Pandas 中的聚合

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【中文标题】Pandas 中的聚合【英文标题】:Aggregation in Pandas 【发布时间】:2022-01-24 04:44:44 【问题描述】:
    如何使用 Pandas 执行聚合? 聚合后没有DataFrame!发生了什么? 如何主要聚合字符串列(到lists、tuples、strings with separator)? 如何汇总计数? 如何创建一个由聚合值填充的新列?

我已经看到这些反复出现的问题,询问有关 pandas 聚合功能的各个方面。 今天,关于聚合及其各种用例的大部分信息都分散在数十个措辞不当、无法搜索的帖子中。 这里的目的是为后代整理一些更重要的观点。

本问答旨在成为一系列有用的用户指南的下一部分:

How to pivot a dataframe, Pandas concat How do I operate on a DataFrame with a Series for every column? Pandas Merging 101

请注意,这篇文章并不是要替代documentation about aggregation 和关于groupby,所以也请阅读!

【问题讨论】:

请尽量不要关闭规范帖子(您无法解决规范问答帖子中的 1 个问题) 【参考方案1】:

问题 1

如何使用 Pandas 执行聚合?

扩展aggregation documentation。

聚合函数是减少返回对象维度的函数。这意味着输出 Series/DataFrame 的行数与原始行数相同或更少。

下表列出了一些常见的聚合函数:

功能 说明 mean() 计算组的平均值 sum() 计算组值的总和 size() 计算组大小 count() 计算组数 std() 组的标准差 var() 计算组的方差 sem() 组平均值的标准误差 describe() 生成描述性统计 first() 计算组值中的第一个 last() 计算最后一个组值 nth() 取第 n 个值,如果 n 是一个列表,则取一个子集 min() 计算组值的最小值 max() 计算组值的最大值
np.random.seed(123)

df = pd.DataFrame('A' : ['foo', 'foo', 'bar', 'foo', 'bar', 'foo'],
                   'B' : ['one', 'two', 'three','two', 'two', 'one'],
                   'C' : np.random.randint(5, size=6),
                   'D' : np.random.randint(5, size=6),
                   'E' : np.random.randint(5, size=6))
print (df)
     A      B  C  D  E
0  foo    one  2  3  0
1  foo    two  4  1  0
2  bar  three  2  1  1
3  foo    two  1  0  3
4  bar    two  3  1  4
5  foo    one  2  1  0

按过滤列和Cython implemented functions聚合:

df1 = df.groupby(['A', 'B'], as_index=False)['C'].sum()
print (df1)
     A      B  C
0  bar  three  2
1  bar    two  3
2  foo    one  4
3  foo    two  5

聚合函数用于所有列,但未在 groupby 函数中指定,此处为 A, B 列:

df2 = df.groupby(['A', 'B'], as_index=False).sum()
print (df2)
     A      B  C  D  E
0  bar  three  2  1  1
1  bar    two  3  1  4
2  foo    one  4  4  0
3  foo    two  5  1  3

您还可以在groupby 函数之后的列表中仅指定一些用于聚合的列:

df3 = df.groupby(['A', 'B'], as_index=False)['C','D'].sum()
print (df3)
     A      B  C  D
0  bar  three  2  1
1  bar    two  3  1
2  foo    one  4  4
3  foo    two  5  1

使用函数DataFrameGroupBy.agg得到相同的结果:

df1 = df.groupby(['A', 'B'], as_index=False)['C'].agg('sum')
print (df1)
     A      B  C
0  bar  three  2
1  bar    two  3
2  foo    one  4
3  foo    two  5

df2 = df.groupby(['A', 'B'], as_index=False).agg('sum')
print (df2)
     A      B  C  D  E
0  bar  three  2  1  1
1  bar    two  3  1  4
2  foo    one  4  4  0
3  foo    two  5  1  3

