pandas read_csv,最后一列包含逗号
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【中文标题】pandas read_csv,最后一列包含逗号【英文标题】:pandas read_csv with final column containing commas 【发布时间】:2014-07-28 06:52:03 【问题描述】:所以我有一个 csv 数据集,根据我的书,我正在尝试让 pandas
包正确加载它。标题由 5 个列名组成,但最后一列由 JSON 对象组成,其中包含未转义的逗号。例如
A,B,C,D,E
1,2,3,4,K1:V1,K2:V2
我正在使用简单的training = pd.read_csv('data/training.dat')
加载我的数据
但是,pandas 显然将额外的逗号误解为新的未标记列,我收到如下错误:
CParserError: Error tokenizing data. C error: Expected 75 fields in line 3, saw 84
我正在尝试浏览文档,但显然失败了,有人知道如何正确配置 pd.read_csv
命令以正确解析它吗?
我想另一种方法是我可以编写一个脚本,使用它们的键的联合作为列来扁平化 JSON 对象。
【问题讨论】:
【参考方案1】:如果您可以将 替换为
"
,将 替换为
"
,则可以通过以下方式正确读取:pd.read_csv('data/training.dat',quotechar='"',skipinitialspace=True)
编辑:
或者选择基于正则表达式的解决方案:
In [205]:
print pd.read_csv('a.data',sep=",(?![^]*\)", header=None)
0 1 2 3 4
0 A B C D E
1 1 2 3 4 K1:V1,K2:V2
[2 rows x 5 columns]
【讨论】:
我真的很喜欢基于正则表达式的解决方案。我没有意识到 sep 可以解析正则表达式。【参考方案2】:我认为这取决于您尝试使用 JSON 做什么。如果您只想忽略它,可能最简单的方法是将评论字符设置为(对于这个和下一个,我假设您的其他列中没有任何大括号。)
pd.read_csv(
'woo.csv',
comment=''
)
可以使用带有read_csv
的自定义分隔符从 JSON 中提取元素,尽管我完全不相信这是一种明智的方法。如果它是一个捕获组(它在内部使用re.split
),Pandas 会将分隔符转换为一列,因此我可以获得包含 JSON 的列。不幸的是,我也因此得到了很多空列;因此dropna
。
我通过loads
和dumps
发送了JSON,但显然你想做一些更明智的事情。 :)
json_bit = lambda x: json.dumps(json.loads(x))
pd.read_csv(
'woo.csv',
sep=r'(\.*\)$|,',
converters='None.3': json_bit
).dropna(axis=1)
CSV 示例
A,B,C,D,E
1,2,3,4,"K1":"V1","K2":"V2"
3,2,3,4,"K1": "V1", "k£": "k3": "v3", "K2":"V2"
【讨论】:
【参考方案3】:无需预处理csv文件,使用引擎类型python即可:
dataset = pd.read_csv('sample.csv', sep=',', engine='python')
【讨论】:
这似乎不能解决问题。我看不出指定引擎类型如何使列条目被解释为dict
。以上是关于pandas read_csv,最后一列包含逗号的主要内容,如果未能解决你的问题,请参考以下文章
numpy genfromtxt/pandas read_csv;忽略引号内的逗号
pandas使用read_csv函数读取文件最后N行数据并保留表头pandas使用read_csv函数读取网络url链接数据