如何删除R中图形中的顶点？

Posted 2023-02-24

【中文标题】如何删除R中图形中的顶点？

【英文标题】：How to delete vertices in graph in R?

【发布时间】：2013-02-27 08:53:37

【问题描述】：

我正在尝试使用delete.vertices(graph ,vertex id) 删除图中的顶点，但我看到此错误：”Cannot create iterator, Invalid vertex id, Invalid vertex id”

这是我的代码：

graph<-read.graph(paste0("H:/graph.txt"),format="ncol",directed="TRUE")
delete.vertices(graph,c(717527,61373))

717527 和 61373 是我的顶点数。

这是图表：

我该怎么做？

【参考方案1】：

您收到错误是因为给定的顶点之一不在图形顶点列表中。一个建议是尝试使用igraph 函数，一旦你熟悉了它们，就将它应用到你的自定义图形中。这里有一个演示：

 library(igraph)
 g <- graph.ring(10)
 V(g)
Vertex sequence:
 [1]  1  2  3  4  5  6  7  8  9 10

现在我尝试删除一个现有的顶点：

delete.vertices(g, c(2,7,9) )
IGRAPH U--- 7 4 -- Ring graph
+ attr: name (g/c), mutual (g/x), circular (g/x)

对于不存在的，我得到你的错误：

delete.vertices(g, c(20))

Error in delete.vertices(g, c(20)) : 
  At iterators.c:759 : Cannot create iterator, invalid vertex id, Invalid vertex id

【参考方案2】：

你在使用 Igraph 吗？

read.graph 函数可能会将顶点 ID 作为字符串读取。在这种情况下，您可能需要：

delete.vertices(graph,c('717527','61373'))

相反。此外，delete.verticies 返回一个新的图形对象。如果您希望稍后显示更改，您需要确保将结果存储在图表中。

graph<-read.graph(paste0("H:/graph.txt"),format="ncol",directed="TRUE")
graph<-delete.vertices(graph,c('717527','61373'))