对于应用于一列的多个函数,请使用tuples 列表 - 新列和聚合函数的名称:

df4 = (df.groupby(['A', 'B'])['C']
         .agg([('average','mean'),('total','sum')])
         .reset_index())
print (df4)
     A      B  average  total
0  bar  three      2.0      2
1  bar    two      3.0      3
2  foo    one      2.0      4
3  foo    two      2.5      5

如果要传递多个函数,可以传递list of tuples:

df5 = (df.groupby(['A', 'B'])
         .agg([('average','mean'),('total','sum')]))

print (df5)
                C             D             E
          average total average total average total
A   B
bar three     2.0     2     1.0     1     1.0     1
    two       3.0     3     1.0     1     4.0     4
foo one       2.0     4     2.0     4     0.0     0
    two       2.5     5     0.5     1     1.5     3

然后在列中获取MultiIndex

print (df5.columns)
MultiIndex(levels=[['C', 'D', 'E'], ['average', 'total']],
           labels=[[0, 0, 1, 1, 2, 2], [0, 1, 0, 1, 0, 1]])

对于转换为列,将MultiIndexjoin 一起使用map

df5.columns = df5.columns.map('_'.join)
df5 = df5.reset_index()
print (df5)
     A      B  C_average  C_total  D_average  D_total  E_average  E_total
0  bar  three        2.0        2        1.0        1        1.0        1
1  bar    two        3.0        3        1.0        1        4.0        4
2  foo    one        2.0        4        2.0        4        0.0        0
3  foo    two        2.5        5        0.5        1        1.5        3

另一个解决方案是传递聚合函数列表,然后展平MultiIndex,对于其他列名称使用str.replace

df5 = df.groupby(['A', 'B']).agg(['mean','sum'])

df5.columns = (df5.columns.map('_'.join)
                  .str.replace('sum','total')
                  .str.replace('mean','average'))
df5 = df5.reset_index()
print (df5)
     A      B  C_average  C_total  D_average  D_total  E_average  E_total
0  bar  three        2.0        2        1.0        1        1.0        1
1  bar    two        3.0        3        1.0        1        4.0        4
2  foo    one        2.0        4        2.0        4        0.0        0
3  foo    two        2.5        5        0.5        1        1.5        3

如果想用聚合函数分别指定每一列通过dictionary:

df6 = (df.groupby(['A', 'B'], as_index=False)
         .agg('C':'sum','D':'mean')
         .rename(columns='C':'C_total', 'D':'D_average'))
print (df6)
     A      B  C_total  D_average
0  bar  three        2        1.0
1  bar    two        3        1.0
2  foo    one        4        2.0
3  foo    two        5        0.5

你也可以传递自定义函数:

def func(x):
    return x.iat[0] + x.iat[-1]

df7 = (df.groupby(['A', 'B'], as_index=False)
         .agg('C':'sum','D': func)
         .rename(columns='C':'C_total', 'D':'D_sum_first_and_last'))
print (df7)
     A      B  C_total  D_sum_first_and_last
0  bar  three        2                     2
1  bar    two        3                     2
2  foo    one        4                     4
3  foo    two        5                     1

问题2

聚合后没有DataFrame!发生了什么?

两列或多列聚合:

df1 = df.groupby(['A', 'B'])['C'].sum()
print (df1)
A    B
bar  three    2
     two      3
foo  one      4
     two      5
Name: C, dtype: int32

首先检查 Pandas 对象的Indextype

print (df1.index)
MultiIndex(levels=[['bar', 'foo'], ['one', 'three', 'two']],
           labels=[[0, 0, 1, 1], [1, 2, 0, 2]],
           names=['A', 'B'])

print (type(df1))
<class 'pandas.core.series.Series'>

对于如何将MultiIndex Series 获取到列,有两种解决方案:

添加参数as_index=False
df1 = df.groupby(['A', 'B'], as_index=False)['C'].sum()
print (df1)
     A      B  C
0  bar  three  2
1  bar    two  3
2  foo    one  4
3  foo    two  5
使用Series.reset_index:
df1 = df.groupby(['A', 'B'])['C'].sum().reset_index()
print (df1)
     A      B  C
0  bar  three  2
1  bar    two  3
2  foo    one  4
3  foo    two  5

