pygraphviz，ImportError：未定义符号：Agundirected

Posted 2023-03-12

【中文标题】pygraphviz，ImportError：未定义符号：Agundirected

【英文标题】：pygraphviz, ImportError: undefined symbol: Agundirected

【发布时间】：2015-12-29 09:13:06

【问题描述】：

import pygraphviz

Traceback (most recent call last):
File "<stdin>", line 1, in <module>
File "/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/pygraphviz/__init__.py", line 58, in <module>
    from .agraph import AGraph, Node, Edge, Attribute, ItemAttribute, DotError
File "/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/pygraphviz/agraph.py", line 26, in <module>
    from . import graphviz as gv
File "/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/pygraphviz/graphviz.py", line 28, in <module>
    _graphviz = swig_import_helper()
File "/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/pygraphviz/graphviz.py", line 24, in swig_import_helper
    _mod = imp.load_module('_graphviz', fp, pathname, description)
ImportError: /usr/local/lib/python2.7/dist-packages/pygraphviz/_graphviz.so: undefined symbol: Agundirected

我已经试过了

pip install pygraphviz --install-option="--include-path=/usr/include/graphviz" --install-option="--library-path=/usr/lib/graphviz/"

我也试过这个答案，但还是不行

Python does not see pygraphviz

【问题讨论】：

该错误是由于graphviz库未能加载动态库导致-检查库是否确实存在，如果graphviz目录不存在，请务必运行ldconfig更新动态库的路径.

你能帮我检查一下这个库是否真的存在吗？还有如何运行 idconfig

@midhunj 使用sudo ldconfig。它仍然对我不起作用。

我试过 ldconfig 还是不行。

当我尝试导入graphviz时，它工作正常。那么任何人都可以解释为什么pygraphviz没有被导入？

【参考方案1】：

首先，卸载你当前的模块：

 pip uninstall pygraphviz

然后检查您的路径：

 pkg-config --libs-only-L libcgraph
 pkg-config --cflags-only-I libcgraph

该命令应该告诉库的路径，例如：

-I/usr/include/graphviz  

然后，使用上述输出中的路径，[在您的 virtualenv 中] 运行命令：

pip install pygraphviz --install-option="--include-path=/usr/include/graphviz" --install-option="--library-path=/usr/lib/graphviz/"

来源：https://github.com/pygraphviz/pygraphviz/issues/71

【讨论】：

install-option 两次？为什么会这样？

别管pkg-config --libs-only-L libcgraph的输出。在我的情况下（Ubuntu 16.04），该命令返回一个 emtpy 行，这正是 pip 没有检测到 graphviz 库的正确路径的原因。在我的情况下，我刚刚安装使用：pip install pygraphviz --install-option="--include-path=/usr/include/graphviz" --install-option="--library-path=/usr/lib/graphviz/" 然后它工作。

【参考方案2】：

在 Ubuntu 14.04 上 @Martin0x777 的 answer 对我不起作用。于是我从github instructions 安装了pygraphviz，错误消失了：

git clone https://github.com/pygraphviz/pygraphviz.git
cd pygraphviz
python setup.py install