WEKA - 将实例分配给 kmeans.buildClusterer 时出错

Posted 2023-03-12

【中文标题】WEKA - 将实例分配给 kmeans.buildClusterer 时出错

【英文标题】：WEKA - Error on assigning Instances to kmeans.buildClusterer

【发布时间】：2014-05-26 17:03:59

【问题描述】：

我是 Weka 框架的新手。到目前为止，我发现它非常简单且易于使用和理解，但我面临一些我无法理解的问题。我正在尝试从 csv 文件中对数据集进行聚类。我有一个使用 kmeans 对数据集进行聚类的类，据我在 Weka 的 wiki (http://weka.wikispaces.com/) 中阅读，该类工作正常。唯一的问题是它正在读取 arff 文件，而我需要从 csv 文件中读取。到目前为止，一切都很好。问题是当我将数据集中的实例分配给 kmeans.buildClusterer(data) 方法时。然后我得到以下异常：

Exception in thread "main" java.lang.NoClassDefFoundError: org/pentaho/packageManagement/PackageManager 
        at weka.core.WekaPackageManager.<clinit>(WekaPackageManager.java:86) 
        at weka.core.Utils.readProperties(Utils.java:142) 
        at weka.core.Capabilities.<init>(Capabilities.java:261) 
        at weka.clusterers.AbstractClusterer.getCapabilities(AbstractClusterer.java:179) 
        at weka.clusterers.SimpleKMeans.getCapabilities(SimpleKMeans.java:289) 
        at weka.clusterers.SimpleKMeans.buildClusterer(SimpleKMeans.java:441) 
        at weka_examples.ClusteringDemo.<init>(ClusteringDemo.java:48) 
        at weka_examples.ClusteringDemo.main(ClusteringDemo.java:70) 
Caused by: java.lang.ClassNotFoundException: org.pentaho.packageManagement.PackageManager 
        at java.net.URLClassLoader$1.run(URLClassLoader.java:366) 
        at java.net.URLClassLoader$1.run(URLClassLoader.java:355) 
        at java.security.AccessController.doPrivileged(Native Method) 
        at java.net.URLClassLoader.findClass(URLClassLoader.java:354) 
        at java.lang.ClassLoader.loadClass(ClassLoader.java:425) 
        at sun.misc.Launcher$AppClassLoader.loadClass(Launcher.java:308) 
        at java.lang.ClassLoader.loadClass(ClassLoader.java:358) 
        ... 8 more 
Java Result: 1 

代码如下：

import weka.core.Instances; 
import weka.clusterers.DensityBasedClusterer; 
import weka.clusterers.ClusterEvaluation; 
import java.io.File; 
import weka.clusterers.SimpleKMeans; 
import weka.core.converters.CSVLoader; 

/** 
 * An example class that shows the use of Weka clusterers from Java. 
 * 
 * @author FracPete 
 */ 
public class ClusteringDemo  

    /** 
     * Run clusterers 
     * 
     * @param filename the name of the ARFF file to run on 
     */ 
    public ClusteringDemo(String filename) throws Exception  
        ClusterEvaluation eval; 
        Instances data; 
        String[] options; 
        DensityBasedClusterer cl; 

        String Origem = filename; 

   // data = new Instances(new BufferedReader(new FileReader(filename))); 
        // load CSV 
        CSVLoader loader = new CSVLoader(); 
        loader.setSource(new File(Origem)); 
        data = loader.getDataSet(); 

        SimpleKMeans kmeans = new SimpleKMeans(); 

        kmeans.setSeed(10); 

// This is the important parameter to set 
        kmeans.setPreserveInstancesOrder(true); 
        kmeans.setNumClusters(5); 
        kmeans.buildClusterer(data); 

// This array returns the cluster number (starting with 0) for each instance 
// The array has as many elements as the number of instances 
        int[] assignments = kmeans.getAssignments(); 

        int i = 0; 
        for (int clusterNum : assignments)  
            System.out.printf("Instance %d -> Cluster %d", i, clusterNum); 
            i++; 
         
     

    /** 
     * usage: ClusteringDemo arff-file 
     */ 
    public static void main(String[] args) throws Exception  

        /*if (args.length != 1)  
         System.out.println("usage: " + ClusteringDemo.class.getName() + " <arff-file>"); 
         System.exit(1); 
         */ 
        new ClusteringDemo("Teste/Query1.csv"); 
     
 

我包含了二进制文件：weka-dev-3.7.10 我错过了什么重要的东西吗？

亲切的问候

【问题讨论】：

这里的代码“weka-3-6-10”或“weka-3-7-10”没有问题。你试过“weka-3-6-10”（最新的stable版本）吗？另外，你的主目录中有一些奇怪的 Weka .props 文件吗？

嗨。谢谢你的答复。我没有尝试 weka-3-6-10 但我尝试了很多其他示例，它们也以相同的方法或等效方法引发异常。我的目录中没有任何其他文件。我可以试试 Weka-3-6-10 吗？

这只是一个猜测（如果出现问题，尝试声明为“稳定”的最后一个版本几乎不会出错，但在这里可能没有什么不同）。令人惊讶的是，关于“penthato 包管理器”等的网络搜索结果很少。当然，您可以尝试将 JAR 从 mvnrepository.com/artifact/org.pentaho.pentaho-commons/… 添加到类路径，但只要不清楚这有什么好处（以及是什么导致错误）这仍然只是猜测。也许其他人知道“THE”的答案......

【参考方案1】：

我终于设法回答了这个问题。事实证明，从版本 3.7.2 开始，weka 核心更加紧凑，这意味着我需要的一些包不在 weka-dev 中。 解决方案很简单：将 weka.jar 而不是 weka-dev 包添加到类路径。或者也可以安装缺少的包http://weka.wikispaces.com/How+do+I+use+the+package+manager%3F

最好的问候