如何解决python包的静态TLS块错误中无法分配内存

Posted 2023-03-29

【中文标题】如何解决python包的静态TLS块错误中无法分配内存

【英文标题】：how to solve cannot allocate memory in static TLS block error for python packages

【发布时间】：2021-09-12 09:24:26

【问题描述】：

我正在使用 ubuntu 20.04 和 conda 4.8.3。我已经使用pip (pip install --force-reinstall --no-cache-dir gmsh-dev) 在我的一个环境中安装了一个包，但是当我尝试在 jupyter 笔记本中导入包时，我遇到了以下错误：

OSError: /home/alid/miniconda3/envs/new_env/lib/python3.9/site-packages/gmsh-git-Linux64-sdk/lib/libgmsh.so: cannot allocate memory in static TLS block

我不知道我的问题是什么，感谢任何帮助。

【参考方案1】：

基于how others solved similar problems，尝试添加到LD_PRELOAD。

## set the env var for "new_env" environment
conda env config vars set -n new_env LD_PRELOAD='/home/alid/miniconda3/envs/new_env/lib/python3.9/site-packages/gmsh-git-Linux64-sdk/lib/libgmsh.so'

## test importing
conda run -n new_env python -c "import gmsh"

见the documentation on managing environment variables in Conda envs。

【讨论】：

亲爱的@merv，首先，非常感谢您花时间解决我的问题。我尝试了您的第一行代码，然后当我在终端中运行 jupyter notebook 时遇到以下错误：/home/alid/miniconda3/envs/new_env/bin/python: /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libstdc++.so.6: version GLIBCXX_3.4.26' not found (required by /home/alid/miniconda3/envs/new_env/lib/ python3.9/site-packages/gmsh-git-Linux64-sdk/lib/libgmsh.so)`.

@Ali_d 似乎是一个新问题，值得提出一个新问题