot2 - 简单绘图 - 无法指定对数轴限制【英文标题】:R ggplot2 - Simple plot- cannot specify log axis limits 【发布时间】:2012-09-09 20:37:31 【问题描述】:我正在尝试在 ggplot2 中的 R 中创建一个简单的密度图。这是我的代码,效果很好。
d <- ggplot(result, aes(x=result$baseMeanA))
d + geom_density(colour="darkgreen", size=2, fill="darkgreen") +
scale_x_log10() + scale_y_continuous(limits = c(0, 0.45))
问题是我无法将 x 轴调整为负数。
scale_x_log10(limits= c(1, 10000))
效果很好,但是
scale_x_log10(limits= c(-1, 10000))
根本不工作!它给了我这个错误:
if (zero_range(range)) 中的错误:需要 TRUE/FALSE 的缺失值
请帮忙!
【问题讨论】:
只是猜测,但也许您希望原始比例的限制从 0.1 变为 10000(即 log10(x) 从 -1 变为 5)?大概您不希望 log10(x) 从 -1 变为 10000,因为上限将是 10^10000(一个 非常 大的值,因为大约有 10^80 个原子在可观察的宇宙中en.wikipedia.org/wiki/Observable_universe ...)如果我是对的,那么你想要scale_x_log10(limits=c(0.1,1e5))
是的,我想我现在明白了。我不能在对数刻度中使用负数。谢谢。我现在知道我需要做什么了,我需要在结果中添加一个像 1 或 0.1 这样的伪数,这样它在视觉上看起来是正确的,否则我会以某种方式丢失所有非常小的数字。
【参考方案1】:
e^y 不能为负数。指数常数 e 是正数,而 y 只是一个指数。根据数学定义:
log(x) = y x = e^y
这正是为什么如果 x 为负数,R 无法计算 log(x) 的原因。它只是违反数学定义。
我希望这有助于理解为什么这个情节给你带来了麻烦。
【讨论】:
【参考方案2】:如果限制的范围应部分低于零,您可以对变量进行 log10 转换并指定连续刻度的限制:
ggplot(result, aes(x=log10(baseMeanA))) +
geom_density(colour="darkgreen", size=2, fill="darkgreen") +
scale_x_continuous(limits = c(-1, 10000) +
scale_y_continuous(limits = c(0, 0.45)) +
【讨论】:
【参考方案3】:您尝试做的事情没有多大意义,不是吗?负数的对数不是我们可以在 R 中表示的东西
R> log(-1)
[1] NaN
Warning message:
In log(-1) : NaNs produced
那么R应该把轴画到哪里呢?
【讨论】:
是的,你可能是对的。我不知道。我想我现在知道要解决我的问题,我需要在结果中添加一个伪数,以便我可以直观地查看它。以上是关于R ggplot2 - 简单绘图 - 无法指定对数轴限制的主要内容,如果未能解决你的问题,请参考以下文章
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