在 docker (tidyverse) 中挂载 R/RStudio 可访问的本地卷

Posted 2023-02-13

【中文标题】在 docker (tidyverse) 中挂载 R/RStudio 可访问的本地卷

【英文标题】：Mount local volume accessible to R/RStudio in docker (tidyverse)在 docker (tidyverse) 中挂载 R/RStudio 可访问的本地卷

【发布时间】：2018-07-04 01:52:13

【相关技术】：@tags@

【问题描述】：

关于如何从 docker 容器中处理本地文件夹，有很多不受欢迎的问题，但我找不到与我的完全匹配的问题，所以这里有另一个问题：

如何运行 docker 容器，并挂载本地文件夹，以便容器内的 R/RStudio 可以访问它？

听起来有点像：mounting local home directory in Rstudio docker?，使用类似的方法，我可以启动一个容器并挂载一个卷：

docker run -d -p 8787:8787 -v $HOME/my_folder:/LOOKATMEEE -e ROOT=TRUE rocker/tidyverse:3.4

如果我在容器中运行 bash shell，我可以看到文件夹：

docker exec -it 38b2d6ca427f bash

> ls
bin   dev  home  lib    LOOKATMEEE  mnt  proc  run   srv  tmp  var  boot  etc  init  lib64  media       opt  root  sbin  sys  usr
#                       ^ there is is!

但是，如果我在localhost:8787 连接到 RStudio 服务器，我不会在文件窗格中看到它，也不会在 R 控制台中运行 list.files() 时显示它：

我确定我缺少一些基本的东西，但如果有人能告诉我那是什么...谢谢！

【问题讨论】：

我认为您只需将工作目录设置为您将文件夹复制到的位置，从外观上看就是setwd('..')

啊哈，谢谢！是的，它实际上是作为子目录安装的两个级别 - 所以setwd('../..') 或 list.files(../..) 会打开它。我正在寻找的是让它显示在默认的工作目录中，但现在很清楚如何做到这一点

您可以将驱动器安装在用户rstudio（运行RStudio的用户）的主目录中：docker run -d -p 8787:8787 -v $HOME/my_folder:/home/rstudio/LOOKATMEEE -e ROOT=TRUE rocker/tidyverse:3.4应该可以工作

@alistaire 如果您想将其发布为答案，我会投赞成票。谢谢

@lorenzo -- 是的，我推断的差不多了，谢谢！

【参考方案1】：

在这种情况下，R 和 RStudio 的默认工作目录为 /home/rstudio，比我告诉 docker 挂载文件夹的 / 低两级。

问题中docker run命令后，可以去list.files('/')查看文件夹。

如果您希望您的文件夹像我一样显示在 R 的默认工作目录中，然后像这样修改 docker run：

docker run -d -p 8787:8787 -v $HOME/my_folder:/home/rstudio/LOOKATMEEE -e ROOT=TRUE rocker/tidyverse:3.4

它应该在那里：

感谢用户alistaire。

【讨论】：

你能写到那个挂载的文件夹 LOOKATMEEE 还是直接读取？

【参考方案2】：

这个答案是给后代的:)

这个概念是来自主机的资源与容器的“匹配”： ：

命令结构应该是这样的：

docker run -d -e PASSWORD= -p 8787:8787 -v : /home/rstudio/ 摇杆/rstudio

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