如何使用分层索引保存和检索 Pandas 数据帧?

Posted

技术标签:

【中文标题】如何使用分层索引保存和检索 Pandas 数据帧?【英文标题】:How to save and retrive Pandas dataframes with hierarchichal indexing? 【发布时间】:2015-03-25 06:29:28 【问题描述】:

我需要创建并保存一个带有分层索引的 Pandas 数据框。在下面,我创建了两个数据框,然后将它们连接起来以创建一个具有分层索引的新数据框。

data1 = np.random.rand(5,5)
data2 = np.random.rand(5,5)
df1 = pd.DataFrame(data1, columns = ['a', 'b', 'c', 'd', 'e'],  index=['i1', 'i2', 'i3', 'i4', 'i5'])
df2 = pd.DataFrame(data2, columns = ['a', 'b', 'c', 'd', 'e'],  index=['i1', 'i2', 'i3', 'i4', 'i5'])

df = pd.concat([df1, df2], keys=['first', 'second'])

print "Original Data frame"
print df

# Save to file.
df.to_csv('test')

# Read from file.
df_new = pd.DataFrame.from_csv('test')

print "Saved Data frame"
print df_new

这是我得到的输出,

Original Data frame
                  a         b         c         d         e
first  i1  0.926553  0.180306  0.182887  0.783061  0.832914
       i2  0.899054  0.130367  0.615534  0.965580  0.669495
       i3  0.931004  0.425528  0.068938  0.166522  0.714399
       i4  0.082365  0.587194  0.993864  0.187864  0.066035
       i5  0.668671  0.294744  0.136317  0.358732  0.529674
second i1  0.916310  0.361423  0.700380  0.386119  0.273667
       i2  0.102542  0.454106  0.565760  0.259323  0.104743
       i3  0.410280  0.379986  0.288921  0.177819  0.919343
       i4  0.447279  0.113711  0.032273  0.335358  0.717824
       i5  0.995781  0.356817  0.146785  0.972401  0.169360

Saved Data frame
       Unnamed: 1         a         b         c         d         e
first          i1  0.926553  0.180306  0.182887  0.783061  0.832914
first          i2  0.899054  0.130367  0.615534  0.965580  0.669495
first          i3  0.931004  0.425528  0.068938  0.166522  0.714399
first          i4  0.082365  0.587194  0.993864  0.187864  0.066035
first          i5  0.668671  0.294744  0.136317  0.358732  0.529674
second         i1  0.916310  0.361423  0.700380  0.386119  0.273667
second         i2  0.102542  0.454106  0.565760  0.259323  0.104743
second         i3  0.410280  0.379986  0.288921  0.177819  0.919343
second         i4  0.447279  0.113711  0.032273  0.335358  0.717824
second         i5  0.995781  0.356817  0.146785  0.972401  0.169360

当我将这个新数据框保存到 csv 文件(“测试”)并读回时,我失去了分层索引。有没有办法将数据保存到文件中,这样当我读回它时,我会保留分层索引?

【问题讨论】:

【参考方案1】:

以另一种方式保存它,而不是使用 csv。比如泡菜:

df.to_pickle('dataframe.pickle')

这会保留分层索引。你又读了一遍:

pd.read_pickle('dataframe.pickle')

Pandas 有几种 IO 方法,您可以在documentation 中了解它们。

【讨论】:

【参考方案2】:

你可以:

重置索引并将DataFrame保存到csv,从csv读回,然后 将索引设置回原来的(就地)。

df
Out[11]: 
                  a         b         c         d         e
first  i1  0.935478  0.455757  0.607418  0.850291  0.704326
       i2  0.675752  0.339017  0.999949  0.508480  0.888817
       i3  0.463371  0.803389  0.048469  0.599697  0.423603
       i4  0.935294  0.933699  0.843289  0.182535  0.255847
       i5  0.321236  0.120010  0.647876  0.000517  0.032592
second i1  0.172044  0.691660  0.799164  0.194785  0.302880
       i2  0.432988  0.511229  0.451268  0.203145  0.560563
       i3  0.442584  0.771483  0.839945  0.716374  0.533183
       i4  0.167898  0.962646  0.152245  0.400280  0.210355
       i5  0.736365  0.511057  0.256672  0.619250  0.790739

df.reset_index()
Out[12]: 
  level_0 level_1         a         b         c         d         e
0   first      i1  0.935478  0.455757  0.607418  0.850291  0.704326
1   first      i2  0.675752  0.339017  0.999949  0.508480  0.888817
2   first      i3  0.463371  0.803389  0.048469  0.599697  0.423603
3   first      i4  0.935294  0.933699  0.843289  0.182535  0.255847
4   first      i5  0.321236  0.120010  0.647876  0.000517  0.032592
5  second      i1  0.172044  0.691660  0.799164  0.194785  0.302880
6  second      i2  0.432988  0.511229  0.451268  0.203145  0.560563
7  second      i3  0.442584  0.771483  0.839945  0.716374  0.533183
8  second      i4  0.167898  0.962646  0.152245  0.400280  0.210355
9  second      i5  0.736365  0.511057  0.256672  0.619250  0.790739

df.reset_index().to_csv('test.csv', index=False)
df3 = pd.read_csv('test.csv')
df3.set_index(['level_0', 'level_1'], inplace=True)

>>> df3
Out[15]: 
                        a         b         c         d         e
level_0 level_1                                                  
first   i1       0.935478  0.455757  0.607418  0.850291  0.704326
        i2       0.675752  0.339017  0.999949  0.508480  0.888817
        i3       0.463371  0.803389  0.048469  0.599697  0.423603
        i4       0.935294  0.933699  0.843289  0.182535  0.255847
        i5       0.321236  0.120010  0.647876  0.000517  0.032592
second  i1       0.172044  0.691660  0.799164  0.194785  0.302880
        i2       0.432988  0.511229  0.451268  0.203145  0.560563
        i3       0.442584  0.771483  0.839945  0.716374  0.533183
        i4       0.167898  0.962646  0.152245  0.400280  0.210355
        i5       0.736365  0.511057  0.256672  0.619250  0.790739

【讨论】:

以上是关于如何使用分层索引保存和检索 Pandas 数据帧?的主要内容,如果未能解决你的问题,请参考以下文章

使用索引日期时间从 pandas 数据帧创建 json

如何在 pandas 中使用 apply 函数,同时将索引映射到两个不同的数据帧?

将 pandas 数据帧分层拆分为训练、验证和测试集

Pandas - 如何将 Parquet 数据帧保存到本地磁盘?

如何从按连续变量分层的 Pandas 数据框中获取分层随机样本

如何删除 Pandas 数据帧索引的“秒”?