在 gtable 对象中设置宽度折叠图;这曾经有效,但现在不再有效。
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【中文标题】在 gtable 对象中设置宽度折叠图;这曾经有效,但现在不再有效。【英文标题】:Setting width in gtable object collapses plot; this used to work but it doesn't anymore. 【发布时间】:2016-06-19 17:39:35 【问题描述】:以下代码曾经可以工作,但现在不行了。有人知道发生了什么吗?一定是底层 gtable 代码发生了一些变化。
require(cowplot) # for plot_grid()
require(grid) # for unit_max()
# make two plots
plot.iris <- ggplot(iris, aes(Sepal.Length, Sepal.Width)) +
geom_point() + facet_grid(. ~ Species) + stat_smooth(method = "lm") +
background_grid(major = 'y', minor = "none") +
panel_border()
plot.mpg <- ggplot(mpg, aes(x = cty, y = hwy, colour = factor(cyl))) +
geom_point(size=2.5)
g.iris <- ggplotGrob(plot.iris) # convert to gtable
g.mpg <- ggplotGrob(plot.mpg) # convert to gtable
iris.widths <- g.iris$widths[1:3] # extract the first three widths,
# corresponding to left margin, y lab, and y axis
mpg.widths <- g.mpg$widths[1:3] # same for mpg plot
max.widths <- unit.pmax(iris.widths, mpg.widths) # calculate maximum widths
g.iris$widths[1:3] <- max.widths # assign max. widths to iris gtable
g.mpg$widths[1:3] <- max.widths # assign max widths to mpg gtable
plot_grid(g.iris, g.mpg, labels = "AUTO", ncol = 1)
结果图如下:
它应该是这样的(y 轴线完全垂直对齐):
错误似乎发生在这一行:
g.iris$widths[1:3] <- max.widths
任何见解将不胜感激。
请注意,类似的解决方案已经使用了很长时间,请参见例如here. 而cowplot 中的plot_grid()
函数也使用这样的代码来对齐绘图,它仍然有效。所以这让我完全迷惑了。
【问题讨论】:
【参考方案1】:编辑
对于grid
3.3.0 版,这不再是问题。即下面包含grid:::unit.list()
的代码行可以删除。
问题在于单位的设置方式。看g.iris$widths
。您会注意到数字在那里,但单位已被删除。请参阅此question and answer 和this one。将图转成gtables后,需要:g.iris$widths = grid:::unit.list(g.iris$widths)
require(grid) # for unit_max()
require(cowplot)
# make two plots
plot.iris <- ggplot(iris, aes(Sepal.Length, Sepal.Width)) +
geom_point() + facet_grid(. ~ Species) + stat_smooth(method = "lm") +
background_grid(major = 'y', minor = "none") +
panel_border()
plot.mpg <- ggplot(mpg, aes(x = cty, y = hwy, colour = factor(cyl))) +
geom_point(size=2.5)
g.iris <- ggplotGrob(plot.iris) # convert to gtable
g.mpg <- ggplotGrob(plot.mpg) # convert to gtable
g.iris$widths = grid:::unit.list(g.iris$widths)
g.mpg$widths = grid:::unit.list(g.mpg$widths)
iris.widths <- g.iris$widths[1:3] # extract the first three widths,
# corresponding to left margin, y lab, and y axis
mpg.widths <- g.mpg$widths[1:3] # same for mpg plot
max.widths <- unit.pmax(iris.widths, mpg.widths) # calculate maximum widths
g.iris$widths[1:3] <- max.widths # assign max. widths to iris gtable
g.mpg$widths[1:3] <- max.widths # assign max widths to mpg gtable
plot_grid(g.iris, g.mpg, labels = "AUTO", ncol = 1)
【讨论】:
确实,grid:::unit.list()
已经需要一段时间了;我忘记了我何时开始注意到 ggplot2 的损坏。这种未导出的网格函数几乎已成为进行这种绘图对齐的要求,这在包中可能会出现问题。
非常感谢!轴线问题是最新的 ggplot2 版本 2.1.0 中的一个错误。它已经在 github 中修复,提交给 CRAN 待定。
我删除了对轴线的引用。
要明确:轴线错误在ggplot2 2.1.0中。我已经修复了 cowplot 以解决该错误并将其提交给 CRAN。
@baptiste 使用最新的 R 开发版本,这个例子现在应该可以在没有 grid:::unit.list()
的情况下工作:stat.ethz.ch/pipermail/r-devel/2016-March/072434.html以上是关于在 gtable 对象中设置宽度折叠图;这曾经有效,但现在不再有效。的主要内容,如果未能解决你的问题,请参考以下文章