在 Ubuntu 18.04 VM (VirtualBox) 上运行的 Shiny Server 应用程序存在 OpenStreetMaps 问题（Java 错误）

Posted 2023-03-24

【中文标题】在 Ubuntu 18.04 VM (VirtualBox) 上运行的 Shiny Server 应用程序存在 OpenStreetMaps 问题（Java 错误）

【英文标题】：Shiny Server app Running on Ubuntu 18.04 VM (VirtualBox) having issues with OpenStreetMaps (Java error)

【发布时间】：2020-06-22 14:23:02

【问题描述】：

我是 Shiny Server 的新手，对 Linux 不太熟悉，所以请耐心等待。

我在 Ubuntu 18.04 上运行 Shiny Server，它是一个虚拟机 (VirtualBox)。我在我的应用程序中使用了 OpenStreetMaps 包，它使用了 rJava 包。我在安装 rJava 和 OpenStreetMaps 包时遇到了一些麻烦，但在使用以下终端命令手动安装 Java 运行时环境和 Java 开发工具包后终于进行了管理：

* sudo apt update
* sudo apt install default-jre
* sudo apt install default-jdk
* sudo R CMD javareconf
* sudo su - -c "R -e \"install.packages('rJava', repos='https://cran.rstudio.com/')\""
* sudo su - -c "R -e \"install.packages('OpenStreetMap', repos='https://cran.rstudio.com/')\""

所有包都在一个全局库 /usr/local/lib/R/site-library 中。

通过 Shiny Server 运行应用程序时，我得到的错误是：

错误：发生错误。检查您的日志或联系应用作者进行澄清。

通过 RStudio 服务器运行应用程序时出现以下错误：

.jcall("java/lang/Class", "Ljava/lang/Class;", "forName", cl, 中的错误： RcallMethod: 无法确定对象类

.jfindClass(as.character(class)) 中的错误： Java Exception .jfindClass(as.character(class))new("jobjRef", jobj = , jclass= "java/lang/Throwable")

警告：.tryJava 中的错误：无法加载 Java 类。很可能是因为您的 R 安装未设置 Java。

以下是一些故障排除提示：

安装 Java（对于 mac，请考虑从 https://support.apple.com/kb/DL1572?locale=en_US 安装 java 1.6）

运行 R CMD javareconf 在终端。如果您使用的是 Mac OS X >= 10.7，您可能想尝试 R CMD javareconf JAVA_CPPFLAGS=-I/System/Library/Frameworks/JavaVM.framework/Headers 而是。

188：停止

187: .tryJava

186: 打开地图

185：[/home/amsp/Documents/MobileLab/app.R#326]

183: .func

180：上下文函数

179: 环境$runWith

172: ctx$run

171: 自我$.updateValue

169: 地图.latlon

167：渲染图 [/home/amsp/Documents/MobileLab/app.R#347]

165: 函数

125: 绘图

111: 反应式：plotObj

95:drawReactive

82: origRenderFunc

81: 输出$plot_map1

1：运行应用程序

我尝试运行 Run R CMD javareconf 并没有解决这个问题。

检查 Java 产量：

java-版本

openjdk 版本“11.0.6” 2020-01-14

OpenJDK 运行时环境（build 11.0.6+10-post-Ubuntu-1ubuntu118.04.1）

OpenJDK 64 位服务器虚拟机（build 11.0.6+10-post-Ubuntu-1ubuntu118.04.1，混合模式，共享）

javac-版本

javac 11.0.6

我想知道这可能是权限问题吗？任何帮助将不胜感激！谢谢！

【参考方案1】：

结果整个事情看起来像是一个版本控制问题。 OpenStreetMap 似乎不喜欢 Java 11，但大多数东西都与 8 兼容。

重新启动 VM 以获得一个干净的启动，并且在执行之前不要尝试访问 Shiny 或 Rstudio。删除 Java 11 并安装 Java 8

sudo apt-get remove openjdk-11*

sudo apt-get install openjdk-8*

sudo R CMD javareconf

sudo service rstudio-server restart

sudo service shiny-server restart

然后访问 Shiny 并且它起作用了。