pandas DataFrame 多列的并排箱线图
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【中文标题】pandas DataFrame 多列的并排箱线图【英文标题】:Side-by-side boxplot of multiple columns of a pandas DataFrame 【发布时间】:2017-08-03 07:28:49 【问题描述】:一年的样本数据:
import pandas as pd
import numpy.random as rnd
import seaborn as sns
n = 365
df = pd.DataFrame(data = "A":rnd.randn(n), "B":rnd.randn(n)+1,
index=pd.date_range(start="2017-01-01", periods=n, freq="D"))
我想将这些数据并排按月分组(即每月两个框,一个用于A
,一个用于B
)。
对于单个列 sns.boxplot(df.index.month, df["A"])
工作正常。但是,sns.boxplot(df.index.month, df[["A", "B"]])
会引发错误 (ValueError: cannot copy sequence with size 2 to array axis with dimension 365
)。通过索引 (pd.melt(df, id_vars=df.index, value_vars=["A", "B"], var_name="column")
) 融合数据以使用 seaborn 的 hue
属性作为解决方法也不起作用 (TypeError: unhashable type: 'DatetimeIndex'
)。
(如果使用普通 matplotlib 更容易,解决方案不一定需要使用 seaborn。)
编辑
我找到了一种解决方法,基本上可以产生我想要的东西。但是,一旦 DataFrame 包含的变量多于我想要绘制的变量,使用起来就会有些尴尬。所以如果有更优雅/直接的方法,请分享!
df_stacked = df.stack().reset_index()
df_stacked.columns = ["date", "vars", "vals"]
df_stacked.index = df_stacked["date"]
sns.boxplot(x=df_stacked.index.month, y="vals", hue="vars", data=df_stacked)
产生:
【问题讨论】:
您能详细说明一下“但是,一旦 DataFrame 包含的变量比我想要绘制的多,使用起来就会有些尴尬?” 【参考方案1】:这是一个使用 pandas 融化和 seaborn 的解决方案:
import pandas as pd
import numpy.random as rnd
import seaborn as sns
n = 365
df = pd.DataFrame(data = "A": rnd.randn(n),
"B": rnd.randn(n)+1,
"C": rnd.randn(n) + 10, # will not be plotted
,
index=pd.date_range(start="2017-01-01", periods=n, freq="D"))
df['month'] = df.index.month
df_plot = df.melt(id_vars='month', value_vars=["A", "B"])
sns.boxplot(x='month', y='value', hue='variable', data=df_plot)
【讨论】:
【参考方案2】:month_dfs = []
for group in df.groupby(df.index.month):
month_dfs.append(group[1])
plt.figure(figsize=(30,5))
for i,month_df in enumerate(month_dfs):
axi = plt.subplot(1, len(month_dfs), i + 1)
month_df.plot(kind='box', subplots=False, ax = axi)
plt.title(i+1)
plt.ylim([-4, 4])
plt.show()
会给this
不完全是您要查找的内容,但如果您添加更多变量,则可以保持可读的 DataFrame。
您还可以使用
轻松删除轴if i > 0:
y_axis = axi.axes.get_yaxis()
y_axis.set_visible(False)
在plt.show()
之前的循环中
【讨论】:
【参考方案3】:使用Altair 非常简单:
alt.Chart(
df.reset_index().melt(id_vars = ["index"], value_vars=["A", "B"]).assign(month = lambda x: x["index"].dt.month)
).mark_boxplot(
extent='min-max'
).encode(
alt.X('variable:N', title=''),
alt.Y('value:Q'),
column='month:N',
color='variable:N'
)
上面的代码融化了 DataFrame 并添加了一个 month
列。然后 Altair 为每个按月细分的变量创建箱线图作为绘图列。
【讨论】:
【参考方案4】:我不完全理解您的问题,但您可以使用matplotlib
看看这种方法。虽然不是最好的解决方案。
1) 通过month
s 将df
分成12 个DataFrame,全部堆叠在一个列表中
DFList = []
for group in df_3.groupby(df_3.index.month):
DFList.append(group[1])
2) 在循环中一个接一个地绘制它们:
for _ in range(12):
DFList[_].plot(kind='box', subplots=True, layout=(2,2), sharex=True, sharey=True, figsize=(7,7))
plt.show()
3) 这是前三行的快照:
您可能还想查看
matplotlib
的add_subplot
method
【讨论】:
感谢您的回答。抱歉,如果我的主要帖子不清楚。如果你能帮助我改进它,我会很高兴。我将在一分钟内编辑我在原始帖子中找到的解决方法/解决方案,以帮助澄清我的意思。以上是关于pandas DataFrame 多列的并排箱线图的主要内容,如果未能解决你的问题,请参考以下文章
同一图上 Pandas 数据框多列的箱线图(seaborn)