loadmat python内存错误

Posted 2023-03-12

【中文标题】loadmat python内存错误

【英文标题】：loadmat python memory error

【发布时间】：2012-10-31 12:19:24

【问题描述】：

我是 Python 新手，我想向其中导入一个大小为 850M 的 matlab 结构。我使用“loadmat”，但出现内存错误：

return self._matrix_reader.array_from_header(header, process) 文件“mio5_utils.pyx”，第 624 行，在 scipy.io.matlab.mio5_utils.VarReader5.array_from_header (scipy\io\matlab\mio5_utils.c:5401) 文件“mio5_utils.pyx”，第 653 行，在 scipy.io.matlab.mio5_utils.VarReader5.array_from_header (scipy\io\matlab\mio5_utils.c:4849) 文件“mio5_utils.pyx”，第 706 行，在 scipy.io.matlab.mio5_utils.VarReader5.read_real_complex (scipy\io\matlab\mio5_utils.c:5578) 文件“mio5_utils.pyx”，第 424 行，在 scipy.io.matlab.mio5_utils.VarReader5.read_numeric (scipy\io\matlab\mio5_utils.c:3439) 文件“mio5_utils.pyx”，第 360 行，在 scipy.io.matlab.mio5_utils.VarReader5.read_element (scipy\io\matlab\mio5_utils.c:3164) 文件“streams.pyx”，第 76 行，在 scipy.io.matlab.streams.GenericStream.read_string (scipy\io\matlab\streams.c:1408) 内存错误

我在具有 3.5G RAM 的 Windows XP 上运行 python 3.2。这是我的代码：

from scipy.io import matlab as mio
mat = mio.loadmat(DIR + '/input.mat')

您能帮我并告诉我应该怎么做才能解决这个问题吗？

【参考方案1】：

您可能正在使用 32 位 Python。所有 32 位程序的最大限制（这个问题实际上与 Python 或 Scipy 无关）是 2GB --- 你在机器上安装了多少内存并不重要。在实践中，大型对象的分配已经开始失败，due to virtual memory fragmentation（根据经验，大约 800 MB 似乎是预期的）。

解决方案是使用 64 位 Python 而不是 32 位 Python。为此，您需要一个 64 位操作系统，例如 Windows 7 或 Linux。

但是，如果您坚持使用 32 位版本的 Windows XP，有 some tricks 在 32 位系统上将 32 位内存限制提高到 3GB，这可能会有所帮助。