犰狳矢量类上的 RcppArmadillo 样本
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【中文标题】犰狳矢量类上的 RcppArmadillo 样本【英文标题】:RcppArmadillo sample on armadillo vector classes 【发布时间】:2017-04-11 17:58:45 【问题描述】:我们一直在使用RcppArmadillo
中的sample
函数来随机采样NumericVector
对象。然而,我们注意到不可能在犰狳类型(vec
或uvec
)上使用相同的函数。我们查看了 sample.h
文件中的函数定义,它看起来像是一个模板化函数,应该能够使用这些类型,但我们无法弄清楚如何让它与 Armadillo 类一起使用而不做来自Rcpp
库的NumericVector
或IntegerVector
类型的大量转换。
例如,我们将这个函数写在一个名为 try.cpp
的文件中。
// [[Rcpp::depends(RcppArmadillo)]]
#include <RcppArmadillo.h>
#include <RcppArmadilloExtensions/sample.h>
using namespace arma;
using namespace Rcpp;
// [[Rcpp::export]]
arma::uvec sample_index(const int &size)
arma::uvec sequence = linspace<uvec>(0, size-1, size);
arma::uvec out = sample(sequence, size, false);
return out;
运行上面的代码会产生以下错误:
src/try.cpp|11 col 22 error| no matching function for call to 'sample' [cpp/gcc]
~/Library/R/3.3/library/Rcpp/include/Rcpp/sugar/functions/sample.h|401 col 1 error| note: candidate function not viable: no known conversion from 'arma::uvec' (aka 'Col<unsigned int>') to 'int' for 1st argument [cpp/gcc]
~/Library/R/3.3/library/Rcpp/include/Rcpp/sugar/functions/sample.h|437 col 1 error| note: candidate template ignored: could not match 'Vector' against 'Col' [cpp/gcc]
对此的任何帮助将不胜感激:)
【问题讨论】:
你能快速确认RcppArmadillo的版本是最新的吗?sessionInfo()
>=7.6
sessionInfo()
的输出:RcppArmadillo_0.7.700.0.0
作为第一步(防御),撤消 using namespace ...
,因为我们现在有 两个 sample
函数。
尝试注释掉两个using namespace
行并得到更多错误。还尝试了每个注释中的一个,但仍然出现错误。但是,特别是在所有内容之前输入每个命名空间,我能够让它工作,但是 sample
函数需要被称为 Rcpp::RcppArmadillo::sample(sequence, size, false)
。
【参考方案1】:
万一以后有人遇到这个问题,这个问题似乎与正在使用的命名空间中sample
函数的多个定义有关。专门键入定义所需功能的名称空间可以解决问题。特别是sample
函数需要从Rcpp::RcppArmadillo
调用。
以下代码可以按需要工作。
// [[Rcpp::depends(RcppArmadillo)]]
#include <RcppArmadillo.h>
#include <RcppArmadilloExtensions/sample.h>
// [[Rcpp::export]]
arma::uvec sample_index(const int &size)
arma::uvec sequence = arma::linspace<arma::uvec>(0, size-1, size);
arma::uvec out = Rcpp::RcppArmadillo::sample(sequence, size, false);
return out;
【讨论】:
请删除文件顶部的namespace
声明。你没有使用它们。这可能会咬到其他复制和粘贴代码的人。
我会将其改写为:“鉴于现在在 Rcpp
和 RcppArmadillo
命名空间中都有两个 sample()
实现(后者仍然是可选的),您需要更加明确关于您选择的内容。”
链接到相关问题:***.com/q/44060134/1169233以上是关于犰狳矢量类上的 RcppArmadillo 样本的主要内容,如果未能解决你的问题,请参考以下文章
犰狳+NVBLAS 变成 RcppArmadillo+NVBLAS