Spark 中的 XML 处理
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【中文标题】Spark 中的 XML 处理【英文标题】:Xml processing in Spark 【发布时间】:2015-10-12 09:54:32 【问题描述】:场景: 我的输入将是多个小型 XML,并且我应该将这些 XML 读取为 RDD。与另一个数据集执行连接并形成 RDD 并将输出作为 XML 发送。
是否可以使用 spark 读取 XML,将数据加载为 RDD?如果可能,如何读取 XML。
示例 XML:
<root>
<users>
<user>
<account>1234<\account>
<name>name_1<\name>
<number>34233<\number>
<\user>
<user>
<account>58789<\account>
<name>name_2<\name>
<number>54697<\number>
<\user>
<\users>
<\root>
这将如何加载到 RDD 中?
【问题讨论】:
顺便说一句,您的 XML 根本不是 XML。需要全部替换\` to
/`
嗨帕瓦尼!我从 Spark 上的这个练习开始,我想知道在课堂上更高级的解决方案,你能帮我吗?
【参考方案1】:
是的,有可能,但细节会因您采取的方法而异。
如果文件很小,正如您所提到的,最简单的解决方案是使用SparkContext.wholeTextFiles
加载您的数据。它将数据加载为RDD[(String, String)]
,其中第一个元素是路径,第二个元素是文件内容。然后像在本地模式中一样单独解析每个文件。
对于较大的文件,您可以使用Hadoop input formats。
如果结构简单,您可以使用textinputformat.record.delimiter
拆分记录。你可以找到一个简单的例子here。输入不是 XML,但您应该告诉您如何进行操作
否则 Mahout 提供 XmlInputFormat
终于可以使用SparkContext.textFile
读取文件并在稍后调整分区之间的记录跨度。从概念上讲,它的意思类似于创建滑动窗口或partitioning records into groups of fixed size:
mapPartitionsWithIndex
分区来识别分区间损坏的记录,收集损坏的记录
使用第二个mapPartitionsWithIndex
修复损坏的记录
编辑:
还有相对较新的spark-xml
包,允许您通过标签提取特定记录:
val df = sqlContext.read
.format("com.databricks.spark.xml")
.option("rowTag", "foo")
.load("bar.xml")
【讨论】:
那么,如何修复损坏的记录? 您将如何处理 XML 中的嵌套键并将它们置于同一级别?【参考方案2】:下面是使用HadoopInputFormats
来读取spark 中的XML 数据的方法,如@zero323 所述。
输入数据:
<root>
<users>
<user>
<account>1234<\account>
<name>name_1<\name>
<number>34233<\number>
<\user>
<user>
<account>58789<\account>
<name>name_2<\name>
<number>54697<\number>
<\user>
<\users>
<\root>
读取 XML 输入的代码:
你会在link得到一些罐子
进口:
//---------------spark_import
import org.apache.spark.SparkContext
import org.apache.spark.SparkConf
import org.apache.spark.sql.SQLContext
//----------------xml_loader_import
import org.apache.hadoop.io.LongWritable
import org.apache.hadoop.io.Text
import org.apache.hadoop.conf.Configuration
import org.apache.hadoop.io. LongWritable, Text
import com.cloudera.datascience.common.XmlInputFormat
代码:
object Tester_loader
case class User(account: String, name: String, number: String)
def main(args: Array[String]): Unit =
val sparkHome = "/usr/big_data_tools/spark-1.5.0-bin-hadoop2.6/"
val sparkMasterUrl = "spark://SYSTEMX:7077"
var jars = new Array[String](3)
jars(0) = "/home/hduser/Offload_Data_Warehouse_Spark.jar"
jars(1) = "/usr/big_data_tools/JARS/Spark_jar/avro/spark-avro_2.10-2.0.1.jar"
val conf = new SparkConf().setAppName("XML Reading")
conf.set("spark.serializer", "org.apache.spark.serializer.KryoSerializer")
.setMaster("local")
.set("spark.cassandra.connection.host", "127.0.0.1")
.setSparkHome(sparkHome)
.set("spark.executor.memory", "512m")
.set("spark.default.deployCores", "12")
.set("spark.cores.max", "12")
.setJars(jars)
val sc = new SparkContext(conf)
val sqlContext = new SQLContext(sc)
import sqlContext.implicits._
// ---- loading user from XML
// calling function 1.1
val pages = readFile("src/input_data", "<user>", "<\\user>", sc)
val xmlUserDF = pages.map tuple =>
val account = extractField(tuple, "account")
