将文本文件转换为数据框 R
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【中文标题】将文本文件转换为数据框 R【英文标题】:Converting text file to data frame R 【发布时间】:2015-09-23 22:37:51 【问题描述】:我知道这里有人问过类似的问题,但我仍然相信我的任务更复杂。
我有一个文本文件,其中包含来自项目 geonames.org 的信息,名为 MX.txt,其中数据排列如下:
MX 20158 Villas del Cobano Aguascalientes AGU Aguascalientes
001 Aguascalientes 01 21.8495 -102.3052 1
MX 20158 Hacienda el Cobano Aguascalientes AGU Aguascalientes
001 Aguascalientes 01 21.8495 -102.3052 1
MX 20159 Alianza Ferrocarrilera Aguascalientes AGU Aguascalientes
001 Aguascalientes 01 21.8495 -102.3052 1
MX 20159 Bosques del Prado Oriente Aguascalientes AGU Aguascalientes
001 Aguascalientes 01 21.8495 -102.3052 1
MX 20160 Francisco Guel Jimenez Aguascalientes AGU Aguascalientes
001 Aguascalientes 01 21.7561 -102.305 1
MX 20160 Las Viñas INFONAVIT Aguascalientes AGU Aguascalientes
001 Aguascalientes 01 21.7561 -102.305 1
MX 20164 Santa Anita 4a Sección Aguascalientes AGU Aguascalientes
001 Aguascalientes 01 21.7561 -102.305 1
文件持续了几千行。
我想把它变成一个包含 12 个变量的数据框,其中像“Villas del Cobano”这样的字符串只是这样的一个条目:
V1 V2 V3 V4 V5 V6
MX 20158 Villas del Cobano Aguascalientes AGU Aguascalientes
V7 V8 V9 V10 V11 V12
001 Aguascalientes 01 21.8495 -102.3052 1
V1 V2 V3 V4 V5 V6
MX 20158 Hacienda el Cobano Aguascalientes AGU Aguascalientes
V7 V8 V9 V10 V11 V12
001 Aguascalientes 01 21.8495 -102.3052 1
我已经尝试过之前发布的答案,例如: Converting text file into data frame in R , converting multiple lines of text into a data frame
因为英语不是我的第一语言,如果我的问题不够清楚,我想通过评论部分回答问题,而不是得到否定标记。
提前致谢!
【问题讨论】:
这可能是一个愚蠢的问题,但您是否尝试过read.table()
和sep = "\t"
?您能展示一下您尝试过的代码以及最终结果吗?
感谢您的快速回复!不,实际上我没有,当我不小心删除了除第一行之外的所有文件时,它似乎可以正常工作
现在它说:“扫描错误(文件,内容,nmax,sep,dec,quote,skip,nlines,na.strings,:第 67894 行没有 12 个元素”
刚刚编辑了这样一行,效果很好你想把这个写成答案,这样我就可以把它标记为已回答? @LJW
刚刚回到这个问题 - 看起来你在下面有一些很好的答案,所以我不会重复。很高兴你成功了!
【参考方案1】:
列之间的分隔符是制表符,然后用
data <- read.table(file="MX.txt", sep="\t", quote="", comment.char="")
地名数据存在问题。有时他们在地名中使用#
。默认情况下,read.table
读作注释会丢弃该行的其余部分,因此您需要设置 comment.char=""
。
【讨论】:
【参考方案2】:我提出了一个冗长的解决方案,可能会得到你想要的。简而言之,我使用从每个嵌套列表的开始和结束的已知距离来隔离“多部分名称”,将其连接起来,并将其作为列输入到其他数据中。
函数 splitAt 来自R split numeric vector at position。
#Support functions
splitAt <- function(x, pos) unname(split(x, cumsum(seq_along(x) %in% pos)))
extractplace <- function(x)
len <- length(x)
place0 <- x[-1*c(1:2,(len-8):len)]
place <- paste(place0, collapse=" ")
extractother <- function(x)
len <- length(x)
other <- x[c(1:2,(len-8):len)]
#initital data processing
elems <- scan(file="mx.txt", what="list") #creates a vector of all elements in your txt file
inds <- grep(pattern="MX", elems) #finds indices of "MX", which starts every nested list
lists <- splitAt(elems, inds) #creates a list of nested list
#create the matrix you want
placevector <- sapply(lists, function(x) extractplace(x)) #vector of multipart names
othermatrix <- t(sapply(lists, function(x) extractother(x))) #matrix of remaining data
fullmatrix <- cbind(othermatrix[,1:2],placevector,othermatrix[,3:11]) #inserts multipart names in matrix
colnames(fullmatrix) <- paste("V",1:12, sep="")
fullmatrix
【讨论】:
对不起,反馈迟了,第一个答案实际上解决了我的问题,但你的问题是一个非常有趣/逻辑的解决方案。谢谢你!【参考方案3】:这假设其余数据看起来像这个数据。我不得不做很多清洁工作(即gsub
ing):
代码:
vect <- unlist(Map(function(x, y) paste(x, y), dat[c(T, F)], dat[c(F, T)]),
use.names = FALSE)
read.table(text=gsub("\\s2,", ", ", gsub("(\\s)(\\d2,)", " \\2",
gsub("(\\d2,|[A-Z]+)\\s+", "\\1 ", vect))), sep=",")
便于阅读的数据:
dat <- readLines(n=14)
MX 20158 Villas del Cobano Aguascalientes AGU Aguascalientes
001 Aguascalientes 01 21.8495 -102.3052 1
MX 20158 Hacienda el Cobano Aguascalientes AGU Aguascalientes
001 Aguascalientes 01 21.8495 -102.3052 1
MX 20159 Alianza Ferrocarrilera Aguascalientes AGU Aguascalientes
001 Aguascalientes 01 21.8495 -102.3052 1
MX 20159 Bosques del Prado Oriente Aguascalientes AGU Aguascalientes
001 Aguascalientes 01 21.8495 -102.3052 1
MX 20160 Francisco Guel Jimenez Aguascalientes AGU Aguascalientes
001 Aguascalientes 01 21.7561 -102.305 1
MX 20160 Las Viñas INFONAVIT Aguascalientes AGU Aguascalientes
001 Aguascalientes 01 21.7561 -102.305 1
MX 20164 Santa Anita 4a Sección Aguascalientes AGU Aguascalientes
001 Aguascalientes 01 21.7561 -102.305 1
【讨论】:
以上是关于将文本文件转换为数据框 R的主要内容,如果未能解决你的问题,请参考以下文章