最小汉明距离

Posted 2023-02-16

【中文标题】最小汉明距离

【英文标题】：Minimum Hamming distance

【发布时间】：2017-03-04 19:10:47

【问题描述】：

我几天前开始学习 Python 3，所以如果我的代码很糟糕，我很抱歉。

我编写了一个脚本来查找列表中字符串的最小Hamming distance。现在我将使用的字符串是相同长度的二进制字，所以我的第一个问题是在 Python 中有一个按位的解决方案吗？

其次，我的代码是否正确，如果正确，提高效率的最佳方法是什么？我的搜索没有返回 Python 3 的答案，这就是我在这里问的原因。

def min_ham_dist(a):
    min_dist = len(a[0]) # Defaults minimum distance to maximum length of string.
    for i in range(len(a)):
        for j in range(i+1, len(a)): # Compares all words after ith word.
            dist = 0
            for k in range(len(a[i])): 
                if a[i][k] != a[j][k]:
                    dist += 1            
            if dist < min_dist:
                min_dist = dist
    return min_dist

非常感谢

【问题讨论】：

整数可以有任意长度吗？或者它们有最大长度吗？

在这种情况下，它们是固定的。我写这篇文章是为了解决一个包含 16 个长度为 12 的二进制字的列表的相当简单的问题。它应该通过视觉解决，但我觉得最好使用脚本来减少人为错误。不过，很高兴看到适用于任意长度的脚本。

该***页面上有一个简洁明了的 Python 3 示例；) 它基本上显示了完成这项工作所需的条件：如果两个输入字符串的长度相同，请使用 zip() 压缩它们，然后比较 zip 中的每一对，计算有多少不相等。

就在我的鼻子前面！我只是链接了***页面以供参考，并没有考虑自己阅读。谢谢你，达特茅斯。

【参考方案1】：

您也可以为此使用 scipy (pdist)，但您必须将输入更改为二维数组。它以分数形式返回汉明距离。为此，您需要带数字的字符串（二进制字符串可以）：

from scipy.spatial.distance import pdist

def min_ham_dist(a):
    return min(pdist([list(i) for i in a], 'hamming'))*len(a[0])