如果按一列分组:

df2 = df.groupby('A')['C'].sum()
print (df2)
A
bar    5
foo    9
Name: C, dtype: int32

...用Index 获取Series

print (df2.index)
Index(['bar', 'foo'], dtype='object', name='A')

print (type(df2))
<class 'pandas.core.series.Series'>

而且解决方法和MultiIndex Series中的一样:

df2 = df.groupby('A', as_index=False)['C'].sum()
print (df2)
     A  C
0  bar  5
1  foo  9

df2 = df.groupby('A')['C'].sum().reset_index()
print (df2)
     A  C
0  bar  5
1  foo  9

问题3

我怎样才能主要聚合字符串列(到lists,@987654378 @s, strings with separator)?

df = pd.DataFrame('A' : ['a', 'c', 'b', 'b', 'a', 'c', 'b'],
                   'B' : ['one', 'two', 'three','two', 'two', 'one', 'three'],
                   'C' : ['three', 'one', 'two', 'two', 'three','two', 'one'],
                   'D' : [1,2,3,2,3,1,2])
print (df)
   A      B      C  D
0  a    one  three  1
1  c    two    one  2
2  b  three    two  3
3  b    two    two  2
4  a    two  three  3
5  c    one    two  1
6  b  three    one  2

可以通过listtupleset来代替聚合函数来转换列:

df1 = df.groupby('A')['B'].agg(list).reset_index()
print (df1)
   A                    B
0  a           [one, two]
1  b  [three, two, three]
2  c           [two, one]

另一种方法是使用GroupBy.apply

df1 = df.groupby('A')['B'].apply(list).reset_index()
print (df1)
   A                    B
0  a           [one, two]
1  b  [three, two, three]
2  c           [two, one]

要转换为带分隔符的字符串,仅当它是字符串列时才使用.join

df2 = df.groupby('A')['B'].agg(','.join).reset_index()
print (df2)
   A                B
0  a          one,two
1  b  three,two,three
2  c          two,one

如果是数值列​​,使用带有astype的lambda函数转换为strings:

df3 = (df.groupby('A')['D']
         .agg(lambda x: ','.join(x.astype(str)))
         .reset_index())
print (df3)
   A      D
0  a    1,3
1  b  3,2,2
2  c    2,1

另一种解决方案是在groupby之前转换为字符串:

df3 = (df.assign(D = df['D'].astype(str))
         .groupby('A')['D']
         .agg(','.join).reset_index())
print (df3)
   A      D
0  a    1,3
1  b  3,2,2
2  c    2,1

为了转换所有列,不要在groupby 之后传递列列表。 没有任何列D,因为automatic exclusion of 'nuisance' columns。这意味着所有数字列都被排除在外。

df4 = df.groupby('A').agg(','.join).reset_index()
print (df4)
   A                B            C
0  a          one,two  three,three
1  b  three,two,three  two,two,one
2  c          two,one      one,two

所以需要将所有列转换成字符串,然后获取所有列:

df5 = (df.groupby('A')
         .agg(lambda x: ','.join(x.astype(str)))
         .reset_index())
print (df5)
   A                B            C      D
0  a          one,two  three,three    1,3
1  b  three,two,three  two,two,one  3,2,2
2  c          two,one      one,two    2,1

问题 4

我如何汇总计数?

df = pd.DataFrame('A' : ['a', 'c', 'b', 'b', 'a', 'c', 'b'],
                   'B' : ['one', 'two', 'three','two', 'two', 'one', 'three'],
                   'C' : ['three', np.nan, np.nan, 'two', 'three','two', 'one'],
                   'D' : [np.nan,2,3,2,3,np.nan,2])
print (df)
   A      B      C    D
0  a    one  three  NaN
1  c    two    NaN  2.0
2  b  three    NaN  3.0
3  b    two    two  2.0
4  a    two  three  3.0
5  c    one    two  NaN
6  b  three    one  2.0

