Fortran Mex 文件 - 传回 Matlab 的值不正确
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【中文标题】Fortran Mex 文件 - 传回 Matlab 的值不正确【英文标题】:Fortran Mex File - Incorrect Values Passed Back to Matlab 【发布时间】:2014-03-11 01:31:35 【问题描述】:我在 Fortran 中编写了一个子例程来处理我的代码的计算密集型部分。我想使用 mex 函数将它链接到 Matlab。这是给出相关错误的最简单版本。首先,这是 mex 函数。
#include <fintrf.h>
!======================================================================
#if 0
!
! example.F90
! .F90 file needs to be preprocessed to generate .for equivalent
!
#endif
!======================================================================
! Matlab command
! deltaHat = example(z)
!----------------------------------------------------------------------
! Gateway routine
SUBROUTINE mexFunction(nlhs, plhs, nrhs, prhs)
IMPLICIT NONE
! mexFunction arguments:
MWPOINTER :: plhs(*), prhs(*)
INTEGER :: nlhs, nrhs
! Function declarations:
mwPointer :: mxGetPr
mwPointer :: mxCreateDoubleMatrix
mwSize :: mxGetM, mxGetN
! Pointers to input/output mxArrays:
mwPointer :: deltaHat
mwPointer :: z
! Array information:
mwSize :: N
!------------------------------------------------------------------------
! Get the size of the input array.
N = mxGetN(prhs(1))
! Create Fortran arrays from the input argument.
z = mxGetPr(prhs(1))
! Create matrix for the return argument.
plhs(1) = mxCreateDoubleMatrix(1,24,0)
deltaHat = mxGetPr(plhs(1))
! Call the computational subroutine.
CALL example(%val(deltaHat), %val(z), N)
END SUBROUTINE
!-----------------------------------------------------------------------
! Computational routine for contraction mapping
SUBROUTINE example(deltaHat, z, N)
IMPLICIT NONE
INTEGER, PARAMETER :: dble = selected_real_kind(15)
INTEGER, PARAMETER :: J = 24
! Type delcarations for inputs
mwSize :: N
REAL(KIND=dble), DIMENSION(1,J-1), INTENT(OUT) :: deltaHat
REAL(KIND=dble), DIMENSION(N,1), INTENT(IN) :: z
! Declare local variables
REAL(KIND=dble), DIMENSION(N,J) :: num
num(:,1) = z(:,1)
DO i = 1,J-1
deltaHat(1,i) = num(i,1)
END DO
END SUBROUTINE
然后我使用“mex example.F90”在 Matlab 中编译 mex 函数。那里没有问题。现在这是 Matlab 代码和输出。
clear all;
N = 1000;
J = 25;
% Generate covariates-----------------------------------------------------
% Reset random number generators
rng('default');
% Create indicators for parameter heterogeneity
z = randi(2,N,1);
z = z-ones(N,1);
deltaHat = example(z);
>> sum(deltaHat' - z(1:J-1))
ans =
-15
>> deltaHat
deltaHat =
Columns 1 through 11
1.0000 0.0000 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000
Columns 12 through 22
0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000
Columns 23 through 24
0.0000 0.0000
>> z(1:J-1)
ans =
1
1
0
1
1
0
0
1
1
1
0
1
1
0
1
0
0
1
1
1
1
0
1
1
sum(deltaHat' - z(1:J-1)) 项应该为零,因为 deltaHat 和 z(1:J-1) 应该是同一个向量。我还在上面打印了这些向量,以防我丢失了变量类型定义(尽管我已经检查过两者都是双精度的)。显然,数据没有正确地传递给 Fortran 并返回。但是,如果我在 mex 文件中进行以下调整
...
DO i = 1,J-1
deltaHat(1,i) = z(i,1)
END DO
...
然后我得到正确的答案。这是相应的 Matlab 输出。
...
>> sum(deltaHat' - z(1:J-1))
ans =
0
...
所以在这种情况下,数据正在从 Matlab 传递到 Fortran 子例程并正确返回。问题似乎在于将 z 分配给 mex 文件中的局部变量 num 。跳过这一步给出正确答案。
【问题讨论】:
您能否提供一个最小的示例代码来显示您在 MATLAB 方面的问题?此外,最好删除与问题无关的所有代码(如 while 循环中注释掉的代码)。展示您的问题的最小但可构建的示例是快速获得答案的最佳方式。 嘿彼得,我已经编辑了我的帖子以使其尽可能简单并且仍然显示错误。感谢您的评论!我觉得现在清楚多了。 z = randi(2,N,1) 在 1,2 中生成随机整数。我希望它们在 0,1 中,所以我只是从 z 中减去一个向量,即 z = z-ones(N,1)。 你试过了吗? dble = selected_real_kind(8) 【参考方案1】:N
传递给 SUBROUTINE example
是 1。因此,当您分配 deltaHat(1,2) = z(2,1)
时,您正在触及数组 z
的边界
将行 n = mxGetN(prhs(1))
更改为 n = mxGetM(prhs(1))
你应该学习如何debug your MEX functions,这样你就可以轻松地修复这种琐碎的错误。
【讨论】:
如果它解决了您的问题,请不要忘记接受答案以上是关于Fortran Mex 文件 - 传回 Matlab 的值不正确的主要内容,如果未能解决你的问题,请参考以下文章
用于 Fortran 的 mex 网关中 REAL 变量的可移植声明