创建具有精确大小且无填充的图形(以及轴外的图例)
Posted
技术标签:
【中文标题】创建具有精确大小且无填充的图形(以及轴外的图例)【英文标题】:Creating figure with exact size and no padding (and legend outside the axes) 【发布时间】:2017-08-17 02:05:32 【问题描述】:我正在尝试为一篇科学文章制作一些图形,因此我希望我的图形具有特定的尺寸。我还看到 Matplotlib 默认情况下会在图形的边框上添加很多填充,我不需要(因为图形无论如何都会在白色背景上)。
要设置特定的图形大小,我只需使用plt.figure(figsize = [w, h])
,并添加参数tight_layout = 'pad': 0
以删除填充。这工作得很好,即使我添加标题、y/x-labels 等也可以工作。示例:
fig = plt.figure(
figsize = [3,2],
tight_layout = 'pad': 0
)
ax = fig.add_subplot(111)
plt.title('title')
ax.set_ylabel('y label')
ax.set_xlabel('x label')
plt.savefig('figure01.pdf')
这将创建一个精确大小为 3x2(英寸)的 pdf 文件。
我遇到的问题是,例如,当我在轴外添加一个文本框(通常是图例框)时,Matplotlib 不会像添加标题/轴标签时那样为文本框腾出空间。通常,文本框被截断,或者根本不显示在保存的图形中。示例:
plt.close('all')
fig = plt.figure(
figsize = [3,2],
tight_layout = 'pad': 0
)
ax = fig.add_subplot(111)
plt.title('title')
ax.set_ylabel('y label')
ax.set_xlabel('x label')
t = ax.text(0.7, 1.1, 'my text here', bbox = dict(boxstyle = 'round'))
plt.savefig('figure02.pdf')
我在 SO 其他地方找到的解决方案是将参数 bbox_inches = 'tight'
添加到 savefig 命令。文本框现在像我想要的那样包含在内,但 pdf 现在的大小错误。似乎 Matplotlib 只是让图形更大,而不是像添加标题和 x/y-labels 时那样减小轴的大小。
例子:
plt.close('all')
fig = plt.figure(
figsize = [3,2],
tight_layout = 'pad': 0
)
ax = fig.add_subplot(111)
plt.title('title')
ax.set_ylabel('y label')
ax.set_xlabel('x label')
t = ax.text(0.7, 1.1, 'my text here', bbox = dict(boxstyle = 'round'))
plt.savefig('figure03.pdf', bbox_inches = 'tight')
(这个数字是3.307x2.248)
是否有任何解决方案可以涵盖大多数情况下在轴外带有图例的情况?
【问题讨论】:
【参考方案1】:所以要求是:
-
具有固定的预定义图形大小
在坐标区外添加文本标签或图例
轴和文本不能重叠
坐标轴连同标题和坐标轴标签紧紧地靠在图形边框上。
所以tight_layout
和pad = 0
解决了 1. 和 4. 但与 2. 相矛盾。
可以考虑将pad
设置为更大的值。这将解决 2。但是,由于它在所有方向上都是对称的,因此与 4 相矛盾。
使用bbox_inches = 'tight'
更改图形大小。矛盾 1.
所以我认为这个问题没有通用的解决方案。
我能想到的方法如下:它将文本设置为图形坐标,然后在水平或垂直方向调整轴的大小,以使轴和文本之间没有重叠。
import matplotlib.pyplot as plt
import matplotlib.transforms
fig = plt.figure(figsize = [3,2])
ax = fig.add_subplot(111)
plt.title('title')
ax.set_ylabel('y label')
ax.set_xlabel('x label')
def text_legend(ax, x0, y0, text, direction = "v", padpoints = 3, margin=1.,**kwargs):
ha = kwargs.pop("ha", "right")
va = kwargs.pop("va", "top")
t = ax.figure.text(x0, y0, text, ha=ha, va=va, **kwargs)
otrans = ax.figure.transFigure
plt.tight_layout(pad=0)
ax.figure.canvas.draw()
plt.tight_layout(pad=0)
offs = t._bbox_patch.get_boxstyle().pad * t.get_size() + margin # adding 1pt
trans = otrans + \
matplotlib.transforms.ScaledTranslation(-offs/72.,-offs/72.,fig.dpi_scale_trans)
t.set_transform(trans)
ax.figure.canvas.draw()
ppar = [0,-padpoints/72.] if direction == "v" else [-padpoints/72.,0]
trans2 = matplotlib.transforms.ScaledTranslation(ppar[0],ppar[1],fig.dpi_scale_trans) + \
ax.figure.transFigure.inverted()
tbox = trans2.transform(t._bbox_patch.get_window_extent())
bbox = ax.get_position()
if direction=="v":
ax.set_position([bbox.x0, bbox.y0,bbox.width, tbox[0][1]-bbox.y0])
else:
ax.set_position([bbox.x0, bbox.y0,tbox[0][0]-bbox.x0, bbox.height])