每个组的size 的函数GroupBy.size

df1 = df.groupby('A').size().reset_index(name='COUNT')
print (df1)
   A  COUNT
0  a      2
1  b      3
2  c      2

函数GroupBy.count 排除缺失值:

df2 = df.groupby('A')['C'].count().reset_index(name='COUNT')
print (df2)
   A  COUNT
0  a      2
1  b      2
2  c      1

这个函数应该用于多列计算非缺失值:

df3 = df.groupby('A').count().add_suffix('_COUNT').reset_index()
print (df3)
   A  B_COUNT  C_COUNT  D_COUNT
0  a        2        2        1
1  b        3        2        3
2  c        2        1        1

一个相关的函数是Series.value_counts。它以降序返回包含唯一值计数的对象的大小,因此第一个元素是最常出现的元素。它默认排除NaNs 值。

df4 = (df['A'].value_counts()
              .rename_axis('A')
              .reset_index(name='COUNT'))
print (df4)
   A  COUNT
0  b      3
1  a      2
2  c      2

如果你想要像使用函数groupby + size 一样的输出,添加Series.sort_index

df5 = (df['A'].value_counts()
              .sort_index()
              .rename_axis('A')
              .reset_index(name='COUNT'))
print (df5)
   A  COUNT
0  a      2
1  b      3
2  c      2

问题5

如何创建一个由聚合值填充的新列?

方法GroupBy.transform返回一个与被分组的对象索引相同(相同大小)的对象。

更多信息请参见the Pandas documentation。

np.random.seed(123)

df = pd.DataFrame('A' : ['foo', 'foo', 'bar', 'foo', 'bar', 'foo'],
                    'B' : ['one', 'two', 'three','two', 'two', 'one'],
                    'C' : np.random.randint(5, size=6),
                    'D' : np.random.randint(5, size=6))
print (df)
     A      B  C  D
0  foo    one  2  3
1  foo    two  4  1
2  bar  three  2  1
3  foo    two  1  0
4  bar    two  3  1
5  foo    one  2  1


df['C1'] = df.groupby('A')['C'].transform('sum')
df['C2'] = df.groupby(['A','B'])['C'].transform('sum')


df[['C3','D3']] = df.groupby('A')['C','D'].transform('sum')
df[['C4','D4']] = df.groupby(['A','B'])['C','D'].transform('sum')

print (df)

     A      B  C  D  C1  C2  C3  D3  C4  D4
0  foo    one  2  3   9   4   9   5   4   4
1  foo    two  4  1   9   5   9   5   5   1
2  bar  three  2  1   5   2   5   2   2   1
3  foo    two  1  0   9   5   9   5   5   1
4  bar    two  3  1   5   3   5   2   3   1
5  foo    one  2  1   9   4   9   5   4   4

【讨论】:

@AbhishekDujari - 我尝试用一​​些关于聚合的相关问题来扩展文档,所以它更像是文档中的更多信息。 谢谢。虽然我建议为项目本身做出贡献。这些很好的例子将使很多学生受益 可用聚合函数列表...你在哪里找到的?我似乎在官方文档的任何地方都找不到它!谢谢! @QACollective - 你可以查看this【参考方案2】:

如果您具有 R 或 SQL 背景,以下三个示例将教您以您已经熟悉的方式进行聚合所需的一切:

让我们首先创建一个 Pandas 数据框

import pandas as pd

df = pd.DataFrame('key1' : ['a','a','a','b','a'],
                   'key2' : ['c','c','d','d','e'],
                   'value1' : [1,2,2,3,3],
                   'value2' : [9,8,7,6,5])

df.head(5)

我们创建的表格如下所示:

key1 key2 value1 value2
a c 1 9
a c 2 8
a d 2 7
b d 3 6
a e 3 5

1.类似于 SQL 的行缩减聚合Group By

1.1 如果熊猫版本&gt;=0.25

通过运行print(pd.__version__) 检查您的 Pandas 版本。如果您的 Pandas 版本为 0.25 或更高版本,则以下代码将起作用:

df_agg = df.groupby(['key1','key2']).agg(mean_of_value_1=('value1', 'mean'),
                                         sum_of_value_2=('value2', 'sum'),
                                         count_of_value1=('value1','size')
                                         ).reset_index()


df_agg.head(5)

