Scipy hstack 导致“TypeError:类型不支持转换:(dtype('float64'),dtype('O'))”

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【中文标题】Scipy hstack 导致“TypeError:类型不支持转换:(dtype(\'float64\'),dtype(\'O\'))”【英文标题】:Scipy hstack results in "TypeError: no supported conversion for types: (dtype('float64'), dtype('O'))"Scipy hstack 导致“TypeError:类型不支持转换:(dtype('float64'),dtype('O'))” 【发布时间】:2014-04-11 23:12:22 【问题描述】:

我正在尝试运行 hstack 以将一列整数值加入到由 TF-IDF 创建的列列表中(这样我最终可以在分类器中使用所有这些列/功能)。

我正在使用 pandas 阅读该列,检查任何 NA 值并将它们转换为数据框中的最大值,如下所示:

  OtherColumn = p.read_csv('file.csv', delimiter=";", na_values=['?'])[["OtherColumn"]]
  OtherColumn = OtherColumn.fillna(OtherColumn.max())
  OtherColumn = OtherColumn.convert_objects(convert_numeric=True)

然后我阅读了我的文本列并运行 TF-IDF 来创建大量功能:

  X = list(np.array(p.read_csv('file.csv', delimiter=";"))[:,2])

  tfv = TfidfVectorizer(min_df=3,  max_features=None, strip_accents='unicode',  
        analyzer='word',token_pattern=r'\w1,',ngram_range=(1, 2), use_idf=1,smooth_idf=1,sublinear_tf=1)
  tfv.fit(X)

最后,我想将它们全部连接在一起,这就是我们发生错误并且程序无法运行的地方,而且我不确定我是否在这里正确使用了 StandardScaler:

  X =  sp.sparse.hstack((X, OtherColumn.values)) #error here
  sc = preprocessing.StandardScaler().fit(X)
  X = sc.transform(X)
  X_test = sc.transform(X_test)

完整的错误信息:

---------------------------------------------------------------------------
TypeError                                 Traceback (most recent call last)
<ipython-input-13-79d1e70bc1bc> in <module>()
---> 47 X =  sp.sparse.hstack((X, OtherColumn.values))
     48 sc = preprocessing.StandardScaler().fit(X)
     49 X = sc.transform(X)

C:\Users\Simon\Anaconda\lib\site-packages\scipy\sparse\construct.pyc in hstack(blocks, format, dtype)
    421 
    422     """
--> 423     return bmat([blocks], format=format, dtype=dtype)
    424 
    425 

C:\Users\Simon\Anaconda\lib\site-packages\scipy\sparse\construct.pyc in bmat(blocks, format, dtype)
    537     nnz = sum([A.nnz for A in blocks[block_mask]])
    538     if dtype is None:
--> 539         dtype = upcast(*tuple([A.dtype for A in blocks[block_mask]]))
    540 
    541     row_offsets = np.concatenate(([0], np.cumsum(brow_lengths)))

C:\Users\Simon\Anaconda\lib\site-packages\scipy\sparse\sputils.pyc in upcast(*args)
     58             return t
     59 
---> 60     raise TypeError('no supported conversion for types: %r' % (args,))
     61 
     62 

TypeError: no supported conversion for types: (dtype('float64'), dtype('O'))

【问题讨论】:

【参考方案1】:

正如Numpy hstack - "ValueError: all the input arrays must have same number of dimensions" - but they do 中所讨论的,您需要将输入显式转换为sparse.hstacksparse 代码不如核心 numpy 代码那么健壮。

如果X 是带有dtype=float 的稀疏数组,而A 是带有dtype=object 的稠密数组,则可以有多个选项。

sparse.hstack(X, A) # error
sparse.hstack(X.astype(object), A) # cast X to object; return object
sparse.hstack(X, A.astype(float)) # cast A to float; return float
hstack(X.A, A) # make X dense, result will be type object

如果A 包含一些NaNA.astype(float) 将起作用。有关 NaN,请参阅 http://pandas.pydata.org/pandas-docs/stable/gotchas.html。如果A 是由于其他原因(例如不完整的列表)而成为对象,那么我们将不得不重新审视这个问题。

另一种可能是使用 Pandas 的concat。 http://pandas.pydata.org/pandas-docs/stable/merging.html。我认为 Pandas 比 sparse 编码员更关注这些问题。

【讨论】:

以上是关于Scipy hstack 导致“TypeError:类型不支持转换:(dtype('float64'),dtype('O'))”的主要内容,如果未能解决你的问题,请参考以下文章

TypeError:无法将 <class 'scipy.sparse.csr.csr_matrix'> 类型的对象转换为张量

如何通过索引将 scipy.sparse 矩阵分配给 NumPy 数组?

Numpy中的数组拼接、合并操作(concatenate, append, stack, hstack, vstack, r_, c_等)

TypeError:只有一个元素的整数数组可以转换为索引 3

SwiftUI:VStack 中 ForEach 中的 HStack 使多行文本重叠

为啥使用 scipy 保存 mat 文件会导致文件大小比使用 Matlab 大?