使用 RPostgreSQL 和 dplyr 将 R 连接到 Redshift 的理论是啥
Posted
技术标签:
【中文标题】使用 RPostgreSQL 和 dplyr 将 R 连接到 Redshift 的理论是啥【英文标题】:what is the theory of connecting R to Redshift using RPostgreSQL and dplyr使用 RPostgreSQL 和 dplyr 将 R 连接到 Redshift 的理论是什么 【发布时间】:2016-10-11 22:45:47 【问题描述】:我只知道如何使用 RPostgreSQL 和 dplyr 将 R 连接到 Redshift。但我对几件事感到困惑:
-
当我想在屏幕上显示某些内容时,例如 head(a),其中 a 是从 Redshift 检索的结果,它会非常慢。但是,如果我只选择了几个字段,比如说只有 4 列,那么它会快得多。那么 R 是如何连接 Redshift 的呢?
如果我想使用一些模型,例如随机森林或广义线性模型,是否需要使用 as.data.frame 将结果传输到本地计算机上的数据框?我试过了。在使用 ggplot2 绘制图表之前,我必须这样做。
【问题讨论】:
【参考方案1】:你读过dplyr vignette on databases吗?你真的应该阅读更多细节。
您似乎混淆了 R 与数据库和代码执行之间的连接。连接允许 R 和数据库之间进行通信 - R 可以将 SQL 查询发送到 db,而 db 可以将结果发回。仅此而已。
dplyr
尝试将一些 R 代码转换为 SQL 代码,以便 SQL 可以在数据库上执行,您无需自己编写 SQL 即可获得结果。正如小插图所解释的,很少有 R 命令可以翻译。主要的dplyr
动词起作用,即select
、mutate
(虽然没有用于 SQLite 的分组数据帧,但它在 postgres 中可用)、group_by
、summarize
、arrange
、filter
.还有基本的数学函数(引自小插图):
基本数学运算符:+, -, *, /, %%, ^
数学函数:abs, acos, acosh, asin, asinh, atan, atan2, atanh, ceiling, cos, cosh, cot, coth, exp, floor, log, log10, round, sign, sin, sinh, sqrt, tan, tanh
逻辑比较:<, <=, !=, >=, >, ==, %in%
布尔运算:&, &&, |, ||, !, xor
基本聚合:mean, sum, min, max, sd, var
除此之外,您将把数据拉入 R 并在其上运行 R 命令。对于不在列表中的head()
,您可能正在将整个表拉入 R,然后查看前 6 行。
对于 Redshift,这对于宽表来说会特别慢 - Redshift 使用列式存储,因此仅提取您需要的列具有强大的性能优势。
另外,正如小插图中所解释的,dplyr
将尽可能推迟 SQL 评估,从而提高效率。将结果带到 R 的预期方法是 collect
,但您的 as_data_frame
听起来也很有效。
【讨论】:
非常感谢!我刚开始学习这个。我什至不知道这个文件head()
只会从数据库中拉下 6 行。以上是关于使用 RPostgreSQL 和 dplyr 将 R 连接到 Redshift 的理论是啥的主要内容,如果未能解决你的问题,请参考以下文章
R 在使用 dplyr 或 RPostgreSQL 的模式下访问 redshift 表
将 RpostgreSQL 与 sqldf 一起使用会使 R 崩溃
如何使用 libssl 和 libpg 和 SSL 激活编译 RpostgreSQL