加载 nii.zip（压缩）3d 分割文件

Posted 2023-03-06

【中文标题】加载 nii.zip（压缩）3d 分割文件

【英文标题】：Loading nii.zip (compressed) 3d segmentation files

【发布时间】：2019-08-27 13:55:31

【问题描述】：

我知道 SimpleITK 可以读取 Nifty (.nii) 格式的 3d 图像，并且它支持 nii.gz 压缩版本。但是，我无法加载 nii.zip 文件。如果我尝试直接解压缩/提取这些文件，这些文件会引发错误，而且 SimpleITK 也不会将它们识别为可读格式之一。

可供参考的数据集位于：https://academictorrents.com/details/27772adef6f563a1ecc0ae19a528b956e6c803ce

【参考方案1】：

前段时间我下载了相同的数据集，我没有彻底试验过，但这是我的经验：

我能够成功解压 nii.zip 文件

我使用的是 Linux Ubuntu 18.04，并从 GUI 预安装了解压缩实用程序 您遇到的问题可能是由于使用了不同的存档管理器，或者数据集在下载过程中已损坏 解决方案 - 尝试不同的存档管理器并再次下载数据集

我正在使用 Aliza 来查看解压缩的扫描文件

根据我快速检查医学图像格式的经验，Aliza viewer 是最好的程序，可以导出为不同的格式

读取压缩文件的解决方案

如果您使用 SimpleITK 或（我在 python 中最喜欢的）Nibabel 并想直接读取压缩文件，您可以参考这些答案如何解决读取压缩档案中的文件的问题 - Stack overflow question 1 和Stack overflow question 2