AUC 的网格搜索查找参数
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【中文标题】AUC 的网格搜索查找参数【英文标题】:Grid-Search finding Parameters for AUC 【发布时间】:2016-10-07 23:31:52 【问题描述】:我正在尝试为我的 SVM 找到参数,这给了我最好的 AUC。但我在 sklearn 中找不到 AUC 的任何评分函数。有人有想法吗?这是我的代码:
parameters = "C":[0.1, 1, 10, 100, 1000], "gamma":[0.1, 0.01, 0.001, 0.0001, 0.00001]
clf = SVC(kernel = "rbf")
clf = GridSearchCV(clf, parameters, scoring = ???)
svr.fit(features_train , labels_train)
print svr.best_params_
那我可以用来做什么???获得高 AUC 分数的最佳参数?
【问题讨论】:
【参考方案1】:我没有尝试过,但我相信你想使用sklearn.metrics.roc_auc_score
。
问题在于它不是模型记分器,因此您需要构建一个。 比如:
from sklearn.metrics import roc_auc_score
def score_auc(estimator, X, y):
y_score = estimator.predict_proba(X) # You could also use the binary predict, but probabilities should give you a more realistic score.
return roc_auc_score(y, y_score)
并将此函数用作 GridSearch 中的评分参数。
【讨论】:
谢谢,我喜欢你的想法,但如果我这样做:svr = GridSearchCV(svr, parameters, scoring = score_auc(svr, features_train, labels_train))
it 会导致:AttributeError:predict_proba 在probability=False 时不可用。如果我将其设置为 true,则会出现另一个错误。
只是做一个svr = GridSearchCV(svr, parameters, scoring=score_auc)
,你不应该调用这个函数,把它传递给搜索。如果predict_proba
给您带来问题,请使用常规predict
评分。
感觉这会将“score_auc”传递给训练数据——如果我们想在交叉验证数据上对其进行评分怎么办?
对于某些 SVM 模型,您需要在初始化它们时显式设置超参数“probability=True”,以获得概率预测。【参考方案2】:
你可以简单地使用:
clf = GridSearchCV(clf, parameters, scoring='roc_auc')
【讨论】:
所以如果我打印出 svr.best_score_ 它的 auc?因为我试图这样计算它:#ROC false_positive_rate, true_positive_rate, thresholds = roc_curve(labels_test, labels_predicted) roc_auc = auc(false_positive_rate, true_positive_rate) print roc_auc
但它显示我的 auc 低于最好的分数
最佳分数对应于训练过程中每个折叠的最佳平均值roc_auc
。人们会期望在测试集上看到较低的分数。【参考方案3】:
您可以自己制作任何得分手:
from sklearn.metrics import make_scorer
from sklearn.metrics import roc_curve, auc
# define scoring function
def custom_auc(ground_truth, predictions):
# I need only one column of predictions["0" and "1"]. You can get an error here
# while trying to return both columns at once
fpr, tpr, _ = roc_curve(ground_truth, predictions[:, 1], pos_label=1)
return auc(fpr, tpr)
# to be standart sklearn's scorer
my_auc = make_scorer(custom_auc, greater_is_better=True, needs_proba=True)
pipeline = Pipeline(
[("transformer", TruncatedSVD(n_components=70)),
("classifier", xgb.XGBClassifier(scale_pos_weight=1.0, learning_rate=0.1,
max_depth=5, n_estimators=50, min_child_weight=5))])
parameters_grid = 'transformer__n_components': [60, 40, 20]
grid_cv = GridSearchCV(pipeline, parameters_grid, scoring = my_auc, n_jobs=-1,
cv = StratifiedShuffleSplit(n_splits=5,test_size=0.3,random_state = 0))
grid_cv.fit(X, y)
欲了解更多信息,请在此处查看:sklearn make_scorer
【讨论】:
【参考方案4】:使用下面的代码,它将为您提供所有参数列表
import sklearn
sklearn.metrics.SCORERS.keys()
选择您要使用的适当参数
在您的情况下,下面的代码将起作用
clf = GridSearchCV(clf, parameters, scoring = 'roc_auc')
【讨论】:
以上是关于AUC 的网格搜索查找参数的主要内容,如果未能解决你的问题,请参考以下文章
Lesson 10.1 超参数优化与枚举网格的理论极限和随机网格搜索 RandomSearchCV