使用 Scikit-learn (sklearn) 估算整个 DataFrame(所有列)而不迭代列
Posted
技术标签:
【中文标题】使用 Scikit-learn (sklearn) 估算整个 DataFrame(所有列)而不迭代列【英文标题】:Impute entire DataFrame (all columns) using Scikit-learn (sklearn) without iterating over columns 【发布时间】:2016-02-13 03:37:51 【问题描述】:我想估算 pandas DataFrame 上的所有列...我能想到的唯一方法是逐列如下所示...
有没有一种操作可以让我在不遍历列的情况下估算整个 DataFrame?
#!/usr/bin/python
from sklearn.preprocessing import Imputer
import numpy as np
import pandas as pd
#Imputer
fill_NaN = Imputer(missing_values=np.nan, strategy='mean', axis=1)
#Model 1
DF = pd.DataFrame([[0,1,np.nan],[2,np.nan,3],[np.nan,2,5]])
DF.columns = "c1.c2.c3".split(".")
DF.index = "i1.i2.i3".split(".")
#Impute Series
imputed_DF = DF
for col in DF.columns:
imputed_column = fill_NaN.fit_transform(DF[col]).T
#Fill in Series on DataFrame
imputed_DF[col] = imputed_column
#DF
#c1 c2 c3
#i1 0 1 NaN
#i2 2 NaN 3
#i3 NaN 2 5
#imputed_DF
#c1 c2 c3
#i1 0 1.0 4
#i2 2 1.5 3
#i3 1 2.0 5
【问题讨论】:
【参考方案1】: 如果任何列包含 NA,df.mean() 将返回 NA,因此使 df.fillna() 无法按预期运行。正确的方法是使用 np.nanmean()
【讨论】:
【参考方案2】:除非您出于某种原因特别需要使用 sklearn Imputer
,否则在我看来,一个更简单的选择就是这样做:
df = df.fillna(df.mean())
【讨论】:
这可能就是我现在要做的。也许类似于df[df.isnull()] = x
。我认为我实际上不会在现实世界的数据集中impute
任何东西。【参考方案3】:
如果你想要mean
或median
,你可以这样做:
fill_NaN = Imputer(missing_values=np.nan, strategy='mean', axis=1)
imputed_DF = pd.DataFrame(fill_NaN.fit_transform(DF))
imputed_DF.columns = DF.columns
imputed_DF.index = DF.index
如果你想用 0 或其他东西填充它们,你总是可以这样做:
DF[DF.isnull()] = 0
【讨论】:
我发现了很多不好的例子,这是第一个对我有意义的例子。谢谢! 谢谢!我没有从我的一个答案中得到任何好的反馈,所以我真的很感激。 +1 包括在原始 numpy 数组从任何 sklearn Imputer 出来之后,使用原始列名和索引恢复 DataFrame 类型的步骤以上是关于使用 Scikit-learn (sklearn) 估算整个 DataFrame(所有列)而不迭代列的主要内容,如果未能解决你的问题,请参考以下文章
ValueError:使用 GaussianNB 在 scikit-learn (sklearn) 中设置具有序列的数组元素
使用 Scikit-learn (sklearn) 估算整个 DataFrame(所有列)而不迭代列