如何在 python 虚拟环境中导入 scikit-learn？

Posted 2023-03-12

【中文标题】如何在 python 虚拟环境中导入 scikit-learn？

【英文标题】：How to import scikit-learn in python virtual environment?

【发布时间】：2016-02-20 22:12:57

【问题描述】：

问题

我正在尝试在虚拟环境中使用 scikit-learn，但无法运行。

因此，例如，我转到一个项目文件夹并安装 NumPy、SciPy 和 scikit-learn

virtualenv venv source venv/bin/activate pip install numpy pip install scipy pip install scikit-learn

然后我打开 python 并尝试导入它们中的每一个。

import numpy import scipy import sklearn

NumPy 和 SciPy 导入正常，但是当我尝试导入时，我收到错误消息 Library not loaded: @rpath/./libgfortran.3.dylib。

我在安装过程中缺少什么吗？

完整的错误信息： Traceback (most recent call last): File "<stdin>", line 1, in <module> File "/Users/Peter/git/dataSandbox/flaskApps/sfSalary/venv/lib/python2.7/site-packages/sklearn/__init__.py", line 57, in <module> from .base import clone File "/Users/Peter/git/dataSandbox/flaskApps/sfSalary/venv/lib/python2.7/site-packages/sklearn/base.py", line 11, in <module> from .utils.fixes import signature File "/Users/Peter/git/dataSandbox/flaskApps/sfSalary/venv/lib/python2.7/site-packages/sklearn/utils/__init__.py", line 11, in <module> from .validation import (as_float_array, File "/Users/Peter/git/dataSandbox/flaskApps/sfSalary/venv/lib/python2.7/site-packages/sklearn/utils/validation.py", line 16, in <module> from ..utils.fixes import signature File "/Users/Peter/git/dataSandbox/flaskApps/sfSalary/venv/lib/python2.7/site-packages/sklearn/utils/fixes.py", line 324, in <module> from scipy.sparse.linalg import lsqr as sparse_lsqr File "/Users/Peter/git/dataSandbox/flaskApps/sfSalary/venv/lib/python2.7/site-packages/scipy/sparse/linalg/__init__.py", line 109, in <module> from .isolve import * File "/Users/Peter/git/dataSandbox/flaskApps/sfSalary/venv/lib/python2.7/site-packages/scipy/sparse/linalg/isolve/__init__.py", line 6, in <module> from .iterative import * File "/Users/Peter/git/dataSandbox/flaskApps/sfSalary/venv/lib/python2.7/site-packages/scipy/sparse/linalg/isolve/iterative.py", line 7, in <module> from . import _iterative ImportError: dlopen(/Users/Peter/git/dataSandbox/flaskApps/sfSalary/venv/lib/python2.7/site-packages/scipy/sparse/linalg/isolve/_iterative.so, 2): Library not loaded: @rpath/./libgfortran.3.dylib Referenced from: /Users/Peter/git/dataSandbox/flaskApps/sfSalary/venv/lib/python2.7/site-packages/scipy/sparse/linalg/isolve/_iterative.so Reason: image not found

编辑： 这是使用 sklearn 托管 Heroku 应用程序的一些故障排除。

【参考方案1】：

我强烈建议反对为 NumPy/SciPy/Scikit-learn 和其他包含编译代码的包使用虚拟环境。虚拟环境可以很好地处理纯 Python 依赖项，但对于具有 Python 外部依赖项的编译扩展，它们可能会以意想不到的方式失败（如您所见）。

如果您想使用不同版本的 Python 包（包括已编译的扩展）管理多个环境，最好的工具可能是 conda，尤其是 conda environments。

有了它，你可以运行以下命令：

$ conda create -n myenv python=3.4 numpy scipy scikit-learn
$ source activate myenv
(myenv) $ python
Python 3.4.3
>>> import sklearn

你会很高兴的。

【讨论】：

谢谢@jakevdp！ Upvote 待定...是的，切换到 conda 环境是关键。对于任何可能感兴趣的人，这是为了在 Heroku 应用程序中使用 sklearn。结果发现另一个要求是更新 LD_LIBRARY_PATH。按照这个link，你应该很高兴

不错的答案，但是如果我想留在虚拟环境中而不切换到 conda 怎么办？

那么由你来手动管理你的虚拟环境与非python系统依赖的交互。