Seaborn：我只想要一个对数刻度

Posted 2023-02-16

【中文标题】Seaborn：我只想要一个对数刻度

【英文标题】：Seaborn: I just want a log scale

【发布时间】：2018-01-08 10:32:36

【问题描述】：

我正在使用 seaborn 绘制一些生物学数据。

我只想要一个基因相对于另一个基因的分布（在大约 300 名患者中表达），这一切都很好用 graph = sns.jointplot(x='Gene1',y='Gene2',data=data,kind='reg')

我喜欢这个图表给我一个很好的线性拟合和一个 PearsonR 和一个 P 值。

我想要的只是将我的数据绘制在对数刻度上，这是通常表示此类基因数据的方式。

我在网上查看了一些解决方案，但它们都摆脱了我的 PearsonR 值或线性拟合，或者它们看起来不太好。我是新手，但似乎在对数刻度上绘制图表应该不会太麻烦。

有什么方法或解决方案吗？

谢谢！

编辑：作为对 cme​​ts 的回应，我离我的答案越来越近了。我现在有一个图（如下所示），但我需要一条拟合线并进行一些统计。现在正在努力，但在此期间任何答案/建议都非常受欢迎。

【问题讨论】：

您尝试过哪些解决方案但拒绝了？

我看了这个：***.com/questions/26059979/… 但是尝试了这个解决方案，我的数据只有一条直线？我不确定出了什么问题，但它没有我想要的统计数据。

在调用情节之前，您是否尝试过设置轴？ ***.com/a/40633595/8131703

【参考方案1】：

mybins=np.logspace(0, np.log(100), 100)

g = sns.JointGrid(data1, data2, data, xlim=[.5, 1000000],
                  ylim=[.1, 10000000])
g.plot_marginals(sns.distplot, color='blue', bins=mybins)
g = g.plot(sns.regplot, sns.distplot)
g = g.annotate(stats.pearsonr)

ax = g.ax_joint
ax.set_xscale('log')
ax.set_yscale('log')

g.ax_marg_x.set_xscale('log')
g.ax_marg_y.set_yscale('log')

这工作得很好。最后，我决定将我的表格值转换为log(x)，因为这使得图表在短期内更容易缩放和可视化。