scipy 稀疏 A[:,0] = ndarray ValueError
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【中文标题】scipy 稀疏 A[:,0] = ndarray ValueError【英文标题】:scipy sparse A[:,0] = ndarray ValueError 【发布时间】:2020-12-30 01:07:53 【问题描述】:设置 scipy 稀疏数组的第一行 A[0,:] = np.ones()
工作正常,
但是尝试使用A[:,0] = np.ones()
设置第一列会引发ValueError。
这是 scipy 1.5.2 中的错误,还是我没有找到描述这个的文档?
回答 9 月 13 日:这是一个已知的错误区域,请参阅 issues/10695
和最新的scipy/sparse/_index.py。
但是我没有用这个测试A[:,0]
。
""" scipy sparse A[:,0] = ndarray ValueError """
# sparse A[0,:] = ndarray works, sparse A[:,0] = ndarray raises ValueError
# https://***.com/search?q=[scipy] [sparse-matrix] ValueError > 100
import numpy as np
from scipy import sparse
# import warnings
# warnings.simplefilter( "ignore", sparse.SparseEfficiencyWarning )
def versionstr():
import numpy, scipy, sys
return "versions: numpy %s scipy %s python %s " % (
numpy.__version__, scipy.__version__ , sys.version.split()[0] )
print( versionstr() ) # 11 Sep 2020: numpy 1.19.2 scipy 1.5.2 python 3.7.6
#...........................................................................
n = 3
ones = np.ones( n )
for A in [
np.eye(n),
sparse.eye( n ).tolil(),
sparse.eye( n ).tocsr(),
sparse.eye( n ).tocsr(),
]:
print( "\n-- A:", type(A).__name__, A.shape )
print( "A[0,:] = ones" )
A[0,:] = ones
print( "A: \n", getattr( A, "A", A )) # dense
# first column = ones --
if sparse.issparse( A ):
A[:,0] = ones.reshape( n, 1 ) # ok
A[:,0] = np.matrix( ones ).T # ok
A[range(n),0] = ones # ok
try:
print( "A[:,0] = ones" )
A[:,0] = ones # A dense ok, A sparse ValueError
except ValueError as msg:
print( "ValueError:", msg )
# ValueError: cannot reshape array of size 9 into shape (3,1)
【问题讨论】:
【参考方案1】:我可能会称这是一个错误,是的 - 这不是我所期望的行为。在引擎盖下,它看起来像是由np.broadcast_arrays()
驱动的,当填充数组密集时调用它。此函数将 1d 数组视为 2d (1, N) 数组。根据 numpy 切片的行为,如果大小正确,我会期望在不广播的情况下使用一维数组。
列切片:
>>> np.broadcast_arrays(np.ones((3,1)), A[:,0].A)
[array([[1.],
[1.],
[1.]]), array([[1.],
[0.],
[0.]])]
>>> np.broadcast_arrays(np.ones((3,)), A[:,0].A)
[array([[1., 1., 1.],
[1., 1., 1.],
[1., 1., 1.]]), array([[1., 1., 1.],
[0., 0., 0.],
[0., 0., 0.]])]
>>> np.broadcast_arrays(np.ones((1, 3)), A[:,0].A)
[array([[1., 1., 1.],
[1., 1., 1.],
[1., 1., 1.]]), array([[1., 1., 1.],
[0., 0., 0.],
[0., 0., 0.]])]
行切片:
>>> np.broadcast_arrays(np.ones((3, )), A[0, :].A)
[array([[1., 1., 1.]]), array([[1., 0., 0.]])]
>>> np.broadcast_arrays(np.ones((3, 1)), A[0, :].A)
[array([[1., 1., 1.],
[1., 1., 1.],
[1., 1., 1.]]), array([[1., 0., 0.],
[1., 0., 0.],
[1., 0., 0.]])]
>>> np.broadcast_arrays(np.ones((1, 3)), A[0, :].A)
[array([[1., 1., 1.]]), array([[1., 0., 0.]])]
【讨论】:
以上是关于scipy 稀疏 A[:,0] = ndarray ValueError的主要内容,如果未能解决你的问题,请参考以下文章