R上的绘图问题（使用热图）

Posted 2023-04-13

【中文标题】R上的绘图问题（使用热图）

【英文标题】：plotting issue on R (using heatmaps)

【发布时间】：2015-10-18 21:00:20

【问题描述】：

我有一个要绘制的矩阵，我正在使用以下几行：

library(lattice)
levelplot(cont.freq)

我想摆脱剧情中的黑色东西？我想使用矩阵的行名和列名进行 x&y 标记。但是我不知道如何以一种好的方式来表示它们。

顺便说一下，矩阵是1284x1284..

【问题讨论】：

你能展示 cont.freq 的样本和你的整个代码吗？

例如：a=rep(0:1,5) b=rep(0,10) c=rep(1,10) cont.freq=matrix(cbind(a,b,c ),nrow=10,ncol=10) 连续频率

【参考方案1】：

以下作品：

x_at <- pretty(seq_len(nrow(cont.freq)))
y_at <- pretty(seq_len(ncol(cont.freq)))
levelplot(cont.freq, rm.na = TRUE, scales=list(y=list(at=y_at),x=list(at=x_at)), xlab="Residue ID", ylab="Residue ID", main="Contact Frequency")