foreach (R)：抑制从全局环境加载的包中的消息

Posted 2023-02-22

【中文标题】foreach (R)：抑制从全局环境加载的包中的消息

【英文标题】：foreach (R): suppress Messages from packages loaded from global environment

【发布时间】：2017-01-04 12:00:20

【问题描述】：

我正在使用 .packages = (.packages()) 在我的 foreach 调用中加载在全局环境中加载的几个包。但是，我找不到如何抑制包启动消息。由于它们是为每个分配的核心加载的，因此此列表会变得相当长。 我已经尝试将标准调用（如suppressMessages() 等）包裹在函数调用和.packages 参数周围，但没有成功。

foreach(i = x, .packages = (.packages()))

我在通用函数中使用 foreach 调用，因此它需要适应用户预先加载的任何包。 我可以在 foreach 调用中使用 apply 调用，所有包都加载到全局环境中，但我假设 foreach 需要在其 .packages 参数中加载它？

如果总体上有更好的方法可以做到这一点，请告诉我。

【问题讨论】：

为什么this 没有帮助？

我假设它是因为我在这里没有直接调用library()，但包是用.packages 参数加载的。

在 .packages 的文档中他们写了.packages returns information about package availability. 如果你想加载一个包，为什么不使用require 或library？

(.packages()) 调用返回全局环境中加载的所有包。这些包应由foreach 为每个分配的核心再次显式加载，以避免在使用.packages 参数的函数调用期间出现问题。因此，没有直接的library()call。包因功能用途而异，并且不固定，因此需要交互加载。

【参考方案1】：

这也是一个蹩脚的答案，更多的是一种解决方法。如果你的函数在一个单独的 R 脚本中而不是使用 .packages() 你这样做：

    options( warn = FALSE )
    suppressPackageStartupMessages( library(dplyr) )
    options( warn = FALSE )

调用库时在函数文件中。这将关闭您的包裹的警告并在之后重新打开它们。如果有一个选项，那就太好了。

【参考方案2】：

我有一个蹩脚的半答案：当您创建集群时，您可以指定 outfile = '/dev/null' 以使工作节点的所有输出静音。问题是，这会阻止您从节点打印任何其他内容...

作为一种解决方法，我按照所述将节点静音，但使用progress bar 至少向用户提供一些信息，尽管不详细。