在 R 中的函数中保存

Posted 2023-05-07

【中文标题】在 R 中的函数中保存

【英文标题】：Saving within a function in R

【发布时间】：2015-01-27 17:34:50

【问题描述】：

我在 R 中创建了这个函数，但是应该保存在目录中的输出不是预期的。 当我打印 i 变量时，它的值始终为 1，因此我保存的文件的名称始终是我在向量第一个位置上的名称。

function_filtering <- function(x)

upname <- c("up_toptable_alk.Rda", "up_toptable_kcbc1.Rda",   "up_toptable_kwt.Rda", "up_toptable_NaHog1.Rda", "up_toptable_Nawt.Rda","up_toptable_ox.Rda", "up_toptable_ter.Rda", "up_toptable_ypd.Rda")
downname <- c("down_toptable_alk.Rda", "down_toptable_kcbc1.Rda", "down_toptable_kwt.Rda", "down_toptable_NaHog1.Rda", "down_toptable_Nawt.Rda", "down_toptable_ox.Rda", "down_toptable_ter.Rda", "down_toptable_ypd.Rda")

p.value.cut <- which(x$P.Value < 0.05)
x <- x[p.value.cut,]    

up <- which(x$t > 0)
down <- which(x$t < 0)

up.p.value <- x[up,]
down.p.value <- x[down,]


save(up.p.value, file = upname[i])
save(down.p.value, file = downname[i])


i <- i + 1
print(i)



lapply(data, function_filtering)

谢谢。

【问题讨论】：

我看不到您最初在函数中分配i 的位置。您是否期望data 中的每个对象都有不同的i 值？如果是这样，您可能需要查看 seq_along(data) ，并将数据对象作为另一个参数传递给您的函数。

应该在函数的开头。我没有把它放在这里，但它在原始代码上。 i = 1

问题是i 仅在本地更改为函数function_filtering，因此赋值i <- i + 1 不会影响i 的全局值。要进行全局分配，请使用i <<- i + 1；也就是说，这个实现非常笨拙，最好在一个循环中执行此操作（例如，循环遍历 x 值的向量的值）。

【参考方案1】：

如果没有可重现的示例，我无法解决您的确切问题。但我认为这就是你的目标。

data <- c('a', 'b', 'c', 'd') 
toy <- function(x, d)  
    # x is the integer from seq_along
    # d is the data you want to subset
    paste(x, d[x], sep='_')

# Then use lapply to run the function on each element of data
# extra arguments can be passed in at the end 
lapply(seq_along(data), toy, d=data)

输出是

[[1]]
[1] "1_a"

[[2]]
[1] "2_b"

[[3]]
[1] "3_c"

[[4]]
[1] "4_d"