# case 1: place text label at top right corner of figure (1,1). Adjust axes height.
#text_legend(ax, 1,1, 'my text here', bbox = dict(boxstyle = 'round'), )
# case 2: place text left of axes, (1, y), direction=="v"
text_legend(ax, 1., 0.8, 'my text here', margin=2., direction="h", bbox = dict(boxstyle = 'round') )
plt.savefig(__file__+'.pdf')
plt.show()
案例 1(左)和案例 2(右):
用图例做同样的事情稍微容易一些,因为我们可以直接使用
bbox_to_anchor
参数,不需要控制图例周围的花哨的框。
import matplotlib.pyplot as plt
import matplotlib.transforms
fig = plt.figure(figsize = [3.5,2])
ax = fig.add_subplot(111)
ax.set_title('title')
ax.set_ylabel('y label')
ax.set_xlabel('x label')
ax.plot([1,2,3], marker="o", label="quantity 1")
ax.plot([2,1.7,1.2], marker="s", label="quantity 2")
def legend(ax, x0=1,y0=1, direction = "v", padpoints = 3,**kwargs):
otrans = ax.figure.transFigure
t = ax.legend(bbox_to_anchor=(x0,y0), loc=1, bbox_transform=otrans,**kwargs)
plt.tight_layout(pad=0)
ax.figure.canvas.draw()
plt.tight_layout(pad=0)
ppar = [0,-padpoints/72.] if direction == "v" else [-padpoints/72.,0]
trans2=matplotlib.transforms.ScaledTranslation(ppar[0],ppar[1],fig.dpi_scale_trans)+\
ax.figure.transFigure.inverted()
tbox = t.get_window_extent().transformed(trans2 )
bbox = ax.get_position()
if direction=="v":
ax.set_position([bbox.x0, bbox.y0,bbox.width, tbox.y0-bbox.y0])
else:
ax.set_position([bbox.x0, bbox.y0,tbox.x0-bbox.x0, bbox.height])
# case 1: place text label at top right corner of figure (1,1). Adjust axes height.
#legend(ax, borderaxespad=0)
# case 2: place text left of axes, (1, y), direction=="h"
legend(ax,y0=0.8, direction="h", borderaxespad=0.2)
plt.savefig(__file__+'.pdf')
plt.show()
为什么是
72
? 72
是每英寸的点数 (ppi)。这是一个固定的印刷单位,例如字体大小总是以点为单位(如 12pt)。因为 matplotlib 以相对于 fontsize 的单位(即点)定义文本框的填充,所以我们需要使用 72
转换回英寸(然后显示坐标)。默认的每英寸点数 (dpi) 未在此处涉及,但在 fig.dpi_scale_trans
中进行了说明。如果要更改 dpi,则需要确保在创建图形以及保存图形时设置图形 dpi(在调用 plt.figure()
和 plt.savefig()
时使用 dpi=..
)。
【讨论】:
谢谢,这太棒了!您介意解释一下在某些地方出现的硬编码72
是什么吗?我猜这是默认 dpi,但我不确定。
我在答案中添加了一些解释。
再次感谢。有什么简单的方法可以让这个传奇人物工作吗? IE。在轴外放置图例时。
我在答案中添加了图例的案例。【参考方案2】:
截至matplotlib==3.1.3
,您可以使用constrained_layout=True
来达到预期的效果。这目前是实验性的,但请参阅 docs 以获得非常有用的指南(以及专门针对图例的 section)。请注意,图例会从情节中窃取空间,但这是不可避免的。我发现只要图例相对于绘图的大小不占用太多空间,那么图形就会被保存而不会裁剪任何内容。
import matplotlib.pyplot as plt
fig, ax = plt.subplots(figsize=(3, 2), constrained_layout=True)
ax.set_title('title')
ax.set_ylabel('y label')
ax.set_xlabel('x label')
ax.plot([0,1], [0,1], label='my text here')
ax.legend(loc='center left', bbox_to_anchor=(1.1, 0.5))
fig.savefig('figure03.pdf')
The saved figure.
【讨论】:
以上是关于创建具有精确大小且无填充的图形(以及轴外的图例)的主要内容,如果未能解决你的问题,请参考以下文章