对 GGplot2 使用反应式数据集?
Posted
技术标签:
【中文标题】对 GGplot2 使用反应式数据集?【英文标题】:Using Reactive Dataset for GGplot2? 【发布时间】:2019-02-24 10:03:39 【问题描述】:我正在尝试使用 ggplot2 而不是基本 R 的绘图函数来渲染绘图。
但是,我在 ggplot2 中使用响应式数据集时遇到了一些问题。
以下是与 base R 的绘图一起使用的代码:
library(shiny)
library(ggplot2)
# Define UI for application that draws a histogram
ui <- fluidPage(
# Application title
titlePanel("Javier Test"),
# Sidebar with a slider input for number of bins
sidebarLayout(
sidebarPanel(
# Input: Select a file ----
fileInput('file1', 'Choose CSV File',
accept=c('text/csv',
'text/comma-separated-values,text/plain',
'.csv')),
# Horizontal line ----
tags$hr(),
checkboxInput('header', 'Header', TRUE),
radioButtons('sep', 'Separator',
c(Comma=',',
Semicolon=';',
Tab='\t'),
','),
radioButtons('quote', 'Quote',
c(None='',
'Double Quote'='"',
'Single Quote'="'"),
'"'),
#implementing dropdown column
selectInput('xcol', 'X Variable', ""),
selectInput('ycol', 'Y Variable', "", selected = "")),
# Show a plot of the generated distribution
mainPanel(
# Output: Data file ----
plotOutput('MyPlot')
)
)
)
# Define server logic required to draw a histogram
server <- shinyServer(function(input, output, session)
# added "session" because updateSelectInput requires it
data <- reactive(
req(input$file1) ## ?req # require that the input is available
inFile <- input$file1
# tested with a following dataset: write.csv(mtcars, "mtcars.csv")
# and write.csv(iris, "iris.csv")
df <- read.csv(inFile$datapath, header = input$header, sep = input$sep,
quote = input$quote)
# Update inputs (you could create an observer with both updateSel...)
# You can also constraint your choices. If you wanted select only numeric
# variables you could set "choices = sapply(df, is.numeric)"
# It depends on what do you want to do later on.
updateSelectInput(session, inputId = 'xcol', label = 'X Variable',
choices = names(df), selected = names(df))
updateSelectInput(session, inputId = 'ycol', label = 'Y Variable',
choices = names(df), selected = names(df)[2])
return(df)
)
output$MyPlot <- renderPlot(
x <- data()[,c(input$xcol, input$ycol)]
plot(x)
)
)
shinyApp(ui, server)
这是我试图改为 ggplot2 渲染图的部分:
output$MyPlot <- renderPlot(
ggplot(data, aes(x=input$xcol, y=input$ycol)) + geom_point()
)
错误:ggplot2 不知道如何处理 reactiveExpr/reactive 类的数据
知道如何为 ggplot2 使用反应式数据集吗?
非常感谢!
更新
这是代码!我已经想通了。不是很好,有没有更好的表示方式?
output$MyPlot <- renderPlot(
x <- data()[,c(input$xcol, input$ycol)]
ggplot(x, aes(x=x[,1], y=x[,2])) + geom_point()
)
【问题讨论】:
嗨@SalmanLashkarara,是的,我可以将数据加载到df中。如果您使用基本 R 绘图运行第一个代码,则该应用程序可以运行。只是想用 ggplot2 代替! 是的,这是正确的。代码就像我提到的那样工作。如果将其插入 R 并使用任何 .csv 文件,它是可重现的。只是不确定我应该为 ggplot2 使用的参数 @SalmanLashkarara 我添加了正确的代码!去看看吧,希望可以改进!看起来很糟糕 我得到了答案 【参考方案1】:现在效果很好:
output$MyPlot <- renderPlot(
x <- data()[,c(input$xcol, input$ycol)]
ggplot(x, aes(x=data()[,c(input$xcol)],
y=data()[,c(input$ycol)])) + geom_point()
)
【讨论】:
【参考方案2】:您可以使用ggplot
包中的aes_string
函数代替aes
函数,而不是在renderPlot
函数中多次设置数据。所以一个班轮解决方案将是:
output$MyPlot <- renderPlot(
ggplot(data = data(), aes_string(x = input$xcol, y = input$ycol)) + geom_point()
)
【讨论】:
哇这太棒了!非常感谢您分享您的知识! 乐于助人:)以上是关于对 GGplot2 使用反应式数据集?的主要内容,如果未能解决你的问题,请参考以下文章
使用 R 中 ggplot2 的 facet_wrap 功能对多个数据集进行箱线图比较?
R语言ggplot2可视化:ggplot2使用geom_mark_ellipse函数进行椭圆形圈定(注释)特定的数据簇或组(只为椭圆形圈定的数据集配置色彩)
默认数据集示例 mtcars 和 ggplot2 中的“错误:提供给离散比例的连续值”