C++ Armadillo 和 OpenMp:外积求和的并行化 - 定义 Armadillo 矩阵的约简
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【中文标题】C++ Armadillo 和 OpenMp:外积求和的并行化 - 定义 Armadillo 矩阵的约简【英文标题】:C++ Armadillo and OpenMp: Parallelization of summation of outer products - define reduction for Armadillo matrix 【发布时间】:2017-07-09 05:32:31 【问题描述】:我正在尝试使用对犰狳矩阵求和的 OpenMP 并行化 for 循环。我有以下代码:
#include <armadillo>
#include <omp.h>
int main()
arma::mat A = arma::randu<arma::mat>(1000,700);
arma::mat X = arma::zeros(700,700);
arma::rowvec point = A.row(0);
# pragma omp parallel for shared(A) reduction(+:X)
for(unsigned int i = 0; i < A.n_rows; i++)
arma::rowvec diff = point - A.row(i);
X += diff.t() * diff; // Adding the matrices to X here
我收到此错误:
[Legendre@localhost ~]$ g++ test2.cpp -o test2 -O2 -larmadillo -fopenmp
test2.cpp: In function ‘int main()’:
test2.cpp:11:52: error: user defined reduction not found for ‘X’
我阅读了有关定义约简的内容,但我还没有找到使用犰狳矩阵的示例。在我的案例中,定义犰狳矩阵减少的最佳方法是什么?
【问题讨论】:
【参考方案1】:这些缩减仅适用于内置类型(double
、int
等)。因此,您必须自己进行还原,这很简单。只需将每个线程的结果累积在一个线程局部变量中,然后将其添加到临界区中的全局结果中。
#include <armadillo>
#include <omp.h>
int main()
arma::mat A = arma::randu<arma::mat>(1000,700);
arma::mat X = arma::zeros(700,700);
arma::rowvec point = A.row(0);
#pragma omp parallel shared(A)
arma::mat X_local = arma::zeros(700,700);
#pragma omp for
for(unsigned int i = 0; i < A.n_rows; i++)
arma::rowvec diff = point - A.row(i);
X_local += diff.t() * diff; // Adding the matrices to X here
#pragma omp critical
X += X_local;
使用更新的 OpenMP(我认为是 4.5?),您还可以为您的类型声明用户定义的归约。
#include <armadillo>
#include <omp.h>
#pragma omp declare reduction( + : arma::mat : omp_out += omp_in ) \
initializer( omp_priv = omp_orig )
int main()
arma::mat A = arma::randu<arma::mat>(1000,700);
arma::mat X = arma::zeros(700,700);
arma::rowvec point = A.row(0);
#pragma omp parallel shared(A) reduction(+:X)
for(unsigned int i = 0; i < A.n_rows; i++)
arma::rowvec diff = point - A.row(i);
X += diff.t() * diff; // Adding the matrices to X here
【讨论】:
谢谢。为什么在添加到 X_local 之前不需要关键子句?我也尝试了第二个答案,它给了我这个错误(我知道我的矩阵的尺寸没有问题):error: addition: incompatible matrix dimensions: 0x0 and 700x700 terminate called after throwing an instance of 'std::logic_error' what(): addition: incompatible matrix dimensions: 0x0 and 700x700 terminate called recursively Aborted (core dumped)
@Cauchy (1) X_local
对于每个线程都是本地的。指令 #pragma omp for
将 for 循环拆分为每个线程的分区,因此没有两个线程写入同一个 X_local
。 (2) 是的,这是一个错误。我忘记了初始化程序,矩阵默认初始化为 0x0。查看更新后的答案。
@Cauchy 默认情况下,外部作用域中的所有变量都作为共享进入并行区域(循环变量除外),因此您不必显式标记任何共享。以上是关于C++ Armadillo 和 OpenMp:外积求和的并行化 - 定义 Armadillo 矩阵的约简的主要内容,如果未能解决你的问题,请参考以下文章
使用 MPI 和 Armadillo 在 C++ 中进行并行化