val name = extractField(tuple, "name")
val number = extractField(tuple, "number")
User(account, name, number)
.toDF()
println(xmlUserDF.count())
xmlUserDF.show()
功能:
def readFile(path: String, start_tag: String, end_tag: String,
sc: SparkContext) =
val conf = new Configuration()
conf.set(XmlInputFormat.START_TAG_KEY, start_tag)
conf.set(XmlInputFormat.END_TAG_KEY, end_tag)
val rawXmls = sc.newAPIHadoopFile(
path, classOf[XmlInputFormat], classOf[LongWritable],
classOf[Text], conf)
rawXmls.map(p => p._2.toString)
def extractField(tuple: String, tag: String) =
var value = tuple.replaceAll("\n", " ").replace("<\\", "</")
if (value.contains("<" + tag + ">") &&
value.contains("</" + tag + ">"))
value = value.split("<" + tag + ">")(1).split("</" + tag + ">")(0)
value
输出:
+-------+------+------+
|account| name|number|
+-------+------+------+
| 1234|name_1| 34233|
| 58789|name_2| 54697|
+-------+------+------+
获得的结果在数据帧中,您可以像这样根据您的要求将它们转换为 RDD->
val xmlUserRDD = xmlUserDF.toJavaRDD.rdd.map x =>
(x.get(0).toString(),x.get(1).toString(),x.get(2).toString())
请评估一下,如果它对你有帮助的话。
【讨论】:
【参考方案3】:这会对你有所帮助。
package packagename;
import org.apache.spark.sql.Dataset;
import org.apache.spark.sql.Row;
import org.apache.spark.sql.SQLContext;
import org.apache.spark.sql.SparkSession;
import com.databricks.spark.xml.XmlReader;
public class XmlreaderSpark
public static void main(String arr[])
String localxml="file path";
String booksFileTag = "user";
String warehouseLocation = "file:" + System.getProperty("user.dir") + "spark-warehouse";
System.out.println("warehouseLocation" + warehouseLocation);
SparkSession spark = SparkSession
.builder()
.master("local")
.appName("Java Spark SQL Example")
.config("spark.some.config.option", "some-value").config("spark.sql.warehouse.dir", warehouseLocation)
.enableHiveSupport().config("set spark.sql.crossJoin.enabled", "true")
.getOrCreate();
SQLContext sqlContext = new SQLContext(spark);
Dataset<Row> df = (new XmlReader()).withRowTag(booksFileTag).xmlFile(sqlContext, localxml);
df.show();
你需要在你的 POM.xml 中添加这个依赖:
<dependency>
<groupId>com.databricks</groupId>
<artifactId>spark-xml_2.10</artifactId>
<version>0.4.0</version>
</dependency>
您的输入文件格式不正确。
谢谢。
【讨论】:
【参考方案4】:对于简单的情况有两个不错的选择:
wholeTextFiles
。在您的 XML 解析器中使用 map 方法,它可以是 Scala XML 拉式解析器(编码速度更快)或 SAX 拉式解析器(性能更好)。
Hadoop streaming XMLInputFormat
必须定义开始和结束标签 <user>
</user>
来处理它,但是,它会为每个用户标签创建一个分区
spark-xml package
也是一个不错的选择。
使用所有选项,您只能处理简单的 XML,这些 XML 可以解释为具有行和列的数据集。
但是,如果我们让它变得有点复杂,这些选项就没有用了。
例如,如果您还有一个实体:
<root>
<users>
<user>...</users>
<companies>
<company>...</companies>
</root>
现在您需要生成 2 个 RDD 并更改解析器以识别 <company>
标记。
这只是一个简单的例子,但 XML 可能要复杂得多,您需要包含越来越多的更改。
为了解决这种复杂性,我们在 Apache Spark 之上构建了 Flexter,以减轻 processing XML files on Spark 的痛苦。我还建议阅读converting XML on Spark to Parquet。后一篇文章还包含一些代码示例,展示了如何使用 SparkSQL 查询输出。
免责声明:我为 Sonra 工作
【讨论】:
我建议你添加一个免责声明,你是这家公司的联合创始人。以上是关于Spark 中的 XML 处理的主要内容,如果未能解决你的问题,请参考以下文章
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多个NameNode的HDFS集群切换HA后,Spark应用变得很慢的处理办法