具有 Statsmodel ValueError 的多重 OLS 回归:零大小数组到没有标识的归约操作最大值
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【中文标题】具有 Statsmodel ValueError 的多重 OLS 回归:零大小数组到没有标识的归约操作最大值【英文标题】:Multiple OLS Regression with Statsmodel ValueError: zero-size array to reduction operation maximum which has no identity 【发布时间】:2018-01-14 16:37:35 【问题描述】:我在对包含大约 7500 个数据点的数据集执行多重回归时遇到问题,其中某些列和行中存在缺失数据 (NaN)。每行至少有一个 NaN 值。有些行只包含 NaN 值。
我正在使用 OLS Statsmodel 进行回归分析。我试图不使用 Scikit Learn 来执行 OLS 回归,因为(我可能对此错了,但是)我必须在我的数据集中估算缺失的数据,这会在一定程度上扭曲数据集。
我的数据集如下所示: KPI
这就是我所做的(目标变量是 KP6,预测变量是剩余变量):
est2 = ols(formula = KPI.KPI6.name + ' ~ ' + ' + '.join(KPI.drop('KPI6', axis = 1).columns.tolist()), data = KPI).fit()
它返回一个 ValueError: zero-size array to reduction operation maximum which has no identity.
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ValueError Traceback (most recent call last)
<ipython-input-207-b24ba316a452> in <module>()
3 #test = KPI.dropna(how='all')
4 #test = KPI.fillna(0)
----> 5 est2 = ols(formula = KPI.KPI6.name + ' ~ ' + ' + '.join(KPI.drop('KPI6', axis = 1).columns.tolist()), data = KPI).fit()
6 print(est2.summary())
/Users/anhtran/anaconda/lib/python3.6/site-packages/statsmodels/base/model.py in from_formula(cls, formula, data, subset, drop_cols, *args, **kwargs)
172 'formula': formula, # attach formula for unpckling
173 'design_info': design_info)
--> 174 mod = cls(endog, exog, *args, **kwargs)
175 mod.formula = formula
176
/Users/anhtran/anaconda/lib/python3.6/site-packages/statsmodels/regression/linear_model.py in __init__(self, endog, exog, missing, hasconst, **kwargs)
629 **kwargs):
630 super(OLS, self).__init__(endog, exog, missing=missing,
--> 631 hasconst=hasconst, **kwargs)
632 if "weights" in self._init_keys:
633 self._init_keys.remove("weights")
/Users/anhtran/anaconda/lib/python3.6/site-packages/statsmodels/regression/linear_model.py in __init__(self, endog, exog, weights, missing, hasconst, **kwargs)
524 weights = weights.squeeze()
525 super(WLS, self).__init__(endog, exog, missing=missing,
--> 526 weights=weights, hasconst=hasconst, **kwargs)
527 nobs = self.exog.shape[0]
528 weights = self.weights
/Users/anhtran/anaconda/lib/python3.6/site-packages/statsmodels/regression/linear_model.py in __init__(self, endog, exog, **kwargs)
93 """
94 def __init__(self, endog, exog, **kwargs):
---> 95 super(RegressionModel, self).__init__(endog, exog, **kwargs)
96 self._data_attr.extend(['pinv_wexog', 'wendog', 'wexog', 'weights'])
97
/Users/anhtran/anaconda/lib/python3.6/site-packages/statsmodels/base/model.py in __init__(self, endog, exog, **kwargs)
210
211 def __init__(self, endog, exog=None, **kwargs):
--> 212 super(LikelihoodModel, self).__init__(endog, exog, **kwargs)
213 self.initialize()
214
/Users/anhtran/anaconda/lib/python3.6/site-packages/statsmodels/base/model.py in __init__(self, endog, exog, **kwargs)
61 hasconst = kwargs.pop('hasconst', None)
62 self.data = self._handle_data(endog, exog, missing, hasconst,
---> 63 **kwargs)
64 self.k_constant = self.data.k_constant
65 self.exog = self.data.exog
/Users/anhtran/anaconda/lib/python3.6/site-packages/statsmodels/base/model.py in _handle_data(self, endog, exog, missing, hasconst, **kwargs)
86
87 def _handle_data(self, endog, exog, missing, hasconst, **kwargs):
---> 88 data = handle_data(endog, exog, missing, hasconst, **kwargs)
89 # kwargs arrays could have changed, easier to just attach here
90 for key in kwargs:
/Users/anhtran/anaconda/lib/python3.6/site-packages/statsmodels/base/data.py in handle_data(endog, exog, missing, hasconst, **kwargs)
628 klass = handle_data_class_factory(endog, exog)
629 return klass(endog, exog=exog, missing=missing, hasconst=hasconst,
--> 630 **kwargs)
/Users/anhtran/anaconda/lib/python3.6/site-packages/statsmodels/base/data.py in __init__(self, endog, exog, missing, hasconst, **kwargs)
77
78 # this has side-effects, attaches k_constant and const_idx
---> 79 self._handle_constant(hasconst)
80 self._check_integrity()
81 self._cache = resettable_cache()
/Users/anhtran/anaconda/lib/python3.6/site-packages/statsmodels/base/data.py in _handle_constant(self, hasconst)
129 # detect where the constant is
130 check_implicit = False
--> 131 const_idx = np.where(self.exog.ptp(axis=0) == 0)[0].squeeze()
132 self.k_constant = const_idx.size
133
ValueError: zero-size array to reduction operation maximum which has no identity
我怀疑错误是由于目标变量(即 KPI6)包含一些 NaN,所以我尝试像这样删除所有 KPI6 = NaN 的行,但问题仍然存在:
KPI.dropna(subset = ['KPI6'])
我也尝试删除所有仅包含 NaN 值的行,但问题仍然存在:
KPI.dropna(how = 'all')
我结合了上述两个步骤,但问题仍然存在。消除此错误的唯一方法是用某些东西(例如 0、平均值、中位数等)实际估算缺失的数据。但是,我希望尽可能避免这种方法,因为我想对原始数据进行 OLS 回归。
当我尝试仅选择几个变量作为预测变量时,OLS 回归也有效,但这又不是我的目标。我想将除 KPI6 之外的所有其他变量作为预测变量。
有什么解决办法吗?一个星期以来,我真的很紧张。任何帮助表示赞赏。我不是专业的 Python 编码员,所以如果您能以通俗的方式解决问题(并提出解决方案),我将不胜感激。
非常感谢。
【问题讨论】:
【参考方案1】:使用公式时的默认缺失处理是删除任何包含至少一个 nan 的行。如果每一行都包含一个 nan,那么就没有观察值了。我认为这就是回溯ValueError: zero-size array
结束的意思。
如果您总体上有足够的数据,那么您可以尝试使用 MICE 进行估算和估算,这将迭代地估算每个变量的缺失值。
【讨论】:
谢谢,现在我终于明白这有什么问题了。我会试试你的建议。以上是关于具有 Statsmodel ValueError 的多重 OLS 回归:零大小数组到没有标识的归约操作最大值的主要内容,如果未能解决你的问题,请参考以下文章
如何使用for循环或条件在pandas数据框的子集中创建多个回归模型(statsmodel)?
Statsmodel 拦截与 Seaborn lmplot 拦截不同