将火花管道转换为数据框
Posted
技术标签:
【中文标题】将火花管道转换为数据框【英文标题】:Convert spark pipeline to dataframe 【发布时间】:2018-11-13 22:10:20 【问题描述】:Spark Pipeline 框架允许以可重现的方式为机器学习或其他应用程序创建转换管道。但是,在创建数据框时,我希望能够进行探索性分析。
就我而言,我有大约 100 列,其中 80 列是字符串,需要进行一次热编码:
from pyspark.ml.feature import OneHotEncoderEstimator, StringIndexer,VectorAssembler
from pyspark.ml import Pipeline
from pyspark.ml.classification import LogisticRegression
from pyspark.ml.classification import LogisticRegressionModel
#cols_to_one_hot_encode_2 is a list of columns that need to be one hot encoded
#cols_to_keep_as_is are columns that are **note** one hot encoded
cols_to_one_hot_encode_3=[i+"_hot" for i in cols_to_one_hot_encode_2]
encoder= OneHotEncoderEstimator(inputCols=cols_to_one_hot_encode_2,
outputCols=cols_to_one_hot_encode_3,dropLast=False)
#assemble pipeline
vectorAssembler = VectorAssembler().setInputCols(cols_to_keep_as_is+cols_to_one_hot_encode_3).setOutputCol("features")
all_stages=indexers
all_stages.append(encoder)
all_stages.append(vectorAssembler)
transformationPipeline=Pipeline(stages=all_stages)
fittedPipeline=transformationPipeline.fit(df_3)
dataset = fittedPipeline.transform(df_3)
#now pass to logistic regression
selectedcols = ["response_variable","features"] #+df_3.columns
dataset_2= dataset.select(selectedcols)
# Create initial LogisticRegression model
lr = LogisticRegression(labelCol="response_variable", featuresCol="features", maxIter=10,elasticNetParam=1)
# Train model with Training Data
lrModel = lr.fit(dataset_2)
当我查看 dataset_2 display(dataset_2)
时,它会打印:
response_variable features
0 [0,6508,[1,4,53,155,166,186,205,242,2104,6225,6498],[8220,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1]]
0 [0,6508,[1,3,53,155,165,185,207,243,2104,6225,6498],[8220,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1]]
0 [0,6508,[1,2,53,158,170,185,206,241,2104,6225,6498],[8222,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1]]
0 [0,6508,[1,3,53,156,168,185,205,240,2104,6225,6498],[8222,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1]]
0 [0,6508,[1,2,53,155,166,185,205,240,2104,6225,6498],[8223,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1]]
这对于进行特征探索完全没用。请注意,one-hot 编码器已将我的特征从大约 100 列爆炸到 6508 列。
我的问题
如何查看由管道在后台创建的数据框? 这应该是一个具有 6058 个特征和相应行数的数据框,例如: 例如,我想要这样的东西:
response_variable feature_1_hot_1 feature_1_hot_2 feature_1_hot_3 ... (6505 more columns)
0 1 1 0
etc.
不是重复的
不与How to split Vector into columns - using PySpark 重复 那就是询问如何基于分隔符进行文字字符串拆分。管道完成的转换不是简单的字符串拆分。见Using Spark ML Pipelines just for Transformations
【问题讨论】:
为什么投反对票? How to split Vector into columns - using PySpark的可能重复 修改解释为什么不复制 【参考方案1】:如何查看由管道在后台创建的数据框?
没有这样的隐藏结构。 Spark ML Pipelines
围绕 VectorUDT
列和元数据构建以丰富结构。没有包含扩展列的中间结构,如果在哪里,它将无法扩展(Spark 不处理将在此处生成的宽而密集的数据,并且当列数达到数万时查询计划程序会窒息)给定当前的实现。
Splitting the columns 和 analyzing the metadata 是您最好的也是唯一的选择。
【讨论】:
那么没有办法创建这样的数据框吗?我觉得这很难相信。以上是关于将火花管道转换为数据框的主要内容,如果未能解决你的问题,请参考以下文章