R中的滑动窗口

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【中文标题】R中的滑动窗口【英文标题】:Sliding window in R 【发布时间】:2013-04-03 07:58:11 【问题描述】:

我有一个数据框 DF,两列 A 和 B 如下所示:

A                    B                  
1                    0             
3                    0               
4                    0                   
2                    1                    
6                    0                    
4                    1                     
7                    1                 
8                    1                     
1                    0   

如下所示执行滑动窗口方法。使用:rollapply(DF$B, width=3,by=1) 计算大小为 3 的滑动窗口中 B 列的平均值滑动 1。每个窗口的平均值显示在左侧。

    A:         1    3    4    2    6    4    7    8    1                                          
    B:         0    0    0    1    0    1    1    1    0                                
              [0    0    0]                                              0
                    [0    0    1]                                        0.33
                          [0    1    0]                                  0.33
                                [1    0    1]                            0.66
                                      [0    1    1]                      0.66
                                            [1    1    1]                1
                                                 [1    1    0]           0.66
output:        0   0.33 0.33 0.66   0.66    1     1    1   0.66

现在,对于 A 列中的每一行/坐标,包含该坐标的所有窗口都被考虑并应保留给出结果的最高平均值,如“输出”列所示。

我需要得到如上所示的输出。输出应该是:

A                   B                  Output   
1                   0                      0
3                   0                      0.33
4                   0                      0.33
2                   1                      0.66
6                   0                      0.66
4                   1                      1
7                   1                      1
8                   1                      1
1                   0                    0.66

对 R 有帮助吗?

【问题讨论】:

(+1) 现在我明白了这个问题。让我试着看看我能不能弄清楚一些事情。还有一件事。我认为您在此编辑中丢失了最终输出“mean_A”。你也可以添加它吗?谢谢。 @Arun 现在我添加了 Mean_A。 A 总是一个序列 1:N?我看不出A 中的值对您的计算有何影响。据我了解,这几乎是rollmax(rollmean(B,3),3) @CarlWitthoft,不完全是。 user1779730,检查我的答案。 @CarlWitthoft,希望重新构建的问题有助于理解问题 【参考方案1】:

试试这个:

# form input data
library(zoo)
B <- c(0, 0, 0, 1, 0, 1, 1, 1, 0)

# calculate
k <- 3
rollapply(B, 2*k-1, function(x) max(rollmean(x, k)), partial = TRUE)

最后一行返回:

[1] 0.0000000 0.3333333 0.3333333 0.6666667 0.6666667 1.0000000 1.0000000
[8] 1.0000000 0.6666667

如果有 NA,您可能想试试这个:

k <- 3
B <- c(1, 0, 1, 0, NA, 1)
rollapply(B, 2*k-1, function(x) max(rollapply(x, k, mean, na.rm = TRUE)), partial = TRUE)

最后一行给出了这个:

[1] 0.6666667 0.6666667 0.6666667 0.5000000 0.5000000 0.5000000

将其扩展为:

c(mean(B[1:3], na.rm = TRUE), ##
max(mean(B[1:3], na.rm = TRUE), mean(B[2:4], na.rm = TRUE)), ##
max(mean(B[1:3], na.rm = TRUE), mean(B[2:4], na.rm = TRUE), mean(B[3:5], na.rm = TRUE)),
max(mean(B[2:4], na.rm = TRUE), mean(B[3:5], na.rm = TRUE), mean(B[4:6], na.rm = TRUE)),
max(mean(B[3:5], na.rm = TRUE), mean(B[4:6], na.rm = TRUE)), ##
mean(B[4:6], na.rm = TRUE)) ##

如果您不想在每一端都有k-1 组件(上面标有##),请删除partial = TRUE

【讨论】:

那里——我知道有人会正确地表达我上面的评论:-) @G.Grothendieck 谢谢。 rollapply 函数中的 5 是什么? @G.Grothendieck 根据什么近似值将宽度设置为 5?这只是一个示例数据。真实数据的窗口大小为 5000,滑动 1。在这种情况下,我们如何确定窗口的宽度? @G.Grothendieck 非常感谢非常简单有效的解决方案。现在看来我们可以模拟任何宽度。还有一个查询,我最初使用 rollapply(DF$B, width=3,by=1) 来计算窗口大小 3 滑动=1 位置的平均值。但是在您的解决方案中,滑动 by='' 参数没有任何意义。我可以假设它以相同的方式滑动 1 个位置来计算平均值吗? 有两个长度为 5 的窗口。由于数量太多,我已经删除了我的 cmets,并在答案末尾添加了一些其他信息。【参考方案2】:

R 库 TTR 有许多用于计算滑动窗口平均值的函数

SMA = 简单移动平均线

data$sma <- SMA(data$B, 3)

更多文档在这里http://cran.r-project.org/web/packages/TTR/TTR.pdf

【讨论】:

以上是关于R中的滑动窗口的主要内容,如果未能解决你的问题,请参考以下文章

R:给定坐标的快速滑动窗口

滑动窗口

R语言计算时间窗口内的统计值(滑动平均滑动最大值滑动中位数滑动计数滑动总和等)实战

R data.table 滑动窗口

滑动窗口(最大最小值)的经典例题

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