如何跨 EMR 集群中的节点运行 python 代码
Posted
技术标签:
【中文标题】如何跨 EMR 集群中的节点运行 python 代码【英文标题】:How to run python code across nodes in an EMR cluster 【发布时间】:2018-09-09 17:27:38 【问题描述】:我有一个 Amazon EMR 集群 - 30 个节点 我的 Python 代码如下所示 -
spark = SparkSession \
.builder \
.appName("App") \
.config(conf=sparkConf) \
.getOrCreate()
def fetchCatData(cat, tableName):
df_gl = spark.sql("select * from where category = ".format(tableName, cat))
df_pandas = df_gl.select("*").toPandas()
df_pandas.to_csv("/tmp/split/_.csv".format(tableName, cat))
catList = [14, 15, 63, 65, 74, 21, 23, 60, 79, 86, 107, 147, 196, 199, 200, 201, 229, 263, 265, 267, 328, 421, 468, 469,504]
tableList = ["Table1","Table2"
,"Table3",
"Table4", "Table5", "Table6",
"Table7"
]
def main(args):
log4jLogger = spark._jvm.org.apache.log4j
LOGGER = log4jLogger.LogManager.getLogger(__name__)
for table in tableList:
LOGGER.info("Starting Split for ".format(table))
dataLocation = "s3://test/APP/".format( table)
df = spark.read.parquet(dataLocation)
df = df.repartition("CATEGORY").cache()
df.createOrReplaceTempView(table)
for cat in catList:
fetchGLData(cat, table)
我想解决以下问题-
-
基本上我想读取我的镶木地板数据,将其按类别划分并将其作为 pandas 数据框存储在 csv 中。
目前我正在按顺序运行,我想在 EMR 中的一个节点上运行每个类别并行运行它
我尝试使用多处理,但对结果不满意。
在最短的时间内解决这个问题的最佳方法是什么?
【问题讨论】:
【参考方案1】:不确定为什么要转换为 pandas 数据帧,但使用从 spark sql 创建的 spark 数据帧,您可以直接写入 csv。
但是,如果您希望将 csv 作为一个文件,则需要重新分区为 1,这不会使用所有节点。如果您不关心它生成多少文件,那么您可以重新分区数据帧以包含更多分区。然后每个分区将被节点处理并输出,直到所有分区都完成。
单个文件不使用所有节点(注意 .csv 将是包含实际 csv 的文件夹)
df_gl = spark.sql("select * from where category = ".format(tableName, cat))
df_gl.repartition(1).write.mode("overwrite").csv("/tmp/split/_.csv".format(tableName, cat))
使用多个节点进行并行处理并输出为多个拆分文件(注意 .csv 将是包含实际 csv 的文件夹)
df_gl = spark.sql("select * from where category = ".format(tableName, cat)).repartition(10)
df_gl.write.mode("overwrite").csv("/tmp/split/_.csv".format(tableName, cat))
【讨论】:
我写回 csv 是因为,我需要将所有这些作为单独的 pandas 数据帧读取并对其进行一些处理。如果我写入 csv,我无法在其上构建 pandas 数据框。以上是关于如何跨 EMR 集群中的节点运行 python 代码的主要内容,如果未能解决你的问题,请参考以下文章
如何跨 Slurm 集群上的多个节点运行 MPI Python 脚本?错误:警告:无法在 2 个节点上运行 1 个进程,将 nnodes 设置为 1
寻找有关如何使用 python 启动 AWS EMR 集群以运行 pyspark 步骤的示例