与 Rcpp 等效的 lineprof

Posted 2023-03-06

【中文标题】与 Rcpp 等效的 lineprof

【英文标题】：lineprof equivalent for Rcpp

【发布时间】：2015-05-11 16:23:29

【问题描述】：

R 中的lineprof 包对于分析函数的哪些部分占用时间和分配/释放内存非常有用。

Rcpp 是否有 lineprof() 等效项？

我目前使用std::chrono::steady_clock 等从Rcpp 函数中获取块计时。备择方案？ Rstudio IDE 是否在这里提供了一些帮助？

【参考方案1】：

补充@Dirk 的回答...

如果您在 OS X 上工作，Time Profiler Instrument（Apple 的 Instruments 检测工具集的一部分）是一个优秀采样分析器。

只是为了修正想法：

采样分析器可让您回答以下问题：我的程序在哪些代码路径上花费的时间最多？

（完整）缓存分析器可让您回答问题，哪些是我的程序中最常执行的代码路径？

这些是不同的问题 - 您最热门的代码路径可能已经优化到足够的程度，即使在该路径中执行的指令总数非常多，执行它们所需的时间也可能相对较低。

如果您想使用工具来分析 R 包中使用的 C++ 代码/例程，最简单的方法是：

创建一个目标，指向您的 R 可执行文件，并使用适当的命令行参数来运行您希望分析的任何函数：

设置命令行参数以运行将执行 C++ 例程的代码 - 例如，此代码运行 Rcpp:::test()，以检测所有 Rcpp 测试代码：

点击红色的大录制按钮，然后开始！

我会将了解仪器 + 时序分析器的其余说明留给您的 google-fu + 文档，但是（如果您使用的是 OS X）您应该了解此工具。

【讨论】：

我确实需要摆脱这个谢谢！如果您有机会提供一个完整的示例，并将其提交给Rcpp Gallery，那将是非常棒的！

【参考方案2】：

查看任何关于高性能计算的体面介绍，例如来自my talks page （旧）演示文稿的一些幻灯片，其中包括 KCa​​cheGrind（Valgrind 的 KDE 前端的一部分）和 Google Perftools 的工作示例。

在更抽象的意义上，您需要接受 C++ != R 的事实，并且并非所有工具都有相同的对应物。特别是Rprof，几个用于分析的 CRAN 包构建在其之上的 R 分析器是基于 R 被解释的事实。 C++ 不是，所以情况会有所不同。但是编译的分析与编译和调试一样古老，因此您会发现许多教程。

【讨论】：

我知道 KCacheGrind 但工作示例听起来很棒 +1。根据上面的评论，如果您有机会重构一个示例，将其提交到 Rcpp 库，那将是非常棒的！但我会读到你指给我的地方！