生成的数据表将如下所示:

key1 key2 mean_of_value1 sum_of_value2 count_of_value1
a c 1.5 17 2
a d 2.0 7 1
a e 3.0 5 1
b d 3.0 6 1

SQL 等效是:

SELECT
      key1
     ,key2
     ,AVG(value1) AS mean_of_value_1
     ,SUM(value2) AS sum_of_value_2
     ,COUNT(*) AS count_of_value1
FROM
    df
GROUP BY
     key1
    ,key2

1.2 如果熊猫版本&lt;0.25

如果您的 Pandas 版本早于 0.25,则运行上述代码会出现以下错误:

TypeError: aggregate() 缺少 1 个必需的位置参数:'arg'

现在要对value1value2 进行聚合,您将运行以下代码:

df_agg = df.groupby(['key1','key2'],as_index=False).agg('value1':['mean','count'],'value2':'sum')

df_agg.columns = ['_'.join(col).strip() for col in df_agg.columns.values]

df_agg.head(5)

生成的表格如下所示:

key1 key2 value1_mean value1_count value2_sum
a c 1.5 2 17
a d 2.0 1 7
a e 3.0 1 5
b d 3.0 1 6

重命名列需要使用以下代码单独完成:

df_agg.rename(columns="value1_mean" : "mean_of_value1",
                       "value1_count" : "count_of_value1",
                       "value2_sum" : "sum_of_value2"
                       , inplace=True)

2.创建不减少行数的列 (EXCEL - SUMIF, COUNTIF)

如果你想做一个 SUMIF、COUNTIF 等,就像你在 Excel 中做的那样,没有减少行数,那么你需要这样做。

df['Total_of_value1_by_key1'] = df.groupby('key1')['value1'].transform('sum')

df.head(5)

生成的数据框将如下所示,其行数与原始数据框相同:

key1 key2 value1 value2 Total_of_value1_by_key1
a c 1 9 8
a c 2 8 8
a d 2 7 8
b d 3 6 3
a e 3 5 8

3.创建排名列ROW_NUMBER() OVER (PARTITION BY ORDER BY)

最后,在某些情况下,您可能想要创建一个 rank 列,它是ROW_NUMBER() OVER (PARTITION BY key1 ORDER BY value1 DESC, value2 ASC) 的 SQL 等效

这是你的做法。

 df['RN'] = df.sort_values(['value1','value2'], ascending=[False,True]) \
              .groupby(['key1']) \
              .cumcount() + 1

 df.head(5)

注意:我们通过在每行末尾添加\ 来使代码多行。

生成的数据框如下所示:

key1 key2 value1 value2 RN
a c 1 9 4
a c 2 8 3
a d 2 7 2
b d 3 6 1
a e 3 5 1

在上述所有示例中,最终数据表将具有表结构,并且不会具有您可能在其他语法中获得的数据透视结构。

其他聚合算子:

mean() 计算组的平均值

sum()计算组值的总和

size() 计算组大小

count()计算组数

std() 组的标准差

var() 计算组的方差

sem()组均值的标准误

describe() 生成描述性统计数据

first() 计算组值中的第一个

last() 计算最后一个组值

nth()取第n个值,如果n是一个列表,则取一个子集

min() 计算组值的最小值

max() 计算组值的最大值

【讨论】:

df 有一些nan 时这是否成立?

以上是关于Pandas 中的聚合的主要内容,如果未能解决你的问题,请参考以下文章

数据分析—Pandas 中的分组聚合Groupby 高阶操作

Pandas 中的转换与聚合

Pandas 中的转换与聚合

pandas 数据框中的聚合,其中一行中的列名

pandas 中的聚合和计数

python / pandas中的条件聚合