在 R 中使用线性插值添加缺失的 xts/zoo 数据

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【中文标题】在 R 中使用线性插值添加缺失的 xts/zoo 数据【英文标题】:Add missing xts/zoo data with linear interpolation in R 【发布时间】:2013-04-07 08:48:57 【问题描述】:

我确实有丢失数据的问题,但我没有 NA - 否则会更容易处理...

我的数据如下所示:

time, value
2012-11-30 10:28:00, 12.9
2012-11-30 10:29:00, 5.5
2012-11-30 10:30:00, 5.5
2012-11-30 10:31:00, 5.5
2012-11-30 10:32:00, 9
2012-11-30 10:35:00, 9
2012-11-30 10:36:00, 14.4
2012-11-30 10:38:00, 12.6

如您所见 - 缺少一些分钟值 - 它是 xts/zoo,所以我使用 as.POSIXct... 将日期设置为索引。如何添加缺少的时间步来获得完整的 ts?我想用线性插值填充缺失值。

感谢您的帮助!

【问题讨论】:

得到了一个可能的答案:***.com/questions/15114834/… 确实适用于动物园 - 但之后我可以回到 xts。 “错误”值仍然存在问题 - 如何过滤并设置为 NA?谢谢! 另见***.com/questions/11897169/… 【参考方案1】:

您可以使用包含所有日期的向量merge 您的数据。之后,您可以使用na.approx 填写空白(本例中为NA)。

data1 <-read.table(text="time, value
2012-11-30-10:28:00, 12.9
2012-11-30-10:29:00, 5.5
2012-11-30-10:30:00, 5.5
2012-11-30-10:31:00, 5.5
2012-11-30-10:32:00, 9
2012-11-30-10:35:00, 9
2012-11-30-10:36:00, 14.4
2012-11-30-10:38:00, 12.6", header = TRUE, sep=",", as.is=TRUE)
times.init <-as.POSIXct(strptime(data1[,1], '%Y-%m-%d-%H:%M:%S'))
data2 <-zoo(data1[,2],times.init)
data3 <-merge(data2, zoo(, seq(min(times.init), max(times.init), "min")))
data4 <-na.approx(data3)

【讨论】:

【参考方案2】:

感谢P Lapointe 的精彩回答。此外,如果您还利用了 na.approx 中的 'xout' 参数,则不再需要进行合并:

data1 <-read.table(text="time, value
2012-11-30-10:28:00, 12.9
2012-11-30-10:29:00, 5.5
                   2012-11-30-10:30:00, 5.5
                   2012-11-30-10:31:00, 5.5
                   2012-11-30-10:32:00, 9
                   2012-11-30-10:35:00, 9
                   2012-11-30-10:36:00, 14.4
                   2012-11-30-10:38:00, 12.6", header = TRUE, sep=",", as.is=TRUE)
times.init <-as.POSIXct(strptime(data1[,1], '%Y-%m-%d-%H:%M:%S'))
data2 <-zoo(data1[,2],times.init)
data2
data4 <- na.approx(object=data2, 
          xout=seq(min(times.init), max(times.init), "min"))

【讨论】:

以上是关于在 R 中使用线性插值添加缺失的 xts/zoo 数据的主要内容,如果未能解决你的问题,请参考以下文章

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