如何在自制软件上使用 mpi 支持来构建提升？

Posted 2023-02-21

【中文标题】如何在自制软件上使用 mpi 支持来构建提升？

【英文标题】：How to build boost with mpi support on homebrew?

【发布时间】：2012-10-20 01:16:34

【问题描述】：

根据这篇文章 (https://github.com/mxcl/homebrew/pull/2953)，标志“--with-mpi”应该启用对相关自制公式的 boost_mpi 构建支持，所以我试图通过自制软件安装 boost，如下所示：

brew install boost --with-mpi

但是，实际的 boost mpi 库并未在构建中，因此无法找到。 根据：https://github.com/mxcl/homebrew/pull/15689

，目前正在围绕此进行一些工作

总之，我目前可以构建 boost，但似乎“--with-mpi”标志被忽略了。有人可以检查一下，我是否应该能够在 Mac OS X Mountain Lion (10.8) 上构建 boost（支持 mpi）？

（详细）输出生成以下行：

MPI auto-detection failed: unknown wrapper compiler mpic++
Please report this error to the Boost mailing list: http://www.boost.org
You will need to manually configure MPI support.

warning: skipping optional Message Passing Interface (MPI) library.
note: to enable MPI support, add "using mpi ;" to user-config.jam.
note: to suppress this message, pass "--without-mpi" to bjam.
note: otherwise, you can safely ignore this message.

不确定我该如何解决这个问题并获得要构建的 mpi 东西 - 有什么想法吗？

【问题讨论】：

这里有一些构建初始化的输出：gist.github.com/3981327

以前预装 Open MPI 的旧 OS X 版本。我相信 OMPI 从 Lion 开始就被删除了，你必须手动安装它。来自 OMPI 安装的 bin 目录应位于 PATH - 这是 mpicc、mpic++ 等包装器所在的位置。

谢谢 - 是的，我安装了 open-mpi，并且也尝试了 mpich2（不过仍然是同样的问题）。路径指向 /usr/local/bin，使用 homebrew 安装时可以找到 mpic++、mpicc、mpirun 等。

【参考方案1】：

以防万一这有助于其他人，这就是我解决这个问题的方法。主要错误是MPI auto-detection failed: unknown wrapper compiler mpic++，在命令行中输入任何 mpic++ 都会验证它对我来说不能正常工作。我使用 brew 安装 open-mpi，但在安装 boost 的详细输出中显示了相同的错误。 brew doctor 的运行表明 openmpi 未正确链接，因此我修复了这些错误并重新运行 brew -v install boost --with-mpi --without-single，它最终构建并安装了所有库而没有问题

【参考方案2】：

对于遇到此问题的任何人，该软件包已迁移到 boost-python 和 boost-mpi，与 boost 分开。使用brew install boost-mpi

【讨论】：

这是有用的信息，但我确实认为这应该是对问题的评论，因为它不一定回答“如何构建”的问题。

【参考方案3】：

让它在 OSX 10.11.5 上运行即可。我试过 brew，但没有运气。

假设你已经安装了 gcc。以下是我所做的：

1.查找并禁用（但不要删除）clang

clang 总是让人头疼。构建 Boost 时会有很多警告。

which clang，应该给你/usr/bin/clang

重命名为：sudo mv clang clang_mac_remove，对于 clang++ 也是：sudo mv clang++ clang++_mac_remove。如果将来需要，您可以将名称改回来。

2。安装 OpenMPI

如果您已经使用 brew 安装，请先卸载。因为默认情况下它会使用 clang 作为编译器包装器。您需要将包装器更改为gcc。

下载包。

将包装编译器指定为gcc 和g++：

./configure CC=gcc CXX=g++ F77=ifort FC=ifort --prefix=/usr/local

下面可能需要很长时间。

make all

sudo make install

参考：https://wiki.helsinki.fi/display/HUGG/Open+MPI+install+on+Mac+OS+X

3.安装 Boost MPI

下载包。

运行./bootstrap.sh（可以先打开并指定toolset为gcc，否则mac默认为darwin）。

在project-config.jam 文件中添加using mpi ;。那么./b2 —with-mpi 只会构建 mpi 库。

然后，所有构建的库都可以在文件夹~/Downloads/boost_1_61_0/stage/lib中找到。

将它们复制或移动到/usr/local/lib 或任何其他常用的库路径。

参考：http://www.boost.org/doc/libs/1_61_0/doc/html/mpi/getting_started.html

4.使用 Boost MPI 编译

图书馆目录 = -L/usr/local/lib

包括 = -I/usr/local/include/

链接器 = -lboost_mpi -lboost_serialization

例如

mpic++ -std=c++11 -I/usr/local/include/ -c boost_test.cpp -L/usr/local/lib -lboost_mpi -lboost_serialization

祝你好运！