使用 ggplot2 合并和完美对齐直方图和箱线图

Posted 2023-02-16

【中文标题】使用 ggplot2 合并和完美对齐直方图和箱线图

【英文标题】：Merge and Perfectly Align Histogram and Boxplot using ggplot2

【发布时间】：2018-06-18 06:23:46

【问题描述】：

从昨天开始，我正在阅读答案和网站，以便将histogram 和使用ggplot2 包生成的boxplot 组合并对齐在一个图中。

这个问题与其他问题不同，因为height 和aligned 中的boxplot chart 需要减少到histogram 的左外边距。

考虑以下数据集：

my_df <- structure(list(id = c(1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 
12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 
28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 
44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 
60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 
76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 
92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99, 100), value= c(18, 9, 3, 
4, 3, 13, 12, 5, 8, 37, 64, 107, 11, 11, 8, 18, 5, 13, 13, 14, 
11, 11, 9, 14, 11, 14, 12, 10, 11, 10, 5, 3, 8, 11, 12, 11, 7, 
6, 6, 4, 11, 8, 14, 13, 14, 15, 10, 2, 4, 4, 8, 15, 21, 9, 5, 
7, 11, 6, 11, 2, 6, 16, 5, 11, 21, 33, 12, 10, 13, 33, 35, 7, 
7, 9, 2, 21, 32, 19, 9, 8, 3, 26, 37, 5, 6, 10, 18, 5, 70, 48, 
30, 10, 15, 18, 7, 4, 19, 10, 4, 32)), row.names = c(NA, 100L
), class = "data.frame", .Names = c("id", "value"))

我生成了箱线图：

require(dplyr)
require(ggplot2)
my_df %>% select(value) %>%
        ggplot(aes(x="", y = value)) +
        geom_boxplot(fill = "lightblue", color = "black") + 
        coord_flip() +
        theme_classic() +
        xlab("") +
        theme(axis.text.y=element_blank(),
              axis.ticks.y=element_blank())

我生成了直方图

my_df %>% select(id, value) %>%
        ggplot() +
        geom_histogram(aes(x = value, y = (..count..)/sum(..count..)),
                       position = "identity", binwidth = 1, 
                       fill = "lightblue", color = "black") +
        ylab("Relative Frequency") +
        theme_classic()

我希望获得的结果是一个单一的情节，如：

请注意，箱线图必须高度降低，并且刻度必须完全对齐，以便为同一视觉提供不同的视角。

【问题讨论】：

看看cowplot的plot_grid (cran.r-project.org/web/packages/cowplot/vignettes/…) 使用参数align='v'和rel_height。

@MrGumble 显然，它仅用于创建不同图的网格，而不是用于我的特定目的。你有什么建议吗？

在Marginal Histogram / Boxplot 点下查看here。 ggMarginal() 应该可以做到这一点。

@Lap 我已经尝试过这种方法，但您无法合并您创建的两个绘图。包装自己创建了我不想要的边缘情节。你认为我应该用代码和我尝试但没有奏效的所有方法的结果来更新问题吗？

【参考方案1】：

您可以使用egg、cowplot 或patchwork 包来组合这两个图。有关更复杂的示例，另请参阅 answer。

library(dplyr)
library(ggplot2)

plt1 <- my_df %>% select(value) %>%
  ggplot(aes(x="", y = value)) +
  geom_boxplot(fill = "lightblue", color = "black") + 
  coord_flip() +
  theme_classic() +
  xlab("") +
  theme(axis.text.y=element_blank(),
        axis.ticks.y=element_blank())

plt2 <- my_df %>% select(id, value) %>%
  ggplot() +
  geom_histogram(aes(x = value, y = (..count..)/sum(..count..)),
                 position = "identity", binwidth = 1, 
                 fill = "lightblue", color = "black") +
  ylab("Relative Frequency") +
  theme_classic()

egg

# install.packages("egg", dependencies = TRUE)
egg::ggarrange(plt2, plt1, heights = 2:1)

cowplot

# install.packages("cowplot", dependencies = TRUE)
cowplot::plot_grid(plt2, plt1, 
                   ncol = 1, rel_heights = c(2, 1),
                   align = 'v', axis = 'lr')  

patchwork

# install.packages("devtools", dependencies = TRUE)
# devtools::install_github("thomasp85/patchwork")
library(patchwork)
plt2 + plt1 + plot_layout(nrow = 2, heights = c(2, 1))