Cython cimport 找不到 .pxd 模块
Posted
技术标签:
【中文标题】Cython cimport 找不到 .pxd 模块【英文标题】:Cython cimport cannot find .pxd module 【发布时间】:2018-02-05 11:16:59 【问题描述】:已解决,请参阅编辑 #3
假设一个包的结构如下:
Some_Package/
some_package/
__init__.py
core/
__init__.py
definition.pxd
helper/
__init__.py
helper.pxd
helper.pyx
setup.py
definition.pxd
我在哪里:
import numpy as np
cimport numpy as np
# ...
ctypedef np.int32_t INT_t
在helper.pxd
我有:
cimport some_package.core.definition
from some_package.core.definition cimport INT_t
# ...
在helper.pyx
我没有cimport
任何东西。我将setup.py
配置为:
ext_modules=cythonize('./some_package/helper/helper.pyx', include_dirs=['.', './some_package/core'])
现在我的问题是python setup.py build_ext --inplace
我可以成功构建到.so
,但是当我尝试import some_package.helper.helper
时,我得到了一个ImportError
:
ImportError: No module named "some_package.helper.helper"
我查看了helper.cpp
并发现了一些类似的行:
__pyx_t_1 = __Pyx_ImportModule("some_package.core.definition"); if (!__pyx_t_1) __PYX_ERR(0, 1, __pyx_L1_error)
我猜这可能与导入路径有关,但我无法发现问题所在。所有__init__.py
都是空的,我在每个文件中都导入了absolute_import
。我也改了include_dirs
,但还是不行。
编辑#1
根据documentation,include_dirs
添加到*.pxd
搜索路径。所以我也尝试将helper.pxd
中的cimport
语句改成:
cimport definition
from definition cimport INT_t
这一次,cython
无法编译:"definition.pxd" not found
。但是,它应该在搜索路径中。
编辑#2
快速锻炼是在core/
中添加一个空的definition.pyx
,然后将扩展配置为:
extensions = [
Extension("some_package.core.definition", ["some_package/core/definition.pyx"])
Extension("some_package.helper.helper", ["some_package/helper/helper.pyx"])
]
然后在setup.py
:
ext_modules=cythonize(extensions)
现在cimport some_package.core.definition
在helper.pxd
工作。
然而,这并不优雅。
编辑 3
我终于发现我忽略了一些行,例如:
cdef INT_t some_int = 1
但是,在.pxd
文件中,不能有任何可执行代码。在这种情况下,Cython
似乎将其视为一个包,而不是.pyx
文件。
可能有两种解决方法:
cdef extern
来自 C
标头。
总结内联函数。
【问题讨论】:
等等,你给你的包裹打电话src
?我建议先使用不同的名称,因为这只会导致命名冲突。
@MSeifert 谢谢! src
用于说明目的(因为我发现它很常见)。事实上,src
被命名为 some_package
并被放在名为 Some_Package
的根目录中。
是的,它是src
文件的目录。最后,您从那里获取代码,但将其构建为实际包中的扩展。如果概念发生了变化,那就有点令人困惑了。 :-]
@MSeifert 好的,我已经修复了它们。谢谢。 :)
【参考方案1】:
我忽略了一些行:
cdef INT_t some_int = 1
但是,在.pxd
文件中,不能有任何可执行代码。在这种情况下,Cython
似乎将其视为一个包,而不是 .pyx
文件。
可能有两种解决方法:
cdef extern
来自 C
标头。
总结内联函数。
【讨论】:
以上是关于Cython cimport 找不到 .pxd 模块的主要内容,如果未能解决你的问题,请参考以下文章
Cython 元类 .pxd:我应该如何实现 `__eq__()`?