如何在 r 中为 ggplot 自定义调色板?

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【中文标题】如何在 r 中为 ggplot 自定义调色板?【英文标题】:How to customize a color palette in r for ggplot? 【发布时间】:2020-10-09 05:19:21 【问题描述】:

我正在使用此代码绘制北美温度变化图:

ggplot(maps, aes(y=Latitude, x=Longitude, z=variable)) +
  ggtitle(title)+
  scale_fill_brewer(palette = "Spectral")+
  geom_contour_filled(breaks = c(-Inf,-2., -1.5, -1., -0.5, 0, 0.5, 1, 1.5, 2, 3, 4, 5, 7, 9, 11,Inf))+
  xlim(-146,-44)+
  ylim(35,90)+
  theme(plot.title = element_text(hjust = 0.5))

我想更改调色板以获得更好的可视化效果。目前写scale_fill_brewer(palette = "Spectral"),我打算改成自定义调色板

colors <- c(rgb(10,40,100,max=255),rgb(51,102,217,max=255),rgb(105,138,236,max=255),rgb(151,180,250,max=255),rgb(204,217,255,max=255),rgb(255,245,204,max=255),rgb(255,224,153,max=255),rgb(255,203,102,max=255),rgb(255,180,51,max=255),rgb(255,140,51,max=255),rgb(255,85,0,max=255),rgb(230,40,30,max=255),rgb(191,0,0,max=255),rgb(140,0,0,max=255),rgb(108,0,0,max=255),rgb(110,0,70,max=255))

使用scale_fill_brewer(palette = colors)会报错,我也试过palette(colors),还是不行。

如何自定义参数可以识别的调色板?

【问题讨论】:

使用scale_fill_manual(..., values=colors) r-bloggers.com/creating-color-palettes-in-r这篇文章可能会有所帮助。 【参考方案1】:

如果我正确理解您的问题,您想创建一个自定义 scale_... 函数。简而言之,这有点深入到源代码中。

我将展示一种方法,它可以简单地修改 RColorBrewer、scales,当然还有 ggplot2 包中的现有函数。

    核心是修改RcolorBrewer::brewer.pal,我想这基本上是你想要的。看到代码,它会根据您的“n”从颜色列表中选择正确的颜色。这就是您需要手动创建的内容。我刚刚从调色板“YlOrBr”中复制了颜色。需要考虑的一点:Brewer 调色板不是随机的,它们已经过测试和创建,可以识别打印、复印和色盲,所以我不确定创建自己的调色板是否非常聪明。查看https://colorbrewer2.org/ 以找到合适的调色板。 修改底层颜色选择器scales:::brewer_pal 修改scale_fill/scale_color函数

我已将功能归结为核心,因此它们不会进行通常的检查并且不太灵活。您可以修改原始功能以恢复此功能。

library(ggplot2)

mybrewerpal <- function(n, name) # modified RcolorBrewer::brewer.pal
## the first call to switch would not be necessary in this example,
## but I leave it in order to make the underlying structure in brewer.pal clearer
  switch(name, mypal = switch(n - 2, rgb(c(255, 254, 217), c(247, 196, 95), c(188, 79, 14), maxColorValue = 255),
    rgb(c(255, 254, 254, 204), c(255, 217, 153, 76), c(212, 142, 41, 2), maxColorValue = 255),
    rgb(c(255, 254, 254, 217, 153), c(255, 217, 153, 95, 52), c(212, 142, 41, 14, 4), maxColorValue = 255),
    rgb(c(255, 254, 254, 254, 217, 153), c(255, 227, 196, 153, 95, 52), c(212, 145, 79, 41, 14, 4), maxColorValue = 255),
    rgb(c(255, 254, 254, 254, 236, 204, 140), c(255, 227, 196, 153, 112, 76, 45), c(212, 145, 79, 41, 20, 2, 4), maxColorValue = 255),
    rgb(c(255, 255, 254, 254, 254, 236, 204, 140), c(255, 247, 227, 196, 153, 112, 76, 45), c(229, 188, 145, 79, 41, 20, 2, 4), maxColorValue = 255),
    rgb(c(255, 255, 254, 254, 254, 236, 204, 153, 102), c(255, 247, 227, 196, 153, 112, 76, 52, 37), c(229, 188, 145, 79, 41, 20, 2, 4, 6), maxColorValue = 255)
  ))


brewer_pal2 <- # modified from scales:::brewer_pal
  function()  # stripped down all arguments, just to show the core
    function(n) 
      mybrewerpal(n, "mypal") ##modified, usually this is selected by a function 
      ## with type and name as arguments, selecting a palette from a list called scales:::brewer
    
  

scale_fill_custom <- ### modified from scale_fill_brewer, removed some arguments
  function (..., aesthetics = "fill") 
    discrete_scale(aesthetics, "custom", brewer_pal2(), ...) ## give a new name to the
    ## scale, it will create a new Scale object.  
  

p <- 
  ggplot(mtcars, aes(x = mpg, y = disp)) +
  scale_fill_custom()

p + geom_point(shape = 21, aes(fill = as.factor(cyl))) 

p + geom_point(shape = 21, aes(fill = as.factor(carb))) 

【讨论】:

天才,非常感谢!

以上是关于如何在 r 中为 ggplot 自定义调色板?的主要内容,如果未能解决你的问题,请参考以下文章

R语言使用ggplot2包使用geom_dotplot函数绘制分组点图(分组调色板填充自定义调色板灰度比例)实战(dot plot)

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