什么是 HPC 内核 (MPI-OpenMP)？

Posted 2023-03-27

【中文标题】什么是 HPC 内核 (MPI-OpenMP)？

【英文标题】：What is a HPC kernel (MPI-OpenMP)?

【发布时间】：2019-08-25 02:16:23

【问题描述】：

用简单的语言来说，内核是什么以及它的用途是什么？ 我看过并行化代码，例如：

#!/bin/bash 
#SBATCH --job-name=bt-mz 
#SBATCH --output=bt-mz_%j.out 
#SBATCH --error=bt-mz_%j.err 
#SBTACH --nodes=1 
#SBATCH --ntasks=12 
#SBATCH --cpus-per-task=4    
#SBATCH --qos=debug

#MPI + OpenMP 
export NAS_PATH=$HOME/bin 
export OMP_NUM_THREADS=4

srun $NAS_PATH/bt-mz.C.12 srun $NAS_PATH/sp-mz.C.12

其中 sp-mz.C.12 和 bt-mz.C.12 被称为内核 (BT-MZ-MPI SP)。这些是什么？

【问题讨论】：

这是一个高度模糊的术语，它高度依赖于上下文。这就像问“什么是节点？”。

BT-MZ-MPI SP 是我所知道的最先进的内核@Zulan

【参考方案1】：

这是一个benchmark，包括许多组件，其中一些与解决nonlinear PDEs（BT、SP、LU）的合成系统有关。解决此类偏微分方程涉及所谓的kernels，它们基本上是具有特定属性的函数。此类函数还用于概率密度估计、信号分析等。

【讨论】：

Green 的内核类比对我来说似乎有点牵强。我想说我们称之为kernel，因为它是解决方案过程的核心。求解 PDE 涉及许多步骤，求解线性代数方程组是计算量最大的部分，David Bailey 正确地将其称为内核。尤其是所有的 NAS 基准测试程序，不仅是与 PDE 相关的程序都是内核。