是否可以在pypy下安装scipy？

Posted 2023-04-14

【中文标题】是否可以在pypy下安装scipy？

【英文标题】：Is it possible to install scipy under pypy?

【发布时间】：2016-04-16 05:58:21

【问题描述】：

我用pypy创建了一个virtualenv并尝试安装scipy，但安装结束时出现以下错误：

distutils.errors.DistutilsError：安装脚本退出并出现错误：命令“cc -O2 -fPIC -Wimplicit -O2 -fPIC -Wimplicit -O2 -fPIC -Wimplicit -DHAVE_NPY_CONFIG_H=1 -D_FILE_OFFSET_BITS=64 -D_LARGEFILE_SOURCE=1 -D_LARGEFILE64_SOURCE =1 -DNO_ATLAS_INFO=1 -DHAVE_CBLAS -Ibuild/src.linux-x86_64-3.2/numpy/core/src/private -Inumpy/core/include -Ibuild/src.linux-x86_64-3.2/numpy/core/include/numpy -Inumpy/core/src/private -Inumpy/core/src -Inumpy/core -Inumpy/core/src/npymath -Inumpy/core/src/multiarray -Inumpy/core/src/umath -Inumpy/core/src/npysort -I/home/luke/Programowanie/Python/connect4/venv-pypy/include -Ibuild/src.linux-x86_64-3.2/numpy/core/src/private -Ibuild/src.linux-x86_64-3.2/numpy/core /src/private -Ibuild/src.linux-x86_64-3.2/numpy/core/src/private -c numpy/core/src/multiarray/scalarapi.c -o build/temp.linux-x86_64-3.2/numpy/core /src/multiarray/scalarapi.o" 失败，退出状态为 1

有一个特定的numpy version suited for pypy，但我发现的关于 scipy 的唯一内容是一个旧的call for donations。从那以后有什么变化吗？

【问题讨论】：

scipy 已编译代码，就像 numpy 一样。所以即使你有一个 PyPy numpy 工作（它完全兼容吗？），这并不意味着你可以在它上面安装常规的scipy。如果您没有找到 PyPy scipy，则无法添加它。但请记住，scipy 是松散连接包的集合。

募捐呼吁是针对numpy proposal。该提案明确排除了scipy。换句话说，没有人正式开发scipy 版本。

@hpaulj 他们在文中稍后提到了 scipy：“具体来说，我们不打算（...）实现其他科学库，如 SciPy、matplotlib 或 biopython”

【参考方案1】：

是的，有可能，从Scipy 1.1.0 开始。然而，需要足够新的 PyPy (>= 6.0.0) 和 Numpy，numpy>= 1.14.3，最好在发布时 numpy>=1.15.0。安装可以通过通常的方式完成

pypy3 -mpip install numpy
pypy3 -mpip install scipy

假设你已经安装了 BLAS/LAPACK，所以首先你应该确保你能够从源代码在普通 Python 上安装 numpy/scipy。

可能没有人尝试过这是否适用于 Windows 上的 Pypy，所以你只能靠自己。它也可能不适用于 NumPyPy --- 你需要香草 Numpy。

其他答案说“不”，因为那是 2018 年 5 月之前的情况。

【讨论】：

从今天开始，您还必须安装 pybind11；但是，事情仍然因 pybind 错误而中断：/usr/local/include/detail/common.h:134:19: fatal error: cstddef: No such file or directory。

【参考方案2】：

没有。 SciPy 有与 cpython 的 C API 对话的点点滴滴，而 pypy 不支持。

编辑：截至 2018 年 5 月，这是不正确的，并且 scipy 与 pypy 兼容。请参阅@pv 的答案。了解详情。

【讨论】：

自 scipy 1.1.0 以来不再适用。见光伏。评论。

现在，我认为这个答案应该被删除。也许你可以添加一个它不起作用的 pypy 版本？

【参考方案3】：

似乎@piv.s 好答案中的链接不再包含所需的内容。 用于安装 BLAS/LAPACK 并避免在 Ubuntu 首次运行时出现 NotFoundError: no lapack/blas resources found 等安装错误：

sudo apt-get install libatlas-base-dev

然后使用与您的pypy（不是系统的）对应的pip：

pip install numpy
pip install scipy

或 piv 提到的那个。会成功的。

【参考方案4】：

不，但奇迹般地，matplotlib 恰好与 pypy 一起工作，无论是在 jupyter notebook 还是作为 standalone version（通过 wx 小部件）。

所以 并非不可能。

【参考方案5】：

在撰写本文时，numpy 和 scipy 可以通过 pip 与 PyPy 一起安装，但有一个问题：如果您要在 virtualenv 中运行它（您可能应该这样做），请记住使用“-- always-copy”，否则 virtualenv 将为“include”目录创建一个符号链接，使其对用户只读，这将破坏 pybind11 的安装（这是 scipy 的依赖项）。