在 Rmarkdown/knit 中隐藏 R 代码并仅显示结果

Posted 2023-02-26

【中文标题】在 Rmarkdown/knit 中隐藏 R 代码并仅显示结果

【英文标题】：Hiding the R code in Rmarkdown/knit and just showing the results

【发布时间】：2012-10-16 23:11:19

【问题描述】：

在我的 R Markdown 文档中，有时我只想生成一个报告而不显示实际代码（特别是当我将它发送给我的老板时）。如何隐藏 R 代码并只显示图形和结果？

例如：

---
output: html_document
---

```r fig.width=16, fig.height=6
plot(cars)
```

这显示了命令和情节。如何从我的 HTML 报告中删除命令？

【参考方案1】：

没问题

```r someVar, echo=FALSE
someVariable
```

显示一些（先前计算的）变量someVariable。或者运行打印 etc pp 的代码。

所以对于绘图，我有例如

### Impact of choice of ....
```r somePlot, echo=FALSE
plotResults(Res, Grid, "some text", "some more text")
```

绘图函数plotResults 来自本地包。

【讨论】：

或将opts_chunk$set(echo=FALSE) 放在文档头部的代码块中以全局设置

确保不要回显 opts_chunk 命令！将r echo=FALSE opts_chunk$set(echo=FALSE) 放在文档顶部（在代码块中）应该可以解决所有问题

【参考方案2】：

知道您可以使用它可能对您也很有趣：

r echo=FALSE, results='hide',message=FALSE
a<-as.numeric(rnorm(100))
hist(a, breaks=24)

排除您给出的所有命令，它吐出的所有结果以及 R 吐出的所有消息信息（例如，在 library(ggplot) 或其他东西之后）

【参考方案3】：

只是汇总答案并扩展基础知识。以下是三个选项：

1) 隐藏代码（单个块）

我们可以在块头中包含echo=FALSE：

```r echo=FALSE
plot(cars)
```

2) 隐藏块（全局）。

我们可以使用knitr::opts_chunk$set 函数更改knitr 的默认行为。我们在文档的开头调用它并在块头中包含include=FALSE 以抑制任何输出：

---
output: html_document
---

```r include = FALSE
knitr::opts_chunk$set(echo=FALSE)
```

```r
plot(cars)
```

3) 折叠的代码块

对于 HTML 输出，我们可以使用代码折叠来隐藏输出文件中的代码。它仍将包含代码，但只有在用户单击此代码后才能看到。您可以进一步阅读此内容here。

---
output:
  html_document:
    code_folding: "hide"
---


```r
plot(cars)
```

【讨论】：

我可以在使用序言中的选项编织成 PDF 时排除打印代码吗？ knitr::opts_chunk$set(echo=FALSE) 有效，但我更喜欢pdf_document code_folding: "hide" 之类的选项。

【参考方案4】：

或者，您还可以通过markdownreports package 即时解析标准降价文档（没有代码块本身）。