如何更改pyspark中的列元数据?
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【中文标题】如何更改pyspark中的列元数据?【英文标题】:How to change column metadata in pyspark? 【发布时间】:2017-05-30 22:47:48 【问题描述】:如何在 PySpark 中更新列元数据? 我有与分类(字符串)特征的标称编码相对应的元数据值,我想以自动方式将它们解码回来。除非您重新创建架构,否则无法直接在 pyspark API 中写入元数据。如果提供完整的模式描述(如here 所述),是否可以在不将数据集转换为 RDD 并将其转换回来的情况下随时随地在 PySpark 中编辑元数据?
示例列表:
# Create DF
df.show()
# +---+-------------+
# | id| features|
# +---+-------------+
# | 0|[1.0,1.0,4.0]|
# | 1|[2.0,2.0,4.0]|
# +---+-------------+
# - That one has all the necessary metadata about what is encoded in feature column
# Slice one feature out
df = VectorSlicer(inputCol='features', outputCol='categoryIndex', indices=[1]).transform(df)
df = df.drop('features')
# +---+-------------+
# | id|categoryIndex|
# +---+-------------+
# | 0| [1.0]|
# | 1| [2.0]|
# +---+-------------+
# categoryIndex now carries metadata about singular array with encoding
# Get rid of the singular array
udf = UserDefinedFunction(lambda x: float(x[0]), returnType=DoubleType())
df2 = df.select(*[udf(column).alias(column) if column == 'categoryIndex' else column for column in df.columns])
# +---+-------------+
# | id|categoryIndex|
# +---+-------------+
# | 0| 1.0|
# | 1| 2.0|
# +---+-------------+
# - Metadata is lost for that one
# Write metadata
extract = ...
df2.schema.fields[1].metadata = extract(df.schema.fields[1].metadata)
# metadata is readable from df2.schema.fields[1].metadata but is not affective.
# Saving and restoring df from parque destroys the change
# Decode categorical
df = IndexToString(inputCol="categoryIndex", outputCol="category").transform(df)
# ERROR. Was supposed to decode the categorical values
Question 提供了有关如何使用 VectorAssembler、VectorIndexer 以及如何通过使用 StructType 构建完整架构来添加元数据的见解,但没有回答我的问题。
【问题讨论】:
【参考方案1】:在这两种情况下都会丢失元数据:
当您调用 Pythonudf
时,输入 Column
及其元数据和输出 Column
之间没有关系。 UserDefinedFunction
(在 Python 和 Scala 中)是 Spark 引擎的黑匣子。
将数据直接分配给 Python 模式对象:
df2.schema.fields[1].metadata = extract(df.schema.fields[1].metadata)
根本不是有效的方法。 Spark DataFrame
是围绕 JVM 对象的事物包装器。 Python 包装器中的任何更改对于 JVM 后端都是完全不透明的,并且根本不会传播:
import json
df = spark.createDataFrame([(1, "foo")], ("k", "v"))
df.schema[-1].metadata = "foo": "bar"
json.loads(df._jdf.schema().json())
## 'fields': ['metadata': , 'name': 'k', 'nullable': True, 'type': 'long',
## 'metadata': , 'name': 'v', 'nullable': True, 'type': 'string'],
## 'type': 'struct'
甚至保存在 Python 中:
df.select("*").schema[-1].metadata
##
使用 Spark ,您可以使用小型包装器(取自 Spark Gotchas,由我和 @eliasah 维护):
def withMeta(self, alias, meta):
sc = SparkContext._active_spark_context
jmeta = sc._gateway.jvm.org.apache.spark.sql.types.Metadata
return Column(getattr(self._jc, "as")(alias, jmeta.fromJson(json.dumps(meta))))
df.withColumn("foo", withMeta(col("foo"), "", ...))
使用 Spark >= 2.2,您可以使用 Column.alias
:
df.withColumn("foo", col("foo").alias("", metadata=...))
【讨论】:
在 spark 2.2 而不是df.withColumn("foo", col("foo").alias("", metadata=...))
中应该是 df.withColumn("foo", col("foo").as("", metadata=...))
?参考:spark.apache.org/docs/2.2.0/api/java/org/apache/spark/sql/…
@Sigrist 这些是 Java 文档。在 Python 中使用 as
是一个关键字。以上是关于如何更改pyspark中的列元数据?的主要内容,如果未能解决你的问题,请参考以下文章
更改 DataFrame 中的列数据类型并将其传递到 UDF - PySpark