如何从 PHP 调用 R 脚本？

Posted 2023-02-23

【中文标题】如何从 PHP 调用 R 脚本？

【英文标题】：How to call R script from PHP?

【发布时间】：2018-01-22 15:21:49

【问题描述】：

我有一堆 R scripts 进行一些计算并返回结果。我正在计划建立一个 php 网站，用户实际上可以提交一个表单，其中数据被传递到我的 R 脚本，处理然后将结果返回给 PHP 并更新界面。

计划是有一个数据库，所以当用户提交表单时，数据会存储在数据库中，以便 R 可以读取、处理输入，然后将结果插入数据库中，以便 PHP 可以获取它。但是，有两个问题：

我的 R 脚本如何知道某些值已存储在数据库中，以便获取这些值并进行处理？ 当我的 R 脚本处理完数据并插入到 mysql db 时，我如何让 PHP 理解此时 PHP 需要查询数据库并获取值？

假设我的 R 脚本如下所示：

range<-1:20
m<-mean(range)
s<-sum(range)
print(m)
print(s)

如您所见，在这种情况下，输入是1 和20 来定义范围，输出是在我的网页上显示m 和s 的值。

知道如何实现吗？ 谢谢！

【参考方案1】：

shell_exec() 或 exec() 可能是您在 PHP 中的最佳选择。 This answer explains the difference.

echo shell_exec("Rscript my_script.R $_GET['range']");

【讨论】：

那我这里不用mysql数据库了吧？

如果您需要输入在页面加载时保持不变，则将输入存储在数据库中。如果每次调用中都有大量数据，并且您使用数据库作为在语言之间保存数据的一种方式，那么很好（但这在问题中并不清楚）。如果数据只是传递且简短，则没有理由涉及数据库。

感谢您的回复.. 这很有帮助

除非你总是使用escapeshellarg() 来转义用户输入：echo shell_exec("Rscript my_script.R " . escapeshellarg($_GET["range"]));

【参考方案2】：

我不是专家，但已经完成了： /poorman.php

echo "
";
echo "Number values to generate: 
";
echo "Submit";
echo ""
;

if(isset($_GET['N']))

  $N = $_GET['N'];

  // execute R script from shell
  // this will save a plot at temp.png to the filesystem
  exec("Rscript my_rscript.R $N");

  // return image tag
  $nocache = rand();
  echo("");

?>

还有 R 脚本……

my_rscript.R

args <- commandArgs(TRUE)

N <- args[1]
x <- rnorm(N,0,1)

png(filename="temp.png", width=500, height=500)
hist(x, col="lightblue")
dev.off()

source

【讨论】：

基本上，你是在告诉我，我根本不需要数据库？

可以直接执行r脚本，是的。

在源代码中，他们提到一次只能有一个用户使用这个网络应用程序。我知道因为 R 脚本将忙于处理输入。我的脚本如何处理并发请求？

我不确定这个解决方案，但也许每次我们生成一个 R 脚本并且一旦完成我们就删除它？

@Riad re concurrency：我建议尝试一下，看看是否有问题，如果有问题，然后再打开一个不同的问题？ （包括您的代码！）您可能会发现这根本不是问题。